• Santé - Solution, Acides aminés, Protéine

Composition d'un peptide

j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.  [...] pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe. C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

C'est ici qu'il faut résonner pour répondre à ta question. car suivant les radicaux R portés par les acides aminés qui forme le polypeptide, la solubilité de ta protéine va changer. En effet, tu pourrais avoir des radicaux hydrophiles, hydrophobes, acides, basique ou neutres ou de tout type en même temps.  [...] Quelque trucs pour t'aider. Tu regardes l'ionisation en fonction de ta solution ( tiens compte du potentiel hydrogène de ta solution ) des atomes qui constituent les acides aminés de ta protéine.  [...]

[Biologie Cellulaire] Le code génétique n'est pas redondant

Il n'y a pas de solution optimale au codage avec un alphabet de 4 lettres {ATGC} d'un mot (proteine) écrit avec un alphabet de 20 lettres (les acides aminés). C'est le problème du dictionnaire.  [...] Avec des mots de 3 nucléotides - les fameux codons, la solution retenue - on a 64 combinaisons. Beaucoup trop. Une fois qu'on a codé les stop, il reste pas mal de combinaisons. Plusieurs codons pour un même acide aminé, c'est pratique car cela rend les séquences codantes plus robustes (mutations tolérées sur la troisième base du codons).  [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Certaines protéines interagissant ensemble peuvent être dissociées par l'ajout de sel (en solution). J'imagine que les ions de ce sel solvatés en solution peuvent interagir avec certains acides aminés afin d'empêcher l'interaction protéine 1 protéine 2 (donc une interaction électrostatique) mais je me demande quels acides aminés sont capables de réaliser ces types de liaisons.  [...] Ne pas oublier aussi que les protéines n'interagissent pas uniquement au moyen de la chaine latérale de leurs acides aminés. Le squelette peptidique d'une protéine, avec ses fonctions amides, peut également établir des liaisons H avec d'autres protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] Lyse cellulaire

J'ai trouvé une solution en fait. créer un mutant de notre protéine avec uniquement le domaine qui m'intéresse plus quelques acides aminés pour le lier à un anticorps sur une colonne. Reste à faire passer les lipides dans la colonne et récupérer le complexe. Je pense que ça peut le faire.  [...] Votre proposition est théoriquement viable, mais cela peut être extrêmement lourd a mettre au point. Il faut notamment etre sur que le reste de la protéine n'est pas important dans l'interaction avec le lipide, (ou meme dans l'interaction avec d'autres protéines elle-même importantes dans l'interaction avec le lipide).  [...]

Courbe Henderson protéine expérimental vs théorique vs acides aminés libres

Courbe Henderson protéine expérimental vs théorique vs acides aminés libres.  [...] Bonsoir à tous, je me permets de vous demander votre aide concernant un tp de Biochimie au cours duquel j'ai titré une solution d'azidometmyoglobine à l'aide de NaOH et de HCl, puis une solution contenant tous les acides aminés de la protéine sous leur forme libre, afin de comparer les courbes d'Henderson.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

La protéine est linéaire à cause du SDS, peu importe la composition en acides aminés. Mais le phosphate fait office de chaine latérale sur la protéine si tu me permets l'expression.  [...] J'ai un peu de mal moi aussi avec l'idée que les phosphates dépassent suffisamment des chaines latérales des acides aminés pour avoir plus d'influence sur la migration de la protéine que les chaines latérales elles-même. Mais bon, je ne vois pas d'autres explications non plus.  [...]

Polypeptide végétal

pas vraiment, en fait on parle de protéine lorsqu'on parle d'une chaine d'environ 100 acides aminés, en dessous ce sont des peptides tout simplement.  [...] Une protéine, qu'elle soit animale ou végétale, est toujours un polypeptide. Les acides amines ou les modifications post-traductionnelles peuvent être différentes, mais l'organisation est similaire.  [...]

[Biochimie] Interaction kinase / substrat

Quel type d'interaction prédomine dans la reconnaissance de ce substrat*par la protéine kinase Quels acides aminés de la séquence seraient alors impliqués*.  [...] Le site actif de la protéine kinase contient plusieurs de ces acides aminés. Pour identifier ceux qui sont impliqués dans l'interaction, vous décidez de les muter par un autre acide aminé. Proposez deux acides aminés (avec leur structure) qui ne pourraient plus interagir, mais qui seraient d'un point de vue structural pas trop différent pour ne pas changer la structure de la protéine kinase.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Je cherche à déterminer si ma protéine est hydrophile ou hydrophobe à partir de sa séquence en acides aminés et de sa charge globale.  [...] Je suis d'accord que les acides aminés polaires se mettent à l'extérieur, mais comment en déduire si la protéine est hydrophobe ou hydrophile.  [...]