• Santé - Séquençage, Parallèle, Génération

[Génétique] Séquençage parallèle en masse / Next generation sequencing

Séquençage parallèle en masse / Next generation sequencing.  [...] En gros, on prend de l'ADN d'une espèce. On le fractionne, on le séquence ensuite en parallèle et les reads sont rassemblés grâce à des méthodes de bioinformatiques. Ce qui te donne finalement ta séquence d'ADN.  [...]

[Biotechnologie] séquençage à haut débit

Au contraire, l'Illumina sera privilégié dans le cadre d'un gros séquençage, par exemple pour le séquençage d'un génome entier. En effet, les séquences déterminées étant bien plus longue que celles obtenues par pyroséquençage, il sera plus facile de reconstituer la séquence génomique.  [...] bonjour, vous pouvez m'aider... j'ai besoin d'un cours sur le séquençage parallèle massif d'ADN NGS. Nest Generation Sequencing.  [...]

Les garçons entrent dans la puberté de plus en plus jeunes...

La dernière étude du genre menée en Europe date de 2010, et elle révélait également que la maturation des enfants apparaissait plus tôt. Les fillettes vivent exactement la même chose. Une recherche de 2010 a même montré que le développement des seins commençait chez certaines d'entre elles dès l'âge de 7 ans.   [...] Les avis sont partagés. Certains estiment que cette évolution est relativement logique, même si on ne peut avancer éternellement l'âge de la puberté. En parallèle, de génération en génération, la taille des individus s'élève. Parmi les explications avancées (mais non vérifiées), l'amélioration de la qualité nutritive des aliments, permettant une maturation plus précoce des enfants.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment séquencer un génome inconnu ?

J'ai pensé pour séquencer d'extraire l'ADN de l'organisme puis de digérer celui-ci avec des enzymes de restrictions. J'obtiens ainsi différents fragments dont les quelques nucléotides aux extrémités sont connus grâce aux sites de restrictions. Est-il possible alors d'y hybrider de façon spécifiques des sondes pour permettre un séquençage avec la méthode de Sanger par exemple (car les sondes sont plutôt longue par rapport aux sites de restriction non ).  [...] De nos jours, on ferait du séquençage haut débit. fragmentation de l'ADN et ajout d'adaptateurs connus aux extrémités pour faire en parallèle des millions de reads qui peuvent être alignés entre eux par chevauchement (contigs).  [...]

Si je suis paresseux, est-ce ma faute ou celle de mon génome ?

Une étude vient de mettre en lumière le fait que des rats peuvent être sélectionnés pour devenir, après plusieurs générations, hyperactifs ou au contraire puissamment paresseux. Après comparaisons de différents paramètres, les auteurs ont trouvé 36 gènes potentiellement à l'origine du manque de goût à l'effort de certains rongeurs.  [...] En parallèle, des mesures ont été effectuées sur les rongeurs pour déterminer si la nature de ce facteur était mitochondriale, corporelle ou génétique. Pour les deux premiers paramètres, il existe très peu de variations entre les deux lignées de rongeurs. En revanche, des analyses précises par séquençage profond de l' ARN révèlent la présence de 36 gènes susceptibles d'expliquer les différences de comportements d'un groupe à l'autre.  [...]

[Evolution] Origine de la vie : unicité du foyer.

Prenons le cas hypothétique où les conditions propices à l'apparition de la vie se perpétuent de manière continue sur la Terre (d'ailleurs, avons-nous une idée de savoir si ce n'est pas le cas, par exemple dans certains milieux sous-marin ). Est-il envisageable d'avoir, en parallèle des processus darwiniens classiques, une sorte de génération spontanée continue ou un processus tel que celui que j'ai mentionné dans mon explication 2) préviendrait l'apparition de nouvelles formes de vie.  [...] En fait, certaines théories bien ficelées de l'émergence de la vie, évoluent en permanence en parallèle avec l'évolution des connaissances en biologie. Par exemple, pour les théories métabolisme d'abord, la découverte de nouvelles façons de fixer le carbone chez les autotrophes (je pense qu'on en connaît six à l'heure actuelle) à lancer de nouvelles façons d'imaginer le métabolisme primitif des premières formes de vie.  [...]

purification d'ADN sur gel

En général je fait 3 PCR en parallèle avec le même amplicon que je pool. Je fait migrer 100µL sur gel (en scotchant mon peigne pour faire des grands puits). Après purif, j'ai en moyenne 30µL entre 5 et 15ng/µL ce qui me suffit largement pour faire mes clonages.  [...] En général je fait 3 PCR en parallèle avec le même amplicon que je pool. Je fait migrer 100µL sur gel (en scotchant mon peigne pour faire des grands puits).  [...]

Quelques questions

16 la réplication et transcription procaryote nécessite toutes les deux l a dissociation de la structure nucleosomale.   [...] Pour le QCM, tu pourrais répondre ce que tu crois juste, et seulement après, les gens du forum pourrait te corriger le cas échéant.   [...]

CGHarray Anomalie en mosaïque

Autre question, est ce que la PCR massivement parallèle (bridge par et micelle) demandent également de connaitre les séquences à amplifier J'aurai dit oui évidemment mais sait on jamais.  [...] On dit aussi que le séquencage de Sanger permet l'étude des variations ponctuelles connues et nouvelles et ne se limite qu'aux exons. Au départ c'est pas censé être une technique pour connaitre les séquences d'ADN possibles Pourquoi les introns ne sont pas possibles.  [...]

[Biochimie] PCR: a quoi servent les differents elements

Justement, ta Taq Polymérase va se servir des dNTP et des amorces pour polymérisé de façon complémentaire et anit-parallèle, la séquence où commence l'amorce.  [...] Dans le cas où on cherche une séquence exacte (on ajoute une séquence connue pour détecter telle bactérie) je ne vois pas pourquoi utiliser le gel de migration.  [...]