• Santé - Séquence, ARN, Motif

[Biologie Moléculaire] Utilisation AAV pour CRISPR/Cas9

Seulement j'ai un problème car je ne comprends pas certaines étapes du transport du matériel génétique. Comment cela se fait-il.   [...] Nous devrons ainsi dans un premier temps. (i) cloner l'ADN codant pour l'exon 14 JM de c-MET, qui permet l'ubiquitination par Cbl. (ii) faire synthétiser un ARN guide composé d'une séquence complémentaire du gène ciblé (crRNA) d'environ 20 nucléotides en 5', d'une séquence Protospacer Adjacent Motif (PAM) de trois bases.  [...]

[Biologie Cellulaire] question sur les séquences consensus

Ainsi, il doit être possible de renconnaitre dans une séquence d'acide aminé donnée, un motif caractéristique des récepteurs GABA. Je pense que c'est ce qu'il a voulu dire.  [...] Xylem, la séquence dite Shine-Dalgarno est un motif ARN reconnu par l'ARN16s du ribosome chez les procaryotes. Elle participe donc à l'initiation de la TRADUCTION pour de nombreux gènes bactériens.  [...]

Codon initiateur et protéine

Les bactéries possède en amont du codon start AUG (donc dans le 5' UTR) une séquence RBS (Ribosome Binding Site) qui permet de recruter la sous-unités 30S du ribosome. Le RBS bactérien est appelé Séquence Shine-Dalgarno et c'est un motif riche en purine. La séquence Shine-Dalgarno permet le recrutement de la sous-unité 30S car celle-ci possède un ARNr 16S qui a une séquence Anti Shine-Dalgarno (ASD).  [...] Mais, c'est du racolage.. Comment dans une science aussi précise que la génétique, on dis que les exons se regroupent comme si on avait coupé les bords d'un pain de mie Moi je vois l'ADN comme une séquence de nucleotides agencés précisément, alors rassembler des nucleotides qui a la base ne sont pas côte à cotes je ne vois pas bien.  [...]

[Génétique] Traduction des protéines

La sequence SD interagit avec l'ARnr 16S alors que ce n'est pas du tout le role du contexte de kozac (ce n'est d'ailleur pas une sequence, mais plutot un motif consensus). Ce dernier prédit qu'un codon AUG sera plus ou moins efficace pour initier la traduction chez les eucaryotes.  [...] Et moi aussi je parle plus volontier d'un motif ou plus généralement d'un consensus de Kozak plutôt que d'une séquence. De plus Yoyo a raison, il ne faut pas confondre le consensus de Kozak qui marque le codon initiateur et le site de liaison du ribosome qui sera soit au niveau du 5'cap soit au niveau d'un IRES.  [...]

[Génétique] promoteur??

Cependant j'ai lu dans d'autres ouvrages que Une séquence promotrice est une région située à proximité d'un gène et indispensable à la transcription, sur laquelle se fixe l'ARN polymérase. Les séquences promotrices peuvent être situées en aval du site d'initiation de la transcription, et même dans le gène transcrit.  [...] Cette séquence -35 présente un motif de six bases bien conservées. TTGACA. Enfin, à environ 10 nucléotides en amont de l'origine de la transcription, on retrouve un motif TATAAT. Cette séquence dite séquence -10 est appelée également boîte de PRIBNOW.  [...]

Séquences consensus

Une sequence consensus correspond a un motif qui est retrouvé dans plusieurs protéines et qui a a priori la meme fonction.  [...] Soit plusieurs sequences d'une meme proteine (ou d'une meme famille de proteines) que tu aligneras entre elles, afin de determiner la sequence consensus et l'existance d'eventuels motifs.  [...]

[Génétique] Gène plus court?

Essaie aussi de Blaster la séquence du motif additionel caractéristique du gène humain, il s'agit peut-être d'un motif fonctionnel précis, ce qui t'avanceras dans ta réflexion.  [...] Les deux protéines ont la même fonction chez les deux organismes et la région manquante n'est pas la région importante puisque ce sont les régions N et C terminales qui doivent être conservées pour avoir une protéine active. Si je regarde la séquence nucléotidique, il ne manque pas 39 nucléotides.  [...]

Le récepteur ERD

Ce que je sais. Le récepteur ERD fait le transit entre le RER et le Golgi pour ce qui concerne les protéines solubles car il possède deux signaux d'adressage. un au RER (KKXX) et l'autre au Golgi. Il peut reconnaître la séquence KDEL. Les protéines solubles du RER possèdent dans leur séquence le motif peptidique KDEL, qui est le signal d'adressage au Golgi.  [...] Donc ERD reconnaît le motif KDEL, puis emmène la protéine échappée au RE grâce à sa sequence KKXX, puis revient au Golgi grace à son autre signal.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication des télomères

La télomérase est une enzyme qui posséde une activité enzymatique télomère terminal transférase. Bien sûr que cette enzyme n'a pas de matrice exogène puisqu'elle possède une matrice endogène, c'est la raison pour laquelle c'est une ribonucléoprotéine. l'ARN qui code la séquence du télomère est intégré dans l'enzyme qui forme la télomérase.  [...] pour terminer la réplication une ADN polymérase (qui est appelé télomérase) va prendre le brin d'ADN et lui ajouter plusieurs fois la séquence TTAGGG grace aux morceaux d'ARN qu'elle contient en elle.  [...]

Telomerase

Je ne comprend pas bien le but de la telomerase, d'après ce que j'ai compri,il s'agit d'une protéine qui contient une séquence de RNA qui va venir s'appareiller au DNA, est-ce juste Quelqu'un pourrait-il me dire en gros son mode de fonctionnement et son utilité La telomerase est-elle utilisée dans toutes nos cellules D'après mon cours non mais ca me paraît bizare.  [...] Oui le telomere est constitué d'une repetition de la meme sequence. Elle est présente dans toutes les cellules indifférencier, mais cette activité disparait avec l'arret des divisions. En fait elle utilise une matrice ARN pour synthetiser le fragment d'ADN. La telomerase est une ribonucleoproteine.  [...]