• Santé - Question, Protéine, Séquence, ADN

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Je me posais une simple question. Comment une protéine (facteur de transcription en général) peut-elle se fixer spécifiquement à une séquence d'ADN.  [...] C'est une histoire de configuration spatial de la proteine (structure quaternaire) et de la disposition dans l'espace de la séquence d'ADN qui est n'est pas linéaire ainsi la tata box qui est en amont est pourtant proche spacialement parlent du site d'initiation.  [...]

[Biologie Moléculaire] séquences régulatrices

Je pensais à isoler la séquence en utilisant une banque d'ADN génomique et vérifier que la séquence isolée est la bonne en fusionnant un gène rapporteur (qui coderait pour la protéine GFP, par exemple) et d'en vérifier l'expression dans le tissu en question.  [...] Il y a de l'idée. En premier lieu, je suppose que tu compte isoler ta séquence depuis une banque d'ADN génomique par PCR...Dans ce cas, une fois ta séquence amplifiée, un séquençage est la première chose à faire. En effet, dans le cas où tu n'isole pas la bonne séquence, la fusion avec un gène rapporteur peut te donner un résultat faux-positif (ou faux-négatif si un problème survient pendant la réalisation de la construction).  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Comment une protéine spécifique peut elle reconnaitre une séquence de paires de bases si celles ci ne sont pas directement accessibles ( puisque l'ADN ne présente pas les bases à l'extérieur de sa structure ).  [...] Ah...c'est un autre sujet mais il pose toujours la question de la spécificité d'action. J'aimerais bien que tu m'en dise plus là dessus, puisque la protéine qui déloge les bons histones doit forcément reconnaitre une séquence spécifique d'ADN qui est cachée par les histones.  [...]

[Biochimie] Colinéarité gène protéine chez les procaryotes

* ensuite pour les ARNr et t en fait se sont des ARNpré r et pré t qui sont synthetisé, donc il y a de l'ARN transcrit qui sera ensuite enlevé. d'ou ma question pourquoi parle t-on alors de colinéarité gène/ protéine alors que des séquence d'ADN codante sont bien transcrit mais inutiles à la sd protéique.  [...] Le terme de colinéarité se réfère, je crois, au fait que les gènes prokaryotes ne comprennent ni introns ni exons et peuvent donc se superposer en terme de séquence à la séquence protéique.  [...]

[Physiologie] phage lambda

si on introduit l opérateur droit du phage lambda dans une bactérie dont le milieu de culture contient du glycérol comme seule source de carbone,la protéine CI est elle synthétisée.  [...] Un operateur est une simple sequence d'ADN reconnue par des protéines... je doute que ta question ait vraiment du sens.  [...]

Gel Shift : problème avec la compétition

Ca arrive souvent qd tes conditions ne sont pas optimales et/ou que l'affinite de ta proteine pour l'ADN est tres important. Tu peux essayer de mofier la composition du tampon de shift. Es tu sure que ta proteine se fixe sur cette sequence d'ADN Comment l'as tu identifiee.  [...] D'autres études ont montré que ma prot liait une séquence d'ADN X et que cette fixation était spécifique. J'ai reproduit ses manip avec ma séquence d'ADN Y pour savoir si il y avait également fixation. J'ai obtenu un retard sur gel similaire mais pour des quantités un peu supérieures de protéine.  [...]

Question : analyser une protéine

Attention qu'analyser la séquence primaire d'une protéine ne permet pas nécessairement d'en déduire sa séquence nucléotidique correspondante. l'expression des gènes va impliquer d'une part un épissage et une maturation de transcrits ARN, mais également, pour chaque peptide correspond un jeu de codons ARN quelque peu différents.  [...] à vrais dire j'ai posté une autre question sur le forum où je demandais comment analyser une protéine responsable d'une réaction dans un anabolisme (bon il n'y a pas encore eu de réponses haha). Du-coup après avoir analysé cette protéine je voulais le cheminement pour déterminer quel séquence d'ADN la codait.  [...]

ADN, proteines et mutations

Dans le meme etat d'esprit, une molecule écourtée par une de ces mutations va crée une sequence d'ADN qui ne codera pas de proteine, jusqu'au premier codon initiateur. Dans le cas où il s'agit du codon pour la proteine suivante normale cela ne pose pas de probleme.  [...] Dans le meme etat d'esprit, une molecule écourtée par une de ces mutations va crée une sequence d'ADN qui ne codera pas de proteine, jusqu'au premier codon initiateur.  [...]

tripeptides?gene et ARN?

En fait, lorsqu'il te demande d'écrire un model du code, il n'y a pas vraiment besoin d'inclure un codon STOP et un codon START car je pense qu'il parle de la séquence brute, extraite du génome. Donc je comprend la réponse à la question 2). En ce qui concerne la question 3), là c'est different parce qu'il te demande d'écrire la séquence d'ADN et donc il te faut obligatoirement un codon STOP et un codon START car fonctionelement c'est indispensable vu que tu écris une séquence d'ADN.  [...] ...puisque que la séquence brute de la protéine n'est pas concernée de façon directe, par les codons START et STOP...CAR ELLE N'EST PAS INSEREE DANS L'ARN (je parle de la question 2)).  [...]

Génome humain

Pour la seconde question, la réponse est la régulation de la transcription. L'ADN humain possède quelque 20-25000 gènes. Ils ne sont pas exprimé en permanence ensemble dans une cellule au même moment (heureusement), mais certain sets de gènes vont être activés, produire la/les protéine(s) voulue(s), puis inactivés, avec des cycles (ou pas).  [...] Mais pour répondre à ta question, on peu voir les gènes comme des portions même d'ADN, répartit tout le long de cette molécule (se chevauchant, se confondant etc). Imagine toi une séquence d'ADN, celle-ci forment un ou plusieurs gènes. Cette séquence n'est qu'une portion de ta molécule d'ADN (séquence totale).  [...]