• Santé - Séquences, Marqueurs, Génome

La médaille d'or du CNRS pour Jean Weissenbach, un des pères du Généthon

Elle recenserait des régions remarquables, petites séquences d' ADN appelées marqueurs. Sur un génome ainsi balisé, il deviendrait plus facile de déterminer les positions des gènes et, surtout, de localiser ceux que l'on pense être à l'origine de maladies.  [...] Pour Jean Weissenbach, les meilleurs marqueurs devraient être les microsatellites, de courtes séquences dont les nucléotides (les lettres de l'alphabet du génome) sont répétées plusieurs fois. Ces microsatellites sont caractéristiques d'un individu et se transmettent d'une génération à l'autre.  [...]

Avons-nous dans nos cellules des gènes de Néandertaliens ?

Pour tenter de lever le voile sur cette énigme, grâce au progrès en matière de séquençage d' ADN, des chercheurs ont entrepris de comparer le génome des deux types d' hominidés. En 2006, un article publié dans Science par un groupe de biologistes du Lawrence Berkeley National Laboratory ( Berkeley Lab ) et du Joint Genome Institute (JGI) annonçait, en se basant sur l'étude de 65.  [...] Au total, l'étude a porté sur certaines parties du génome de 99 groupes de populations en Amérique, Océanie, Europe, Asie et Afrique. Plus précisément, les chercheurs ont analysé 600 séquences microsatellites, des marqueurs génétiques bien connus servant par exemple à identifier un individu en médecine légale et qui permettent de dresser des arbres phylogénétiques.  [...]

[Génétique] comment obtenir des sondes spécifiques pour un marquage chromosomique avec les séquences alu?

Si j'ai bien saisie les bases. les séquences alu sont des marqueurs de répétition du génome utilisés dans ce cas. Ce qui permet l'identification lors d'un marquage basé sur les sites alu c'est leur nombre de répétition et leur répartition sur les télomères qui diffèrent d'un chromosome à l'autre.  [...] ..par exemple. Comment obtient-on la spécificité des sondes Est-ce qu'il s'agit de sondes de très grandes tailles comportant dans leurs séquences le nombre et la répartition spécifique au chromosome visé.  [...]

microsatellites....qu'est ce que c'est ???

Les microssat sont comme il l'a déjà été dit des marqueurs très polymorphes (c'est à dire avec beaucoup d'allèle différents) qui sont répartis sur l'ensemble de l'ADNg et qui permettent nottament le séquençage en faisant une carte physique (mais l'utilisation de ces marqueurs seuls ne suffit pas pour le séquençage).  [...] Ils sont très souvent utilisés pour les tests de paternités dans la police scientifique ou autre et également pour l'identification de locus morbides (=région du génome contenant le gène muté responsable d'une maladie génétique). L'immense avantage de ces marqueurs est qu'ils sont bordés par des séquences uniques.  [...]

[ADN] Empreintes génétiques.

Pour calculer précisément cette probabilité, il faut connaître le taux de polymorphisme des marqueurs utilisés. Ce n'est pas simple, ça dépend des zones du génome, et de toutes façons ce n'est pas connu avec précision. Par exemple il y a des séquences qui sont considérées comme fixées dans l'espèce humaine (elles n'ont aucun variant connu) mais ça peut être parce qu'on ne les a pas pour suffisamment d'individus.  [...] je crois que dans les affaires judiciaires on utilise des marqueurs microsatellites, dont on sait qu'ils sont très polymorphes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

Voila, je ne comprend pas trop comment choisir le type de séquençage à sélectionner. Le but est l'analyse de plantes inconnues grâce au DNA barcoding, à l'aide de marqueurs génétiques tels que rbcL ou trnL.  [...] En fait, dans le DNA Barcoding ce sont des séquences du génome qui sont utilisées comme barcode. Les marqueurs sont donc choisis avec soins (ici rbcL et trnL) pour permettre d'identifier les espèces. Je m'explique. ce sont des régions du génome qui sont (en théorie) variables d'une espèce à une autre, mais très préservées au sein d'une même espèce, pour lesquelles des amorces dites universelles ont été design.  [...]

[Biologie Moléculaire] marqueurs moléculaires

Bonsoir, je ne suis pas tout à fait d'accord avec la réponse précédente, les marqueurs moléculaires sont en fait des séquences génomiques dont on se sert comme balise pour mettre en évidence un polymorphisme entre deux individus par exemple.  [...] Alors évidemment dans la pratique on se sert d'enzymes de restriction pour utiliser ces outils mais à la base il s'agit de séquences génomiques.  [...]

Vous êtes ce que vous mangez... et ce qu'a mangé votre papa !

Ils ont ainsi pu mettre en évidence une influence de la nourriture paternelle sur l'expression de 445 gènes de la progéniture. Ainsi, les gènes impliqués dans la biosynthèse du cholestérol et des lipides sont surexprimés, menant à des différences significatives du taux de certains lipides.   [...] D'autres marqueurs des modifications épigénétiques ont été recherchés. Certains microARN, connus pour réguler l'expression des gènes, ont également été retrouvés affectés, de même que l'ADN génomique possède des méthylations particulières au niveau des séquences promotrices de certains gènes.  [...]

[Génétique] Phylogénie et loi de distribution gamma

.. Et inversément la relaxe globale des pressions de sélections sur les introns devraient conduire a plus d'homogénéité. En fait il faut quand même regarder au cas par cas en fonction des séquences utilisées. Je ne suis pas quand même certains que les séquences des introns soient de bon marqueurs phylogénétique pour des phylogénies. Là encore a tester.  [...] Je ne suis pas quand même certains que les séquences des introns soient de bon marqueurs phylogénétique pour des phylogénies. Là encore a tester.  [...]

[Génétique] Localisation d'un gène

Tu les génotypes pour l'ensemble des marqueurs et grâce à ça tu peux savoir quels marqueurs sont portés uniquement par les individus malades. Grâce à ça tu sais dans quelle zone est situé ton gène.  [...] Les deux techniques permettent donc de réduire la zone du génome dans laquelle on pense que se situe la mutation. Pour la préciser encore soit on densifie la carte en marqueurs, soit tout simplement on séquence la zone pour trouver la mutation (les coups de séquençage ont beaucoup baissés, ça devient possible sur quelques mégabases sans exploser le budget).  [...]