• Santé - Pratique, Protéines, Membrane

[Microbiologie] western blotting

Pour avoir une idée de la quantité de protéines sur la membrane vous pourriez la passer au bleu colloidal (ou bleu de coomassie). Vous pouvez essayer aussi l'amidoblack si vous ne souhaitez plus utiliser la membrane ensuite.  [...] Le rouge ponceau est aussi pratique pour vérifier qu'il y a bien des protéines sur la membrane, les étapes de blocages peuvent parfois etre problématiques. J'ai parfois observé qu'un blocage plus court améliorait les signaux.  [...]

[Biochimie] Dot Blot et Northern Blot

Le dot blot c'est un peu l'ancêtre du western blot. On dépose les protéines sur une membrane, ça fait une tache (le dot) et on révèle grâce à des anticorps.  [...] A part la membrane, il n'y a finalement aucune similitude. La question que je ne m'étais jamais posé c'est est ce que l'on a fait des dot blot avec autre chose que des protéines (Je n'ai jamais pratiqué ou vu que cette application).  [...]

[Biologie Cellulaire] Contrôler la pureté des protéines

Comparer un gel au bleu de Coomacie avec un western me parait être une bonne idée mais est-on sur que dans l'extrait protéique il n'y aura que la protéine que l'on veut étudier Si on utilise un anticorps contre notre protéine d'intérêt on ne verra qu'elle mais cela ne veux pas dire qu'il n'y a pas d'autres protéines que l'on ne voit pas.  [...] C'est très pratique pour isoler spécifiquement une protéine car sur une électrophorèse SDS PAGE classique, seule la masse moléculaire est discriminante donc lorsque tu fais une coloration de ta membrane en rouge ponceau, tu observes une multitude de bandes et chaque bande correspond à de nombreuses protéines différentes.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéine ou Chaine Polypeptidique?

Effectivement, il est pratique de différencier des peptides (en quelque sorte, de petites protéines mais sans structure tertiaire) et les vraies protéines, celles avec un nombre d'acides aminés très grand, avec des repliements spatiaux, avec des centres actifs, etc.  [...] il est pratique de différencier des peptides (en quelque sorte, de petites protéines mais sans structure tertiaire) et les vraies protéines, celles avec un nombre d'acides aminés très grand, avec des repliements spatiaux, avec des centres actifs, etc.  [...]

[Génétique] Intron et exon

Je vois que l'editing est important chez le trypanosome... ça a quelque chose à voir avec le camouflage antigénique que pratique la bestiole (si mes souvenirs sont bons les protéines de surface du parasite changent au cours du temps, rendant ainsi inefficace la réaction immunitaire dirigée contre elles).  [...] .. Pourquoi utiliser un système si dangereux plutot que de simplement recopier les différentes séquences pour les proteines ailleurs Sans compter que c'est pas très pratique pour faire évoluer une espèce... En gros, pourquoi l'épissage alternatif existe t'il.  [...]

chromatographie échangeuse d'ions

Pour finir, en theorie tu vas decrocher les proteines dans l'ordre pI=4.5, pI=6 et pI=7.5. En pratique, ca peut etre assez souvent different.  [...] Chaque fonction amine n'a pas la même basicité (pas le même pK). La neutralisation de chaque acide aminé (ou de chaque protéine) se fait successivement. Le pH de charge nulle est obtenuest obtenu quand l'acide aminé est sous sa forme normale (doublement chargée) à l'équilibre entre sa forme acide et sa forme basique.  [...]

[Biochimie] structure primaire

Ceci dit, dans la pratique, c'est très compliqué de prédire la structure des protéines. C'est un grand domaine de recherche en bioinformatique.  [...] Le en partie se réfère au fait que de nombreuses protéines ont besoin en plus de la conformation 3D impliquée par la séquence primaire, d'une maturation au sein du REG / Golgi pour acquérir la conformation adéquate.  [...]

[Zoologie] Sang chaud et sang froid

En pratique, ces mitochondries possèdent des canaux ioniques qui permettent aux ions h+ expulsés hors de la matrice par la chaine respiratoire de retraverser la membrane sans passer par l'ATP synthétase. L'energie du gradient de H+ est donc perdu sous forme de chaleur.  [...] Si je comprends bien, la libération de chaleur s'explique par le passage transmembranaire passif de protons et ceci parce qu'il existe un gradient de proton entre le cytosol et la matrice. Ce mécanisme n'est pas possible chez les animaux à sang froid qui sont obligés de faire intervenir une enzyme.  [...]

[Biologie Cellulaire] Perte de poids en lien avec le DNP (Dinitrophénol)

Dans les années 1940, certains médecins prescrivaient à leurs patients de faibles doses d'un agent chimique appelé dinitrophénol (DNP) dans l'espoir de leur faire perdre du poids. Après le décès de quelques personnes, cette pratique a été abandonnée. Le DNP rendait la membrane mitochondriale interne perméable aux ions hydrogène.  [...] Le DNP est un acide faible liposoluble qui traverse facilement les membranes. Dans un gradient de pH, il fixe les protons du côté acide de la membrane, diffuse à travers celle-ci et les libèrent du côté basique de la membrane, dissipant ainsi le gradient.  [...]

Extraction ADN phenol : température de centri

Je pratique des extractions d'ADN méthode phénol-chloroforme sur des produits alimentaires (bien gras et bien protéinés. C'est d'ailleurs pour cela que je ne prends pas des systèmes de kits et colonnes).  [...] Mais si quelqu'un pouvais m'éclairer sur le rôle de la température (par exemple sur la séparation d'avec les protéines, mais aussi l'extraction préférentielle de l'ADN vs ARN peut-être) ce serai super.  [...]