• Santé - Puces, Sondes, Génome

[Génétique] Technique Microarray = puce à ADN

je ne suis pas un spécialiste, mais il existe différents types de puces. Certaines contiennent des sondes pour quelques gènes particuliers regroupés par thème, en tout cas toutes les puces ne sont pas faites pour contenir des sondes pour tout un génome.  [...] Certaines puces utilisées dans l'hybridation génomique comparative (CGH array) couvrent tout le génome. Cependant, il y a toujours des trous entre 2 sondes.  [...]

detection de germes pathogènes

Ensuite il reste a faire baigner cette lamelle de verre dans un bain contenant une sonde correspondante a un gene specifique de l'organisme. ainsi en fonction des signaux détectees on est capables de dire si les genes de l'organisme considérée était présent dans l'échantillon analysé.  [...] Sinon, les puces à ADN ont un avenir certain en bactério de routine (que ce soit médical ou agroalimentaire). Il suffira simplement d'obtenir des puces sur lesquelles sont fixées des sondes spécifiques du génome de telle ou telle bactérie puis d'effectuer une hybridation à partir d'un extrait d'ADN du prélèvement à analyser.  [...]

Ion Proton, la machine automatique à séquencer l'ADN

Il est époustouflant, dit un jeune banquier qui a trouvé les débats scientifiques du Forum plus attrayants que les sujets économiques. Rothberg, bonnet de ski sur la tête et chemise rayée aux couleurs vives, explique que sa trouvaille permet de passer de la tâche laborieuse du séquençage du génome humain à l'ère des puces à semi-conducteurs.  [...] J'ai réalisé alors que j'étais moins intéressé par le génome humain en tant que concept abstrait que par celui de mon propre fils, raconte-t-il. Il me fallait une technologie adaptée. Et pendant qu'il était en soins intensifs, j'ai eu l'idée des puces à semi-conducteurs.  [...]

DNAchip

Non dans mon cas aussi c'est pour comparer l'expression dans deux populations cellulaires(l'expression de nombreux genes et non pas d'un seul gène) mais ce que tu appelles sondes dans ton petit 2, moi je l'appelerai plutôt cibles.  [...] En fait la technique que je décris est la technique des puces affymetrix et les sondes utilisées sont des oligonucléotides synthésisés par photolithograghie (et il y a beaucoup de sondes synthésisées et non pas une seule.) alors que dans ta technique les sondes sont des ADNc obtenus après amplification par PCR.  [...]

Découverte d'une infertilité masculine génétique

Pour en découvrir les causes génétiques, l'équipe dirigée par Pierre Ray et Christophe Arnoult (CNRS/Université Joseph Fourrier de Grenoble), a analysé à l'aide de puces ADN, le génome de 20 hommes souffrant de cette affection. Ils ont découvert que 75 % des patients avaient en commun une altération génétique.  [...] Ces travaux [pourraient] permettre de proposer un diagnostic génétique pour les patients porteurs de spermatozoïdes globozoocéphales. Et à terme, d'imaginer des solutions thérapeutiques contre ce syndrome, concluent les auteurs. À suivre donc.   [...]

La vache est séquencée !

L' espèce Bos taurus aura résisté longtemps. Alors que le poulet et le chien ont déjà laissé les biologistes admirer leurs génomes, ce mammifère bovidé plus connu sous les noms de vache et de taureau a donné du travail. Pour venir à bout de son ADN et, surtout, des génomes des multiples variantes génétiques que près de dix millénaires d'élevage ont façonné dans le monde, trois cents scientifiques, issus de vingt-cinq pays, se sont regroupés dans un consortium, sous la direction du Centre de séquençage du Baylor College of Medicine, à Houston (Etats-Unis).  [...] L'explication viendrait de la durée de vie plus courte d'un rongeur et donc de la succession plus rapide des générations, favorisant la modification du génome au fil du temps. Les souris et les rats évoluent plus vite que les primates et les ruminants.  [...]

[Biologie Moléculaire] Puces à ADN

Les puces sont fabriqués par des ordinateurs, des sondes simple brin de séquences connu sont fixées sur une puce. ça permet une étude massive du transcriptome(alors qu'un northern peut mettre en évidence un seul transcrit).  [...] Les couleurs rouge et verte correspondent aux résultats de la comparaison des profils d'expression. Dans un cas, le ou les gènes sont surexprimés, dans l'autre ils sont sous-exprimés. Quand c'est orange (vert+rouge), les profils d'expression sont comparables.   [...]

[Génétique] puces à ADN

J'ai cru comprendre que l'on doit tout d'abord fixer sur la lame de la puce des fragments d'ADN des gènes d'interets (mais je ne comprends pas bien comment on fait.. doit-on connaitre le génome de la cellule pour pouvoir ainsi sélectionner les gènes recherchés).  [...] Y à t-il un moyen qui permettrait d'utiliser ces micropuces sans connaitre le génome de la cellule Et qui permettrait alors de détecter des nouveaux gènes impliqués dans la toxicité embryonnaire.  [...]

Alerte virale : le virus du Nil arrive en France

Le réservoir naturel de ce virus semble être les oiseaux, mais aucun cas de transmission entre homme n'a été répertorié. Ce virus est très répandu en Afrique, au Moyen-Orient et en Asie, mais il n'a fait son apparition aux Etats-Unis qu'en 1999.   [...] Cependant, les épidémiologistes indiquent que ces réseaux n'ont pas permis de prévoir les deux cas recensés récemment. Il est donc urgent de mener des études sur le terrain, afin de déterminer si ces deux contaminations sont anecdotiques, ou si elles ne représentent que la surface de l'iceberg.   [...]

Les puces génomiques entrent dans l'ère du ''tout en un''

La technologie de la puce à ADN permet d'étudier les quelque 30000 gènes d'un échantillon de tissu humain afin de repérer lesquels sont actifs. les scientifiques peuvent ainsi mieux connaître les mécanismes d'une maladie en comparant l'activité des gènes d'un poumon malade par exemple avec celle d'un organe sain.  [...] Cette avancée technologique permettra d'accroître la vitesse d'un test devenu en quelques années une pierre angulaire de la recherche biomédicale. Elle devrait également faire baisser les prix. Affymetrix a annoncé qu'elle facturerait ses puces entre 300 et 500 dollars l'une, suivant le volume de la demande, soit un peu plus de la moitié d'un système deux puces.  [...]