• Santé - Physique, Modélisation, Comportement, Protéine, Segment, ADN

[Génétique] Ouvrage général de génétique

Je fais de la physique et je travaille sur la modélisation du comportement d'une protéine autour d'un segment d'adn.  [...] Je suis en train de rédiger mon manuscrit et même si j'ai une vague idée (suffisante pour un physicien) de l'intéret biologique, je souhaiterai aller plus loin pour dire le moins de betises possible évidemment et surtout ne pas me tromper dans la portée biologique de ce que je fais.  [...]

logiciel de bioinformatique

Je suis actuellement a la recherche de logiciels de bioinformatique dans le cadre de mes etudes. Si quelqu'un ouvait me renseigner sur les logiciles les plus utilisés ou les plus intéressant pour le travail en bioinformatique dans une société de biotechnologie ce serait sympas.   [...] En gros tu cherches des logiciels de modélisation et des bases de données bioinformatiques (séquences ADN, protéines, etc...).  [...]

Beauté des animaux/végétaux et évolution

Malgré les attaques, merci Cendres car tes réponses sont intéressantes et que tu prends du temps pour me répondre (il y a donc du bon ). Je suis sûr qu'une thèse ou un mémoire à déjà du être écrit sur ce sujet. C'est vraiment très intéressant. Pour l'ADN par exemple, la forme de l'ADN que l'on connaît est très organisée (après c'est peut être une simple modélisation). Je ne suis pas un spécialiste en la matière.  [...] Pour l'ADN par exemple, la forme de l'ADN que l'on connaît est très organisée (après c'est peut être une simple modélisation). Je ne suis pas un spécialiste en la matière.  [...]

Criblage virtuel et "docking"

Pour l'alignement j'arrive a le faire sur Pymol donc pas de probleme, mais merci quand meme. Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...] Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...]

[Evolution] "Grande question"

Méthode physique destinée à s'attaquer à la complexité du sujet par une modélisation de processus dynamiques et aléatoires.  [...] Si ces exemples posent le problème de l'éthique, ils ne le pose pas par rapport au concept de sélection appliquée artificiellement à l'être humain, mais par rapport à l'imposition d'un élément sur des collectivités ou des individus par la force. L'utilisation de la force pour imposer ce genre d'intervention à l'autre, c'est-à-dire sans son consentement, relève du crime.   [...]

Décryptage de comportements animaux pour mes nièces !

Est ce que qqun connait un/des site(s), ou possède des informations, décryptant les comments/pourquois des comportements animaux Par exemple, qui explique la règle des choeurs de grenouilles dans une marre, comment les mamans manchots reconnaissent leurs petits dans les nurseries de plusieurs miliers d'individus, quels mécanismes entre en jeu dans le changement de couleurs d'un caméléon.  [...] Je dirais donc, comme des anthropologues l'ont fait dans les années 1950, tu prend une modélisation d'un homo erectus, d'un pithécantrhope, tu l'habille avec des vetements modernes, et tu comprend le comportement des animaux par comparaison avec le comportement de bestiolles parlantes que nous sommes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fold It! le jeu du repliement des protéines

Ca y est c'est téléchargé et j'ai commencé à y jouer. magnifique... Ils sont arrivés à faire passer des lois de repliement protéique en règles de jeu de façon sublime. L'adaptation des zones hydrophobes, des encombrements stériques et des liaisons hydrogènes en visuel est superbe, digne d'un jeu stratégique.  [...] Ensuite la dynamique de modélisation fait vraiment penser aux logiciels de modélisation moléculaire comme PyMol & Co. Quand on bouge une hélice, toute la protéine suis le mouvement à condition qu'on bloque les bons endroits pivots, on peut donc la replier globalement ou affiner certaines régions et là est toute la difficulté.  [...]

[Divers] Lien entre la vision du physicien et celle du biologiste ?

Le lien entre la Biologie et la Physique est apparemment fait. En effet, il est fait au niveau matériel, oui les deux sciences utilises les mêmes bases, molécules, atomes, protons, électrons,... Mais il ne l'est pas au niveau conceptuel. Alors que la physique utilise ces unités pour établir des règles, prédire des comportements de la nature, la Biologie ne fait que constater que ses objets à elle (des protéines, de l'ADN, un noyau, une cellule) sont des molécules, sont faits d'atomes, électrons etc.  [...] Il cherche une règle. Le biologiste cherche à expliquer un concept propre au vivant, le comportement, comportement qu'il a observé, un comportement animal (la reproduction,...), un comportement d'un organe (la pulsation cardiaque, la respiration,...), un comportement cellulaire (la méiose, la migration cellulaire,  [...]

[Biologie Cellulaire] Régénération des cellules, allongement de la vie

- avoir la capacité de modéliser le comportement d'une cellule (informatiquement) afin de savoir qu'elle modification apporter sans tout bouleverser. Ici, ca coince un peu plus. Car une bonne modélisation ce fait au niveau atomique et sur des echelles de temps très courte (écart d'une femto-seconde).  [...] Hors, même en utilisant le superordinateur K, le temps de calcul serait faramineux. et pour une seule cellule. C'est pour cela que actuellement, les copains scientifiques travaillent avec des volumes entre 1/100 et 1/20 du volume d'une cellule. Enfin, pour moi, la meilleur porte de sortie pour les calculs complexes et multivariables sera les ordinateurs fonctionnant en quantum-bit.   [...]

[Divers] Mathématiques en biologie ?

Salut, Hellbly, je ne suis pas étudiant en biologie et c'est pourquoi je me pose ces questions... Quand j'avais des cours de SVT au lycée, il n'y avait quasiment pas une formule comparée à la physique ou même à la chimie. Et quand je parle de la vie mathématisée, ce n'est pas pour diaboliser les maths mais je me disais qu'il y avait peut-être des risques comme il y en a déjà avec l'ADN pour le clonage ou les OGM, de même qu'il y a toujours un bon côté.  [...] En fait, mon prof nous dit (et vu de mon petit niveau ça n'a pas l'air bête) c'est que les maths servent de base à la physique et la chimie, et qu'ensuite les bios utilisent la physique et la chimie pour leur modélisation.  [...]