• Santé - Protéine, Localisation, Fonction

[Biologie Moléculaire] Méthodes d'étude de l'ADN

Le but de cette était de vérifier la production de SC35GFP, et surtout vérifier son poids moléculaire ainsi que la quantité relative vis-à-vis de la protéine SC35 native. On a donc put en conclure que la protéine SC35 n'est pas trop sur-exprimé (2-3 fois plus dans les cellules SC35GFP+) et que cette sur-expression est stable dans le temps.  [...] Ajoutons à cela une IF, et on observe que la protéine SC35GFP à une distribution caractéristique des speckles, corps nucléaire où elle se trouve en majorité. On dispose donc d'une protéine fusion probablement fonctionnelle (vu que sa fonction est liée à sa localisation).  [...]

Une mutation arginine-alanine mime une methylation?

Je souhaite savoir si une mutation d'arginine en alanine mime ou non une méthylation.   [...] En effet, je dois effectuer des mutations dans une proteine afin de connaitre l'effet de la méthylation sur sa localisation cellulaire et sa fonction.  [...]

[Biochimie] Trouver la fonction d'une protéine avec sa structure primaire

la fonction d'une protéine est liée a son organisation spatiale. Sa structure tridimentionnelle est en partie liée a la structure primaire. Tu dois pouvoir comprendre comment la structure primaire peut te donner des indices sur la structure. Il faut raisonner en domaines d'organisation particulière qui permettent une structure particulière, conférant une localisation ou une fonction particulière... Tu vois ou je veux en venir.  [...] En fait je pense qu'on demande surtout une réponse généraliste sur la façon de déterminer la fonction d'une protéine à partir de la structure primaire parce que la question est posée tel que je l'ai marqué acron ne connait pas la structure primaire on sait juste qu'on l'a et moi je bute sur ça, les étapes qu'il faut pour connaitre la fonction selon la structure primaire.  [...]

Problème de biologie moléculaire

Donc, mon idée c'est que l'on parle là de facteurs de transcription, d'où leur localisation. On peut ensuite imaginer que si c'est un repressor on aura moins d'une proteine trans-membranaire X de transport et donc désquilibre osmotique. Idem avec le fait si c'est un activateur et qu'on a trop de protéines de transports, équilibre aussi perturbé (prenons le worst case scenario).  [...] Ensuite, pour prouver que la localisation contribue au phénotype... Je ferai une modif' rapide au gène, j'y ajouterai un TAG de signal d'exportation nucléaire, ensuite je pourrai vérifier à l'aide de a GFP que la protéine ne se trouve plus dans le noyau et grâce à un test d'intégrité de la membrane au Calcium (classique), je pourrai vite voir s'il y a une différence entre la cellule avec le facteur exporté et non exporté du noyau.  [...]

[Biologie Moléculaire] Quelle stratégie adopter?

Pour se faire j'ai construis deux vecteurs, le premier contient un promoteur fort puis la PG1 et la GFP et le deuxième contient un promoteur fort puis la SIRT1 puis la luciférase je réalise un BRET en excitant la luciférase avec coelenterazine j'ai donc fluorescence de la GFP j'ai donc bien montré l'interaction or le professeur me demande de faire un test de localisation puis un test de fonction de la proteine endogène pour cela est ce que je dois prendre des cellules hépatiques non transfectées comme temoin pour la localisation il me semble qu'il serait judicieux de faire une immunohistochimie mais est ce que je detecte les 2 proteines dans la meme cellule et ceci avec 2 anticorps différents couplés avec une fluorescence différenteet pour la fonction je ne sais pas dutout d'autant plus qu'il faut savoir si la proteine chimerique modifie les fonctions endogènes de la proteine pour ca je netrouve pas de strategies.  [...] et comparer la localisation et l'intensité de fluorescence donc cela serait suffisant pour voir si la proteine chimérique modifie les fonctions endogènes selon toi.  [...]

[Biologie Cellulaire] Mise en évidence de protéines membranaires

Bonjour, je suis actuellement bloqué sur une démonstration de la localisation des protéines (si elles sont transmembranaires ou périphériques) il est marqué dans mon cours.  [...] Tu auras donc d'autres techniques pour les autres cellules telles que la cryofracture (pour la localisation et la mise en évidence), l'électrophorèse des protéines membranaires solubilisées (pour la taille et le nombre d'unités,...), la modélisation (fonction, structure qui peut être un indice sur la nature de la protéine (plus d'hélices alpha et de feuillets béta chez les P trans-membranaires...),  [...]

[Biochimie] Poids plus élévé après digestion enzymatique

J'aurais encore une petite question si cela ne vous embête pas trop. Suite au séquençage de mon ADN, j'ai constaté qu'il y avait une mutation de Asn en Asp. Ces deux acides aminés presente une chaine de la meme longueur, ils peuvent les deux faires des liaisons H par contre il y en a un qui est neutre et l'autre acide.   [...] Concernant ta mutation, impossible de répondre. Ca peut très bien n'avoir aucune incidence sur la fonctionnalité de la protéine comme ça peut la rendre totalement inopérante. Le point critique c'est la localisation de cette substitution dans la structure 3D de la protéine.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéine Iba-1: localisation intracellulaire ou membranaire chez la microglie?

Depuis un moment maintenant, je me pose la question de la localisation de cette protéine Iba1 (ionized calcium binding adaptor molecule 1) au niveau des cellules microgliales. Connu pour être l'un des marqueurs spécifiques de ces cellules et des macrophages, j'aimerai vraiment savoir dans quel compartiment elle se trouve.  [...] En dehors de la localisation de son gène, je n'ai pu trouver aucune information concernant la protéine. Je n'ai également rien trouvé sur des publications.  [...]

différence dénaturation protéine et dénaturation enzyme

(Ribozyme célèbre. Peptidyl-transférase. enzyme constitué de rRNA (uniquement) présent dans un ribosome(rôle. synthèse des protéines grâce à l'assemblage d'acides aminés) dont la fonction est de synthétisé les liaisons entre Acides Aminés. Localisation de la Pept-trans.  [...] grande sous unité du ribosome. La réaction catalysée est une synthèse d'une liaison peptidique. donc de la contraction entre un carboxyle et un amine. ça donne liaison amide. ceci, sans l'intervention directe de protéine mais pourtant avec catalyse enzymatique).  [...]

le chew-gum

En dehors de son rôle de réserve énergétique, cette localisation a pour fonction de protéger la région anale, et de rendre la position assise plus confortable en évitant le contact direct des os (tubérosités ischiatiques) avec le sol ou un support.  [...] Ce genre de présentation finaliste fait toujours sourire, mais je ne pense pas que Theillard de Chardin aurait repris à son compte le judicieux placement des masses adipeuses.   [...]