• Santé - Recherches, Séquence, Régions

A partir de combien d'allèle peut-on dire qu'on est de la même famille

Je ne sais pas non plus si c'est le bon forum mais en tout cas ta question est très mal posée. Je suppose que tu parles de deux individus qui ont le même allèle pour un certain nombre de gènes. Pour pouvoir répondre il faudrait connaître les distributions des allèles de ces gènes, il faudrait savoir combien de gènes ont été séquencés.  [...] À ma connaissance dans les tests relatifs aux recherches de parenté on ne séquence pas des gènes mais des micro ou minisatellites qui sont des régions non codantes. Voir par exemple http.//expertadn.fr/fiabilite-du-tes...crosatellites/ et la réponse est qu'en séquençant 16 loci on a une probabilité de paternité à 99,9%.  [...]

mystère de séquences...

Après séquençage de 3 génotypes avec la même amorce, nous avons 3 séquences qui a parti du même endroit, a un décalage d'environ 15 bases (je n'ai plus le nombre exactes mais c'est le même pour les 3).  [...] Ca sent très fortement la séquence répétée. Ton amorce se fixerait à plusieurs endroits, tant que tu es dans la région répétée ta séquence semble normale et quand tu atteinds les régions variables, tu obtiens un mélange de séquences. Utilise le programme blast en donnant comme élément à rechercher ton amorce (ou mieux, un segment de 50 nucléotides issus de la partie propre de la séquence).  [...]

[Biologie Moléculaire] Taille des exons, des introns et des régions UTR

Le but est donc de rechercher toutes les régions entre un GT et un AG qui contiennent un A puis compter le nombre de nucléotides Cela me semble long et bizarre étant donnée la taille de la séquence d'ADN (ADN complémentaire et non ARN).  [...] Par ailleurs je dois déterminer la taille des régions UTR en 3' et 5' à l'aide d'une séquence d'acides aminés et de la séquence d'ADNc. Pour le coup, je connais les longueurs usuelles (entre 100 et 200 nucléotides pour UTR 5' et environ 1000 nucléotides pour URT 3'), mais je ne sais pas du tout comment trouver la longueur exacte.  [...]

[Biologie Cellulaire] Cellules cancéreuses infectées par rétrovirus

Merci. Donc après recherches j'ai trouvé que les deux extrémités du génôme viral était constituées de deux régions non codantes. 5' et 3' composé de pas mal de nucléotides. Mais je ne vois toujours pas comment le virus fait pour s'assurer de la synthèse des bonnes protéines.  [...] Les régions dont du parle sont appelées des LTR pour long terminal repeat (c'est les séquences répétées dont parlait Vinc). Le LTR en 5' contient une séquence qui permet d'induire la transcription du génome viral... et donc son expression.  [...]

Le VIH s'en prendrait-il à l'Homme depuis plus longtemps que prévu ?

Le chercheur et ses collègues ont alors émis une hypothèse. si le virus a franchi à plusieurs reprises la barrière des espèces, alors il est possible que les populations locales présentent des variants génétiques protecteurs.   [...] De précédentes recherches ont identifié 26 régions du génome impliquées dans la résistance au VIH. Les scientifiques ont donc comparé ces gènes avec des régions présentant des traces de sélection. Quand un trait est sélectionné, on observe pour tous les membres d'une même population une perte de diversité génétique dans les régions voisines de ce gène, phénomène qui accroît les différences entre les peuples.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutagénèse insertionnelle

Si j'introduit un ADN-T dans une cellule, il intégrera le génome de la cellule hôte, puis on observe des mutations via le phénotype qui change, et en fonction du phénotype on retrouve l'endroit où a eu lieu la mutation grâce a la séquence de l'ADN-T que l'on connait (via ses régions flanquantes).  [...] et en fonction du phénotype on retrouve l'endroit où a eu lieu la mutation grâce a la séquence de l'ADN-T que l'on connait (via ses régions flanquantes).  [...]

[Biologie Moléculaire] Nombre exact de gènes humains

Les publications initiales suivants la fin du Projet Génome Humain, basées sur des résultats préliminaires, faisaient état d'un maximum de 28.890 gènes pour l'International Human Genome Sequencing Consortium ( Nature, 15 février 2001 ) et d'un maximum de 26.  [...] Donc, en octobre 2004, on obtenait une estimation de jusqu'à 21.787 gènes codants pour des protéines, dont 19.599 (90%) étaient formellement identifiés. On avait aussi identifié 341 trous dans la séquence connue qu'il fallait encore déterminer.  [...]

[Biochimie] Empreinte à la DNase+ TAMOXIFENE

Tout d'abord je ne suis pas totalement sure d'avoir compri comment on detecte une sequence ENHANCER ou SILENCER par la DNASE footing prints. Dapres mes notes les regions ENhancers ont beaucoup de Proteines regulatrices donc sont peu accessible a la DNASE, qui donc ne coupe pas cette sequence.  [...] Pour détecter une séquence enhancer ou silencer d'un gène d'intérêt, il faut démontrer que la délétion ou la mutation de la séquence entraîne une modification de l'expression du gène régulé (ou du rapporteur ayant pris la place du gène).  [...]

[Biologie Moléculaire] Design de sonde Taqman à partir d'une sonde FISH

Ma suggestion était de prendre la séquence de la sonde FISH, faire des blast et ressortir les séquences des régions 16S des bacteroides ssp., faire des alignements de séquences et ressortir une séquence consensus. A partir de cette séquence consensus, je pourrai designer la sonde Taqman et les amorces, mais il ne veut pas cette suggestion.  [...] Je cherche un software permettant de designer des sondes polynucléotidiques pour réaliser un Gene-FISH ( et non pas un FISH taxonomique) à partir de séquences représentant une fonction qui m'intéresse (ici. hydrolase) sur des échantillons de biomasse complexe.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fonctionnement des enzymes

Ca parait être du chipottage mais en réfléchissant un peu sur la question en gagne en profondeur dans la compréhension du rapport séquence -. fonction.  [...] Changer la séquence peptidique des régions déterminants le site actif (conformation, activité catalytique) joue sur la fonction de l'enzyme.  [...]