• Santé - Reconnaissance, Séquence, Cible

enzymes de restriction

Il en existe des centaines (milliers ) qui reconnaissent en général des séquences de 6 nucléotides, palindromiques (d'autres reconnaissent des séquences plus courtes ou plus longues).  [...] Ce qui donne la spécificité à une enzyme sa conformation qui lui permet une reconnaissance plus ou moins spécifique de la séquence cible.  [...]

[Biologie Moléculaire] cdk

La spécificité de phosphorylation des CDK est conditionnée par les cyclines. C'est à dire que toutes les CDK phosphorylent une même séquence consensus de phosphorylation sur leurs substrats. Par contre la reconnaissance du substrat, grâce à une séquence consensus d'arrimage de la kinase sur la cible, se fait par la cycline.  [...] Donc selon la cycline associée à une CDK, des protéines bien spécifiques seront phosphorylées, des protéines qui doivent intervenir à une étape précise. On comprend alors mieux (cela ne regarde que moi), comment la succession de cyclines coordonne si bien l'avancée dans le cycle.   [...]

[Biologie Moléculaire] siRNA résistant

En théorie une seule mutation suffit, en pratique tu peux en faire plusieurs pour être sûr. Il me semble que la meilleure zone où faire les mutations est la partie correspondant à la 1ère moitié 5' du siRNA antisens, des nucléotides 2 à 10 car c'est là que l'appariement est important pour qu'il y ait clivage, donc sur ton ARNm c'est la partie 3' dans la zone ciblée par ton siRNA.  [...] Le but est surtout que le siRNA ne puisse plus induire la dégradation de son ARNm cible par l'absence de reconnaissance par RISC. Donc il y a juste à faire en sorte que la mutation du siRNA soit suffisante. Par contre, une fois la mutation choisie, je te conseille de blaster la séquence de ton siRNA mutant de façon à ne pas avoir des effets non spécifiques dûs à un ciblage d'un autre ARNm.  [...]

physique, biologie, Schrödinger

C'est vrai, mais je n'ai quasiment aucune connaissance solide en biologie. Je ne peux pas me permettre de remettre en cause ce que les anciens disent sur le sujet.   [...] Pourquoi parler d'une émergence systémique Parce le phénomène vivant émerge/repose sur l'entrecroisement de plusieurs phénomènes plus simples. c'est un système matériel pseudo-organisé, qui est loin de l'équilibre de repos (où évolutivité du système), et un ensemble procédural non-linéaire (boucles rétroactives, impact à large spectre d'effets, robustesse/sensibilité à l'erreur, etc), avec une part irréductible de chaos (plus émergent que le vivant et ses conséquences jusqu'au plus indirectes (ex. IA), ça reste une gageure).  [...]

[Divers] Nutriments

J'ai à faire à des eaux de rivières. Je ne sais pas quelles bactéries s'y trouvent mais je sais que des bactéries sont bien présentes. J'émets donc une hypothèse sur l'utilisation de ces trois composés et j'aimerais savoir si cela est possible. Si le fait d'écrire cela n'est pas une ânerie.   [...] Le magnésium est utilité pour quasiment toute forme de vie (magnésium primordiale pour la reconnaissance ATP-cible). Pour le calcium, je sais pas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation de NFAT5

Ensuite, et c'est la ma question, la dégradation de NFAT5 est médié par le proteasome mais independemment d'une ubiquitination.... Est ce que vous connaissez ces modes d'activation et de dégradation En cours on nous a parlé de PEST mais pas de précision la dessus, et j'ai trouvé dans la littérature que parfois c'était des acides aminés particuliers et des séquences qui intervenait dans cette voie ubiquitine independante.  [...] après ajout d'une chaîne de polyubiquitine d'environ 76 résidus d'Ub, le protéasome va dégrader la protéine cible et ce après reconnaissance de la chaîne de polyUb.  [...]

[Biochimie] Protéases et sites de reconnaissance

Y en a-t-il d'autres qui ont, comme ça, une longue séquence de reconnaissance J'ai un peu de peine à trouver des infos sur le net.  [...] Des protéases tu en a évidemment plein différente. selon la séquence en acide aminé (beaucoup d'espèces vivantes impliquent une grande diversité génétique / protéique), selon le mécanisme,  [...]

Mutation?!

Par ailleurs, il existe des promoteurs TATA-less (LXR doit en connaître un bout ), donc la TATA-box est une séquence de reconnaissance au niveau du promoteur parmi d'autres.  [...] 99% des variations de séquence. cette technique vous renseigne-t-elle sur la nature de la variation si non quelle est celle qui donne le plus de précision en dehors du séquençage. pour la 2ème partie de la question je pense que c la DHPLC, et pour la première d'après moi c'est le séquençage, mais bon reste à confirmer.merci.  [...]

[Biochimie] Enzymes de restriction pour détecter les mutations

Il faut retrouver, par exemple pour l'enzyme 1, la séquence ACTAGT en entier dans le gène (normal ou muté), or ici elle n'y est pas.  [...] enz3. CACGAG. même résonnement la séquence du gène non muté est G AC GAG, il n'y a pas de reconnaissance du site donc pas de coupure.  [...]

Génétique : Queue poly A

La queue poly A est une séquence de nucléotides d'Adénine condensés par une enzyme qui est la polyA polymérase après reconnaissance du CPSF (ou séquence de polyadénylation), elle va d'abord couper 10 nucléotides (ribonucléotides pour être plus précise) plus loin que le AAUAAA, et puis au niveau de l'extremité 3' du dernier nucléotide du transcrit primaire elle va condenser des AAAAA.  [...] Merci pour ta réponse. Mais je ne comprends pas une petite chose. à mon sens l'ARN m est linéaire après la transcription, et c'est justement ce qui permet la traduction et la synthèse des protéines. Ex. Une anomalie de structure qui peut toucher un chromosome est le chromosome en anneau, cet anneau ne permet donc pas une transcription de ce chromosome.   [...]