• Santé - Promoteurs, Bactéries, ADN

Définition exacte d'un promteur.

Je recherche la définition exacte d'un promoteur, en particulier chez les bactéries. Les sources se contredisent, que ce soit dans mes cours, dans les livres ou sur internet.  [...] Pour certains, cela semble être la séquence d'ADN recouverte par l'ARN polymérase lorsque celle-ci se fixe à l'ADN (au niveau de la séquence -35 chez les bactéries). Si c'est effectivement le cas, la taille des promoteurs bactériens devraient être constante non Ce n'est pas ce qui ressort des différents schémas. Et de où à où s'étend cette séquence.  [...]

[Journal club] Reponse strigente et regulation globale de l'expression

Chez les bacteries une seule ARN polymerase (ARNP) est responsable de la synthese de tous les ARN. En croissance rapide, environ 95% des ARNP sont engagees dans la transcription des genes controles par des promoteurs forts dits stringents (ARN stables, facteur sigma majeur, etc.  [...] Est-ce que cet élégant modèle, montré chez E. coli, a été retrouvé chez d'autres bactéries D'autres part, comment se produit le surenroulement au niveau des promoteurs chez les bactéries Si ce surenroulement est provoqué de manière spontanée grâce à la capacité de l'ADN à former des structures secondaires, est-il possible de retrouver ce mécanisme de régulation chez des bactéries thermophiles (si ce n'est pas déjà fait ).  [...]

soutern, PCR, banque genomique

en fait on intègre le morceau d'ADN inconnu dans un ADN bactérien dont on connait la séquence. On mettra donc des promoteurs qui reconnaîtront cet ADN bactérien.  [...] oui, il n'existe pas d'amorce universelle utilisable pour n'importe quel ADN. Il me semble qu'on peut en utiliser par exemple des amorces universelles communes à un genre bactérien. Ces amorces se fixent sur une région conservée de l'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problème transfo...

Non, l'une des extrémités est coupée par BamHI, l'autre par NcoI. Ceci n'explique d'ailleurs toujours pas l'histoire du plasmide fantôme... Pour moi, c'est une contamination. mes bactéries ont choppé une MST.  [...] Par contre bacillus est un gram+, donc un %GC plus faible que E. coli. Quand je bossais sur une bacterie a faible %GC, j'avais souvent des problemes d'expression (les sequences a haut taux de AT sont souvent reconnues a tort par coli comme etant des promoteurs), voire de mutations, ou de duplications (les ADN/ARN pol de coli n'aiment pas les succession A/T).  [...]

[Evolution] question du jour

En ce qui concerne l'ADN non informatif, il me semble qu'il permet d'établir une distance physique entre 2 régions promotrices et donc cette distance diminue la probabilité, pour un facteur de transcription, de se lier au 2 promoteurs. Si ces 2 promoteurs sont proches alors ils entrent en compétition pour le facteur de transcription ce qui est moins le cas lorsque les promoteurs sont éloignés.  [...] Je me suis mal exprimé. je ne voulais pas parler de symbioses ni de protozoaires ni de métazoaires. Je voulais juste savoir si les premières traces de vie sont des traces laissées par des organismes multicellulaires, c'est à dire par des bactéries ayant adopté un mode de vie en colonie, en biofilm.  [...]

Comment les protéines et l'ARN peuvent-ils agir sur les genes?

Certaines protéines appelées promoteurs peuvent venir se fixer sur l'ADN, sur certains secteurs spécifiques à proximité de gènes particuliers. Ces protéines vont faciliter la fixation à cet endroit de l'ARN polymérase, et donc accélérer la transcription en ARN.  [...] Certaines protéines appelées promoteurs peuvent venir se fixer sur l'ADN, sur certains secteurs spécifiques à proximité de gènes particuliers.  [...]

[Génétique] Brassage intrachromosomique tout est une question de vocabulaire

Autrefois persuadé que le brassage intrachromosomique ayant lieu en prophase 1 était un échange d'ADN (codant ou non) entre brin des différentes paires, je lis aujourd'hui dans plus de 50% des cas que c'est des échanges de gènes.  [...] Echange de gène n'implique pas qu'il n'y ait pas d'échange d'ADN non codant. Il y a les promoteurs et régulateurs... Mais échange d'ADN est un meilleur terme pour décrire le phénomène.  [...]

régulation de l'expression génique

Regulation pas les sytemes classiques activateur/represseur se liant aux regions operatrices des promoteurs sur l'ADN.  [...] merci pour tes réponses, c beaucoup plus clair grace a toi. (ça confirme mes convictions personnelles qui étaient sérieusement mises à mal a force de faire des QCM ).   [...]

Génétique humaine

Puis quant à l'ADN issu de H. neandertalensis, on ne lui a peut-être pas trouver d'ARNm rattaché, mais ça n'implique pas du tout qu'il serait silencieux parce qu' a priori non codant. Les promoteurs par exemple ne sont pas des structures ADN codantes et pourtant elles influent plus ou moins fortement sur la transcription ADN-ARN.  [...] Ajouté à cela les sites de méthylations comme les CpG, qui peuvent être situés aussi bien dans un gène, que sur un de ses promoteur - ou à proximité.  [...]

[Biologie Moléculaire] Quelques questions de biologie moléculaire

n'étaient pas transcrits et servaient juste à la fixation de l'ARN pol, comment retrouver la région non-traduite en 5' alors Et je viens de voir que ma question est un peu un doublon avec la région Shine-dalgarno chez les bactéries car shine-dalgarno fait partie de la région non-traduite en 5' je crois.  [...] Côté eucaryote on a les pol ´ et pol µ à creuser, ou l'ADN-pol III pour les bactéries. Faut que je vérifie, mes cours remontent à quelques années déjà ^^.  [...]