• Santé - Qualité, ADN, Extraction

[Biotechnologie] temps pour les différentes étapes séquençages

c'est à dire extraction ADN, amplification, construction des banques et le controle qualité.  [...] j'aimerai également savoir le temps générale qu'il faut pour aller de la construction des librairies au traitement des données.   [...]

Extraction d'ADN bactéries lactiques

Je cherche un bon protocole d'extraction de l'ADN total des bactéries lactiques. je voudrais savoir aussi par quelle technique obtient-on un bon rendement et une bonne qualité d'ADN.  [...] l'ancien protocole (lyse enzymatique) me semble très long, mais est il efficace ou l'utilisation des kits est meilleure.   [...]

qualité d'ADN

j'ai fait l'extraction de l'ADN et pour vérifier sa qualité et je trouve donc la valeur du rapport 260/280=2,4.  [...] Le 260/280 donne la pureté en composé protéique et on a l'habitude de considérer qu'il doit être aux environs de 1,8. Si le rapport est plus grand, cela signifie que la proportion d'ADN est plus importante que celle de protéine. Généralement (pour des PCR par exemple) je ne me tracassais que si le rapport était plus bas que 1,8, mais sans doute existe-t-il des cas où il ne faut pas qu'il dépasse la valeur seuil.  [...]

Problemes de PCR

Je suis stagiaire dans un labo de recherche, où je realise des PCR dans le but de détecter de l'ADN proviral integré dans de l'ADN génomique extrait à partir d'organes de souris.  [...] Le probleme ne vient pas de l'extraction de l'ADN puisque je verifie la qualité de celui-ci sur gel d'electrophorese et les concentrations obtenues sont correctes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Construction d'une banque d'ADNc

contrôle-qualité de l'ADN recombinant. transformation dans E. coli, sélection des clones recombinants et extraction du vecteur d'expression.  [...] Ensuite, une fois que tu as tout ça, tu transformes pour voir des phénotypes associés à des mutations, des sauvetages de phénotypes ou ce que tu cherches De toute façon, tu conserveras ton ADN en tube après son extraction, pas dans des cellules.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR positive puis négative

On peut imaginer beaucoup de choses. mauvaise qualité de l'extraction, présence d'inhibiteurs (tu fais tes PCR sur ADN ou sur colonies), ou de la présence de contaminations la première fois.  [...] Essaie peut-être de baisser un peu la température d'annealing, et compare aussi avec des ADN plasmidiques extraits. C'est du boiling que tu fais non.  [...]

Et revoilà le clonage de mammouth !

Les membres de l'expédition ont, rapporte l'AFP, réussi à colorer les noyaux, probablement, peut-on en conclure, avec les réactifs utilisés pour mettre en évidence l' ADN. Les tissus seraient donc exceptionnellement bien conservés, laissant espérer l'extraction d'un matériel génétique de qualité.  [...] Outre qu'il faut être certain de récupérer la totalité de l'ADN (rappelons que nous avons plus de 98 % d'ADN avec les chimpanzés...), il faut encore préparer ce matériel génétique pour qu'il ressemble à des chromosomes. Quant à récupérer un ovocyte au bon stade sur une éléphante, la tâche est probablement très difficile, tout autant que l'injection de l'ovule fécondé, au point que l'idée est venue de passer par.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR quantitative

2. D'où 2ème problème. il peut arriver que l'efficacité de la PCR soit différente entre la PCR sur la gamme standard et la PCR sur l'échantillon. Notamment si les conditions/méthodes d'extraction d'ADN sont différentes, tu peux avoir des contaminants différents qui vont influer différement sur l'efficacité de PCR, et donc l'utilisation de la gamme standard sera un peu faussée.  [...] DONC. tout dépend de la précision requise, du type de matrice (ADNc, ADN génomique,...), de l'origine des échantillons (végétal, animal, bactérien) et de la qualité d'extraction des acides nucléiques.  [...]

Besoin d'avis pour optimiser extraction d'ADN à partir de tissu FFPE en vue d'une CGH

Dans le cadre de mon stage de Licence, je suis censé, dans un CHU, développer une méthode de CGH sur tissus FFPE (les profils, observés à l'aide du logiciel CytoGénomic, sont ininterprétables). Je dispose donc d'un protocole de base, mais, ayant commencé les manips cette semaine, malgré une extraction ayant conduit à une quantité plus que suffisante d'ADN (déterminée au nanodrop), notre marquage à la cyanine (random priming) à très mal fonctionné sur l'ADN du patient.  [...] J'ai donc fait pas mal de biblio et il semblerait (d'après Burcu Sengüven et al.. Comparison of Methods for the Extraction of DNA from Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Archival Tissues), que l'étape qui influence le plus la qualité de notre ADN est l'étape d'extraction.  [...]

[Génétique] problème d'extraction d'ADN

t'as vérifié ton ADN en le chargeant drectement pure sur gel, directement après extraction, et répété la manip quelques jours après extraction.  [...] ouii je vérifie la qualité de mon ADN directement après chaque extraction et les ratio de puretés sont bons autour de 1.8 mais enfaîte je conserve mes ADN dans un simple congélateur à -4 ° et même je ne met pas des inhibiteurs d'ADNase puisque j'utilise un kit d'extraction et pas un protocole de CTAB dont je peux mettre le Mg + EDTA.  [...]