• Santé - Puces, Protéines, Interactions

[immunologie] Réaction antigène-anticorps

Chip (et non ship) est le terme anglais pour puce. Il existe des puces à ADN pour étudier les hybridations, des puces à protéines pour les interactions protéiques dont par exemple les interactions Ag/Ac. Sur une surface fonctionnalisée, l'Ag (pour cribler des Ac) ou des Ac pour indentifier des Ag sont liés chimiquement.  [...] Sur cette surface fonctionnalisée est ensuite envoyé l'échantillon à tester. Suivant le marquage (fluorescent souvent) et à l'aide d'une caméra de détection et d'un logiciel d'analyse d'image, il est possible de visualiser les spots qui réagissent...plusieurs milliers de spots peuvent être déposés sur une lame.   [...]

diagnostic prénatal technique

les séquences pathogènes connues ont été déterminées empiriquement et sont recensées dans des banques de données. On peut séquencer une protéine mais je ne suis pas sûr que ça se fasse beaucoup en diagnostique. De plus, passer d'une séquence de 20 lettres à 4 lettres implique plusieurs possibilités (cf code génétique).  [...] Pour le diagnostique, on fait souvent (je pense) des PCR suivies de séquençage pour un certain nombre de gènes connus pour être impliqués dans certaines maladies. Il existe aussi des puces à protéines (même principe que les puces à ADN pour caractériser les interactions protéiques).  [...]

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

Ce papier a pu faire un Science car les autres puces protéomiques n'avait pas ce nombre de protéines testées, ni cette sensibilité en 2001. De plus, cette puce permet d'observer les interactions protéine-protéine, mais également protéine-lipide (pour le transport des lysosomes, par ex), ce qui est complètement nouveau à cette échelle.  [...] Ce sont les noms des protéines. Sur le côté gauche, tu as le nom des protéines interagissant avec les lipides, en haut à gauche, le type de lipide, au milieu la quantification de l'interaction (la séparation fort ou faible vient de se paramètre), à droite la localisation de la protéine dans la membrane cellulaire, si c'est une kinase ou si sa fonctio est inconnu.  [...]

[Biologie Cellulaire] Biologie systémique

La biologie des systemes est un champs tout bebe En fait, il s'agit de ne plus s'interesser a un gene et son regulateur ou a une cascade, mais a plusieurs cascades liees. Comme tu l'imagines, les genes interagissent entre eux, certains plus que d'autres. Pareil pour les vois metaboliques.   [...] Les moyens d'etude... Beh deja, les puces d'expression l'etait pour l'etude du transcriptome. Ensuite, tu as differentes facons d'etudier les interactions proteine-proteine, d'etudier le metabolome, etc.  [...]

qui connait les puces a proteines ou microarray protein ?

qui connait les puces a proteines ou microarray protein.  [...] l'un d'entre vous a t'il deja eu l'ocassion de se servir de ce type d'appareil si oui pourriez vous m'aider.   [...]

Les puces à protéines

4- Comme on connait les différentes couleurs (c'est à dire les chelates et donc les protéines qu'ils fixent) on pourra savoir quelles st les protéines qui st présentes dans le mélange duquel on a extirpé les spots protéiques initialement.  [...] Mais là ou je comprend pas c'est que si je suis ce raisonnement alors il y a des spots protéiques initiaux identiques alors que moi je crois que tous les spots correspondent à des protéines différents (autrement dit 1 protéine spécifique à 1 spot).  [...]

[Biochimie] Epigénome et immunoprécipitation

Une fois fait, on enlève l'effet du formaldéhyde en chauffant et on détache les protéines, les séquences de DNA récupérée sont des séquences fixant des protéines. On peut soit les séquencer à ultra haut débit soit les hybrider sur des puces pour voir à quoi elles correspondent.  [...] Ha oui en effet. en fait les anticorps interviennent dans cette technique pour récupérer le DNA sur lequel sont fixées les protéines. On ligue des anticorps spécifiques de ces protéines (ici spécifique des histones modifiées sur leur queue aminoterminale) les anticorps sont eux même liés à des molécules de Sépharose, ce qui permet de récupérer le tout par centrifugation/précipitation.  [...]

Biographie | Bertand Jordan - Généticien moléculaire | Futura Santé

Après une formation initiale de physicien (Doctorat de Physique des particules en 1965), j'ai fait toute ma carrière de Biologie Moléculaire, pour l'essentiel au CNRS, de 1967 à 2000. J'ai donc vécu cet âge d'or de la biologie qui a complètement transformé nos connaissances et nos moyens d'intervention dans le monde du vivant.   [...] Dans le monde industriel, j'exerce des activités de conseil auprès de différentes entreprises de biotechnologie et fais partie de conseil scientifique de trois d'entre elles, Ipsogen SA, implantée à Marseille et travaillant dans le secteur des tests de diagnostic et de pronostic pour le cancer, Pamgene, entreprise hollandaise qui a mis au point un système très évolué de puces à ADN et à protéines employé dans l'industrie pharmaceutique et pour le diagnostic, et Phalanx firme taiwanaise qui produit des puces à ADN principalement utilisées en recherche fondamentale.  [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

Une autre partie de l'explication réside dans l'application de la banque d'ADNc. Tu auras toujours besoin d'une telle banque pour des cribles d'intéraction, de fonction, etc.  [...] je parlais des fonctions et des intéractions si on veut par exemple savoir quelle sont les protéines qui s'expriment dans X condition on peut le savoir à partie des ARNm marqués dans les deux conditions différemment (a jeûn et nourris, par exemple) et avec une puce à ADN on peut voir les intéractions pareille pour la fonction sauf quand utilise le northern blots(avec la sonde radioactifs).  [...]

Génétique des épilepsies : interview de Pierre Szepetowski | Dossier

De manière schématique, on peut imaginer définir à partir des gènes et protéines identifiés, des cibles thérapeutiques pour de nouveaux médicaments, ou mettre au point des stratégies de thérapie génique dont la faisabilité et l'efficacité restent à étudier.  [...] l'étude de populations de sujets atteints non apparentés, en comparant leur matériel génétique avec des sujets sains. et la recherche sur puces à ADN de réarrangements chromosomiques ( délétions, duplications). D'une manière générale, on peut s'attendre dans le futur à des progrès dans la compréhension des interactions existant entre facteurs génétiques, une fois ceux-ci identifiés, et facteurs environnementaux.  [...]