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[Biologie Moléculaire] comment on fait pour commander des primers pour technique SSRs

[Biologie Moléculaire] comment on fait pour commander des primers pour technique SSRs.   [...] et ben voila j'ai des primers bien specifique pour une recherche de polymorphimes chez le medicago truncatula et j'aimerais comment ont fait pour les conmmander et le prix par unité ou par paire d'amorces merci d'avance.  [...]

[Génétique] Adn et arn

Oui effectivement ce schéma est un peu bizarre, le brin retardé est reconnu par le fait que ce soit de petit fragments d'ADN en discontinu (et donc comporte plusieurs amorces), alors que le brin avancé est en continu et ne comporte aucune discontinuité (et donc comporte une seul amorce).  [...] Pour les deux brins, que ce soit le brin avancé et le brin retardé, il y a sunthèse d'une amorce d'ARN et c'est la primase qui synthétise ces amorces, et c'est l'ADN polymérase qui synthétise les deux brins (retardé et avancé) et qui a besoin d'une amorce pour fonctionnée (Toutes les ADN polymérases synthétisent l'ADN dans le sens 5'-3', chez tous les organismes vivants, et aucune n'est capable de commencer une nouvelle chaîne sans amorces.  [...]

[Evolution] Variations sur un thème de synthétase...

Q.1. Quelle stratégie devez-vous employer pour choisir les amorces spécifiques des deux gènes ( E. coli et S. pneumoniae ) (On s'intéresse aux gènes d'une sous-unité de la Glu-amidotransférase = gatB et de la GlnRS).  [...] Why not, en effet Mais pour s'avancer dans cette voie, je devrais disposer d'un arbre enraciné... Ce qui n'est pas le cas. Donc, on verra à la correction demain Merci en tout cas, très sympa de ta part.  [...]

Fragment d'Okasaki

Je n'avais pas encore étudié le chapitre au moment où l'on a fait ces QCM, je les ai donc fait maintenant et en regardant la correction il avait mis faux à cet item, et cela m'avait choquée.   [...] Non, en fait il a dessiner une bulle de réplication avec des amorces ARN sur le brin avancé et des amorces ARN sur le brin retardé, en plus de sa en légende il a mis pour les bouts de fragments du brin avancé (qui n'existe pas en vrai pr le brin avancé) et du brin retardé =.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mise au point PCR en Temps Réel

La spécificité est donné par la courbe de fusion qui est dF/dt (où F est l'intensité de fluo, et t le temps) = f(T) (où T est la température). As-tu utilisé un gène de référence dot l'expression ne varie pas entre tes différentes conditions.   [...] (Ct = Treshold Cycle) de mes gènes de références est plus élevé que celui du gène cible. CT référence =32 alors que CT cible=24. Est ce que c'est normal ou bien il ya t-il des mise à point à faire, tel que la quantité d'ADNc ou des amorces Merci d'avance.  [...]

Question sur l’identification biomoléculaire des microalgues phytoplancton.

(Dans les études ils utilisant des amorces codantes des gènes de l'ADNr généralement La petite sous unité de l'ARNr (ARNr SSU) et/ou la grande sous unité (ARNr LSU) quelques-uns utilisant les espaceurs ITS (Espaceur Interne transcrit) de l'ADNr ou même le gène mitochondrial (coxI), les gènes chloroplastiques (rbcL, atpB) et les gènes de l'actine.).  [...] Parmi ces amorces quel sont les mieux adapter quel sont les points fort et les points faibles de chaque amorce et est ce qu'ils existant d'autre amorces utilisées qu'il est mieux d'utilisée des amorce universelles eucaryotes ou bien il faut spécifier des amorces spécifiques pour les genres étudiés.  [...]

[Biochimie] la réplication d'ADN

et en même temps, la primase fixe une amorce d'ARN (pour le premier fragment d'Okasaki), le brin retardé commence alors lui aussi a être répliqué. Le problème d'orientation du brin retardé est réglé par le fait que ce brin forme localement une boucle, ce qui modifie sont orientation, du coup localement, on a les 2 brins matrices qui ont une même orientation, permettant ainsi à la pol III d'avancé sur l'ADN et de synthètiser les 2 brins.  [...] Ensuite, les amorces d'ARN sont retirées (donc cela concerne l'amorce du brin avancé et chaque amorce de chaque fragment d'Okasaki) grâce à l'ADN polymèrase I (qui contrairement à la pol III a une activité exonucléase 5'-. 3') puis comme d'ADN pol I n'a besoin que d'un 3'OH libre pour polymériser, elle va pouvoir combler les parties laissées libres par les amorces.  [...]

applications de la PCR

Y'a plusieurs maniéres d'introduire une mutation. La 1ère consiste à la générer directement lorsque l'on design les primers (les amorces). C'est très utile.  [...] Note. la première méthode est ciblée car on sait à l'avance où se trouve la mutation (car on a générer les amorces à PCR soi-même), la 2ème est dirigéé mais l'on ne sait pas où se trouve la/les mutations, elle nécessite un screen fonctionnel.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN pol I

Mdr d'accord merci pour ta réponse, mais euh si on prend le cas du brin avancé qui n'utilise qu'une seule polymérase, ca veut dire qu'il reste toujours l'amorce d'ARN, étant donné qu'on n'utilise qu'une seule polymérase et non 2 comme pour le brin retardé, dont le deuxième vient éliminer les amorces d'ARN pour le brin retardé.  [...] quand 2 fourches de réplication se rejoignent la polymérase du brin avancé d'une des fourches va atteindre l'amorce du dernier fragment d'Okazaki de l'autre fourche. Mais je ne sais pas comment il va éliminer cette amorce, puisque la polymérase qui s'occupe du brin avancé est la Pol III, qui n'a pas d'activité exo 5'-3' (si je ne m'abuse).  [...]

qPCR

AH bah c'est embêtant,.S je pensais que t'avais juste choisi de l'ignorer pour te faciliter la tache en utilisant une approximation, mais quelqu'un aurait du t'en parler, l'efficacité des amorces est quand même quelque chose d'essentiel pour une qPCR.  [...] Tu ne peut vraiment pas te passer de calculer l'efficacité des amorces avant de faire du quantitatif, enfin je ne le concois pas, c'est comme faire une PCR classique et oublier de mettre le BET (ou autre colorant) dans le gel, et dire après je ne vois rien c'est dans mon echantillon ya pas le gène en question.  [...]