• Santé - Technique, Séquençage, ADN

Les molécules dans l'océan, des clés de la médecine et de la cosmétique

Pour s'adapter à des milieux variés et parfois extrêmes, les micro-organismes aquatiques synthétisent toutes sortes de molécules exploitables dans le domaine de la santé. Et c'est parfois aux biologistes marins à partir à la pêche aux molécules. C'est ce que Thien Nguyen, directeur de biotechnologie de Pierre-Fabre, a expliqué à Futura-Sciences et à des étudiants en biotechnologie lors d'une conférence SupBiotech, dans les locaux de l'école Esme Sudria.   [...] Le séquençage rapide de l'ADN, une technique essentielle de la pêche aux molécules.  [...]

Tous nos neurones n'ont pas le même génome

Les scientifiques ont procédé en deux temps. Dans un cas, ils ont récolté environ une centaine de neurones du cortex frontal, issus de trois personnes décédées. Leur objectif étant de déterminer une vue d'ensemble des CNV, il leur a fallu amplifier (multiplier) à plusieurs reprises le génome de chacune de ces cellules nerveuses avant de le séquencer.  [...] Le séquençage de l'ADN d'un neurone est un processus fastidieux. Il a fallu un an aux auteurs pour tester leur technique et la valider. The Sanger Institute, Wellcome Images, Flickr, cc by nc nd 2.0.  [...]

L'ADN de bébé séquencé grâce au sang maternel

Avant la naissance, il est déjà possible de détecter certaines maladies génétiques du foetus. Actuellement, les techniques utilisées sont l' amniocentèse, qui consiste en un prélèvement du liquide amniotique, entourant le foetus, à l'aide d'une longue seringue, ou un prélèvement placentaire.  [...] Pour éviter ces risques, et aller plus loin dans l'identification des gènes malades, une nouvelle technique de séquençage de l'ADN foetal a été développée et publiée tout récemment dans la revue Science Translational Medicine par des chercheurs de l'université chinoise d'Hong Kong.  [...]

Découvertes entomologiques rares sur une île perdue du Pacifique

Quelques espèces ont été prélevées en alcool absolu afin de pouvoir en réaliser le séquençage Adn dans le cadre du projet barcoding. Cette technique permet de comparer les espèces entre elles. Elle apporte une information complémentaire à celle tirée de l'étude morphologique.  [...] L'inventaire et l'étude de la totalité des espèces collectées s'étalera sur plusieurs années. Pas moins de vingt chercheurs, répartis dans cinq pays à travers le monde - l'Angleterre, la France, l'Italie, la Nouvelle-Calédonie et la République Tchèque - sont déjà associés à ce travail depuis 2003.   [...]

Éviter l'amniocentèse en séquençant l'ADN foetal d'une façon non invasive

Les chercheurs ont donc récolté 5 ng de cet acide nucléique chez une femme après 18,5 semaines de gestation. Grâce à une technique dite de séquençage profond de l'ADN, les fragments ont été lus 78 fois en tout, pour gagner en précision.  [...] En comparant avec l' ADN récolté dans les cellules du cordon ombilical, les scientifiques ont estimé la précision de leur technique. Sur les 44 mutations qu'il ne partage pas avec ses parents (probablement intervenues durant la spermatogenèse ou l'ovogenèse), 39 avaient été relevées.  [...]

CGHarray Anomalie en mosaïque

On dit aussi que le séquencage de Sanger permet l'étude des variations ponctuelles connues et nouvelles et ne se limite qu'aux exons. Au départ c'est pas censé être une technique pour connaitre les séquences d'ADN possibles Pourquoi les introns ne sont pas possibles.  [...] Je ne me lancerai pas dans une explication plus poussée avant d'avoir relu mon rapport ^^. J'avais fait une bonne introduction sur la technique de CGH-array, donc n'hésite pas si tu souhaites que je te l'envois. Par contre, j'ai quelques doutes au sujet du maximum de 20%, je dirais plutôt minimum, soit un minimum de 20% de cellules qui présentent l'anomalie déséquilibrée. Quasi-certain.  [...]

Condition Rnase-free ...

C'est une technique de réplication exponentielle de fragments courts (centaines ou milliers de base) d'ADN. Chaque nouveau double brin servant de matrice à un nouveau cycle de copie. au bout d'un moment on a des quantités énormes d'un même brin, ce qui est fondamental pour pouvoir faire du séquençage, etc.  [...] Pour ce qui est des conditions RNAse free. demaniere rigoureuse, il faudrait traiter toute vaisselle au DEPC, agent chimique modifiant irreversiblement les protéines. Puis autoclavage. En effet les sterilisation habituelles (autoclaves) ne permettent pas de se debarasser des RNAse (principalement le RNAse A) qui sont des enzymes extremement stables et tres actives.   [...]

Le lait maternel contiendrait plus de 700 espèces de bactéries

Dix-huit nouvelles mamans ont accepté de participer à cette étude et de donner des échantillons de leur lait à la naissance, un mois après et enfin six mois après l' accouchement. Grâce à une technique d'amplification d' ADN et de séquençage, les chercheurs ont pu déterminer la composition du microbiote dans le lait maternel en fonction du temps.  [...] Même si l'on ne le retrouve pas chez tout le monde et surtout en petite quantité, le redoutable staphylocoque doré (ici vu au microscope électronique à balayage en fausses couleurs) compose parfois la flore intestinale de certains patients en bonne santé. M. Arduino, CDC, DP.   [...]

[Biologie Moléculaire] Meilleure technique d'extraction ?

J'utilisais la puce GeneChip CustomID multipathogènes d'Affymetrix. Enfin, la 1re génération, pendant que j'étais là, on finissait la 2nde et on a commencé à la tester. C'est une puce de re-séquençage, pas d'expression.  [...] Je serais très intéréssée par ta méthode de déplétion des ADN génomique. J'ai besoin de cette technique afin de pouvoir faire du séquençage seulement sur des pathogénes sans avoir des séquences parasites ADN génomique.  [...]

Approche métagénomique ?

Mais je ne suis pas très au courant des techniques d'extraction d'ADN, de séquençage, etc.  [...] Disons que c'est assez difficile de trouver ce que tu recherches, la métagénomique étant une méthodologie jeune. Regarde ici, peut-être que ça conviendra.   [...]