• Santé - Séquence, Groupe, Protéine

[Biochimie] Expression protéique

sinon, avoir un messager de donne pas toujours de protéine. Il faut des régions régulatrices et pas uniquement la séquence codante.  [...] La séquence est correcte puisqu'elle a été séquencé et est à 100% identique à l'originale. La protéine vient de Rhodococcus equi et a été cloné dans M. marinum. Ses deux organismes appartiennent au groupe des Nocardia et ont un GC% plus ou moins semblable (65% environ).  [...]

mutatio d'un nucléotide dans l'ADN --> Délétion de 173 nucléotides dans l'ARNm

J'ai un petit pb (assez comique.). La protéine Riplus est un protéine hypothétique qui entraîne les individus à sourire plus souvent. Elle est inactive chez beaucoup d'individus chroniquement malheureux. L'ARNm isolé chez des personnes malheureuses d'une même famille a perdu une séquence interne de 173 nucléotides, présents dans l'ARNm Riplus isolé d'un groupe contrôle d'individus heureux.  [...] C'est un excercice inventé de toute piece. alors on peut bien imaginer au hasard une sequence d'ADN permettaant d'obtenir une sequence de proteine et lui donner un nom sans pour autant que ca soit reliéa quoique ce soit de reel.  [...]

ADN ARNm

La séquence non codante va favoriser (si les bons facteurs de transcription sont présents) la transcritpion de ta séquence codante. La séquence codante démarre au codon (groupe de trois nucléotides) ATG et va jusqu'à un codon stop. L'ARN polymérase (qui transcrit le brin codant d'ADN en un brin d'ARN) va à partir de ta séquence codante, former un ARN dit messager, car c'est lui qui transporte le plan de la protéine vers les usines de fabrication qui sont les ribosomes (dans la séquence de l'ARN, les T sont remplacés par des U).  [...] Juste une précision là-dessus. Des introns existent chez certaines Bactéries. C'est très particulier. il s'agit d'introns de groupe II qui sont capables de catalyser in vitro leur propre excision en l'absence de protéines et d'ATP = ribozymes.  [...]

[Biochimie] Phasage

Remplacement moléculaire. A l'aide d'une protéine homologue (donc on espère qu'elle a un repliement tridimensionnel similaire), on place cette protéine homologue au même endroit (tenir compte groupe espace, maille, nombres de molécules dans UA) que notre protéine d'interet.  [...] Remplacement isomorphe. On va jouer sur la différence de diffusion entre un cristal de notre protéine seule et un cristal de protéine contenant un atome lourd (riche en électrons car les RX interagissent avec les électrons). Cette atome lourd ne doit pas modifier le cristal (paramètres de maille, groupe espace, repliement de la protéine.  [...]

[Biochimie] Annotation d'une sequence par bioinformatique

En fait si mes souvenirs sont bons, tu as identifié une séquence au sein d'un organisme particulier. Cette organisme à priori fait partie d'un groupe, par exemple le chien chez les mammifères. Ce groupe en question sera ton groupe d'étude, et tu compareras ta séquence à celle de ce groupe pour la situer par rapport aux autres membres du groupe.  [...] Donc après avoir trouvé des séquences homologues par BLASTp, jai la liste des séquence homologue avec leur espèce. ce sont tous des bactéries. Alors est ske je peu prendre comme groupe extèrieur le eucaryotes Et si oui commen je choisi kel sequence je pren pour pour faire mé groupe parsk aparamen je doi pa choisir o hasard dans les procaryotes pour le groupe d'étude et dans les eucaryote pour le groupe extèrieur.  [...]

Les proteines membranaires

Je me demande si les proteines membranaires sont amphipathiques ou amphiphiles.  [...] Une protéine peut être appelée soit amphiphile soit amphipathique lorsqu'elle a un groupe hydrophile et un groupe hydrophobe.  [...]

[Biologie Cellulaire] Qu'elle est la différence entre une personne Hétérozygote et Homozygote ?

Et j'ajouterai que la notion d'allèles identiques ou non dépend du niveau de détail de l'observation qui en est faite. Aujourd'hui on obtient facilement des séquences et on va parler d'allèles identiques quand les séquences sont identiques mais parfois on a une observation moins fine, par exemple on sait juste que les protéines produites sont fonctionnellement identiques (mais elles peuvent avoir des séquences différentes).  [...] Dans ce cas on pourra aussi parler d'homozygotie alors que les séquences sont distinctes. Pour prendre un exemple. dans le système de groupe sanguin ABO, une personne peut être considérée comme homozygote AA, ce qui signifie que les deux versions du gène qui code l'ABO-transférase produit la même protéine (au moins fonctionnellement) mais ne dit rien sur les séquences de ce gène (ou plutôt dit qu'elles ne sont pas très différentes mais autorise quelques variations).  [...]

[Biochimie] Mutation proteine remplacement d'aa

La sérine porte un groupement hydroxyle dans son radical. Ce groupement hydroxyle est probablement celui qui porte le phosphate. Il n'existe pas chez l'alanine. Les auteurs veulent donc remplacer la sérine par un aa de taille équivalente qui ne peut être phosphoryler.  [...] Une protéine kinase va catalysr le transfert d'un groupe phosphate de l'adénosine triphosphate (ATP) sur l'hydroxyle (groupe -OH) des chaînes latérales des acides aminés ayant une fonction alcool. sérine, thréonine et tyrosine.  [...]

Extraction d'ADN

Lors de l'extraction de l'ADN on a utilisé de la protéinase K afin d'éliminer les protéines contaminantes, ma question est. est-ce que protéinase K = protéine kinase.  [...] protéine kinase catalyse le transfert d'un groupe phosphate d'ATP sur l'hydroxyle (groupe -OH) des chaînes latérales des acides aminés. tandis que la protéinase K est une protéase végétale très active Elle hydrolyse les protéines de toutes origines en quelques heures.  [...]

sequencage du genome humain

Savoir quel est la séquence d'un gene particulier nous permet d'étudier une protéine spécifique aussi. Si on connait la séquence d'une protéine, on peut l'isoler, l'amplifier, et faire exprimer les gènes de la séquence à des cellules hôtes. On peut alors récuperer la protéine, la purifier, et étudier ses fonctions.  [...] J'ai deja lu que selon notre origine nous n'avons pas le meme genome et par la, des differences de sensibilité a certaines maladies. Donc je me demandais, d'ou vient l'humain qui a ete sequencé, comment c'est effectué la selection du coup, le genome est il vraiment fiable et utilisable (mis a part pour le groupe ethnique correspondant a l'humain sequencé).  [...]