• Santé - Positions, Fragment, ADN

[Biologie Moléculaire] TP digestion ADN par enzymes de restriction par électrophorèse sur gel d'agarose

Bonjour, merci. Oui bien entendu je sais ce qu'est une enzyme de restriction. Une enzyme de restriction reconnait un site de restriction généralement palindromique sur l'ADN une fois reconnu elle clive. Alors j'utilise un ADN de phage lambda c'est de l'ADN circulaire il me semble mais qu'elle est le rapport avec la migration et oui je sais aussi c'est quoi l'électrophorèse sur gel d'agarose c'est la migration de fragments d'ADN ( dans mon cas) du fait qu'on exerce un champs électrique l'ADN étant chargé négativement va migré du coté positive au niveau de la matrice d'agarose les fragments les plus courts migreront plus vite et plus rapidement mais sa m'aide pas pour l'analyse car on a des bandes linéaire et non pas circulaire.  [...] D'accord donc si j'ai bien compris si je n'obtiens pas de fragments, c'est à dire que je reste avec la molécule d'ADN de départ ça veux dire qu'il n'y a pas eu digestion, alors que si je trouve plusieurs fragments qui sont à des positions différentes car migré de manière différente ça veux dire que mon fragment d'ADN initial a été digérer c'est ça.  [...]

[Biologie Moléculaire] nucleosomes

Lors des nucleosome obilization essay on arrive à séparer sur un gel les différentes positions du nucléosome sur un fragment d'ADN, j'aimerai simplement comprendre pourquoi si le nucléosome est situé en fin de séquence il migre plus loin que si il est situé en milieu de séquence (j'espère avoir été clair).  [...] En revanche quand il est au milieu de part et d'autre tu auras de l'ADN et là le retard plus important. ( -0- ). Tout cela dépend évidement des conditions de migration et la différence ne doit pas être extrême.  [...]

mutagénèse dirigée

Pour la muta dirigée. Elle ne se fait que chez coli, sur un fragment d'ADN cloné dans un vecteur. Tu peux mutageneise plusieurs positions simultanément ou les unes apres les autres.  [...] OK j'ai bien compris mais tu l'obtients comment ton fragment PCR muté vu que la mutation se situe dans le gene et qu'elle ne peut donc pas etre insérée par les oligos utilisés pour la PCR je ne vois pas comment tu peux faire.  [...]

insertion dans un phage

durant mes révisions j ai lu que lorsqu'on insère un fragment d' ADN etranger dans un phage il n'y a qu'une chance sur 6 d'obtenir ce qu'on désire.  [...] Ce qu'il ne faut pas perdre de vue est que tu cherches a faire une protéine de fusion il est donc obligatoire que le fragment d'ADN que tu clones soit dans la bonne pahse de lecture par rapport au gene de la protéin auquel tu le fusionnes.  [...]

[Biochimie] Preparation et analyse de plasmides

donc, avant digestion, on regarde la tête de l'ADN *non digéré* sur gel. Après digestion, on compare. si notre ADN a la même tête, c'est FAIL. si on a des bandes qui correspondent à ce qu'on a calculé d'après les positions des sites de restrictions (les regexp), c'est PASS.  [...] Le nombre de fragments dépend du nombre de site de restriction qu'il y a sur ton plasmide. S'il y a deux sites, tu auras 2 fragments linéaires, 3 sites 3 fragments etc. Le truc c'est que tu auras forcément un mélange des formes non digérées et des formes digérées (voir des formes partiellement digérées).  [...]

La médaille d'or du CNRS pour Jean Weissenbach, un des pères du Généthon

En établissant une carte du génome humain dans les années 1990, Jean Weissenbach a fourni un instrument remarquable aux généticiens du monde entier. Cofondateur du Généthon, aujourd'hui directeur du Génoscope, il vient de recevoir la plus haute distinction scientifique française.   [...] Elle recenserait des régions remarquables, petites séquences d' ADN appelées marqueurs. Sur un génome ainsi balisé, il deviendrait plus facile de déterminer les positions des gènes et, surtout, de localiser ceux que l'on pense être à l'origine de maladies.  [...]

soutern, PCR, banque genomique

JE suis pas sur d'avoir tout compris mais il est tout a fait possible d'aplifier de grands fragments par PCR (jusqu'a 15kb)...on est loin des quelques centaines de paires de bases.  [...] Si tu parles d'amorces dégénérées (le tube contient plusieurs amorces, qui varie en une ou plusieurs positions), tu risques d'amplifier des séquences non spécifiquement. Je ne connais pas d'amorces absolument universelles (amplification de toutes les séquences d'ADN).  [...]

L'activité physique change la régulation des gènes du tissu adipeux

Grâce à des prélèvements de graisse au niveau sous-cutané, les chercheurs ont pu constater l'évolution de l' épigénome au cours du temps. Pour éviter que d'autres paramètres viennent fausser les données, il leur était demandé de vivre dans les mêmes conditions qu'auparavant.   [...] Par l'analyse de plus de 480.000 positions sur le génome, retrouvées dans environ 7.000 gènes différents, les scientifiques ont effectivement constaté des modifications des méthylations sur l'ADN. Ainsi, une carte du méthylome du tissu adipeux a pu être dessinée chez ces patients.  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Dans le premier cas, les protéines n'ont pas besoin de reconnaître un motif particulier de l'ADN. Et qu'est-ce qui n'est pas spécifique dans l'ADN La chaîne principale avec les posphates chargés négativement. Ainsi, beaucoup de protéines non spécifiques comme les histones sont basiques (chargées positivement) et vont dons établir des interactions ioniques avec l'ADN.  [...] Pour l'ADN, les interactions sont différentes selon la base considérée, suivant les différents groupements chimiques qu'elle possède. Elles peuvent toutes établir des liaisons hydogène mais le nombre de ces liaisons peut varier, et les atomes sont donneur ou accepteur d'hydrogène suivant les positions.  [...]

%GC et biais d'usage du code génétique

J'ai crû comprendre qu'en fonction de %GC aux positions 1,2 et 3 et dans différentes région d'ADN on pouvait privilégier telle ou telle hypothèse mais je n'ai pas compris comment on y arrive. Plus généralement je ne pense pas avoir compris les implication du %GC selon sa position.  [...] La position 3 d'un codon ne change pas souvent l'acide aminé ainsi lorsque le %GC3 est très élevé (pourquoi plus élevé que les autres %GC ) peut-on en déduire que cela est dû non pas à un biais mutationnel mais plutôt à la sélection traductionnelle car en conservant le codon dont l'ARNt correspondant est le plus présent dans la cellule la traduction sera plus rapide.  [...]