• Santé - Méthodes, ADN, Total

[Microbiologie] environnement

les techniques ARDRA DGGE et RISA sont des méthodes d'empreintes moléculaires sur ADN total, je débute donc je ne comprends pas très bien a quoi cela correspond.  [...] j'ai compris que pour les méthodes RAPD et ERIC on fait un isolement de souches puis on les amplifie par PCR et après on fait un séquencage mais ce que je n'arrive pas à comprendre c'est qu'elle est la différence entre les deux et surtout leurs principes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Extraction ADN Plasmodium

Je suis doctorant en parasitologie, une partie de mon travail repose sur la PCR de plasmodium. Le problème c'est que j'ai pas trouvé dans la bibliographie un protocole d'extraction d'ADN parasitaire depuis le sang total, j'ai trouvé seulement des méthodes utilisant des kit d'extraction tel que QUIgen.  [...] extraction de l'ADN totatal par l'un de ces deux protocole puis ensuite PCR avec des amorces spécifiques de Plasmodium, ca devrait faire l'affaire.  [...]

Problème d'extraction d'ADN

Je me permet de vous solliciter pour un problème d'extraction d'ADN que j'ai rencontrer. J'utilise la méthode d'extraction sur colonne de gel de silice à partir de prélèvement de sang total congelé. Le hic, c'est en voulant décongeler mes prélèvement trop vite, j'ai accidentellement coagulé le sang total.  [...] La coagulation étant due à l'albumine je suppose(70°C). Ma question est la suivante. Y'a-t-il un moyen de sauver mes prélèvements Y'at-til un traimtement que je peux leur faire subir pour pouvoir quand même en extraire de l'ADN ( le principal problème du sang coagulé c'est que ça bouche la colonne, ce qui rend la séparation du lysat par centrifugation impossible).  [...]

[Biologie Moléculaire] Interprétation PCRq en temps réel (SYBER Green)

Le problème c'est pour la suite, on doit rendre un résultat scientifique (j'ai déjà calculé le % de contamination et je suppose que je doit utiliser les données fournies mais à part la concentration en ADN total, je ne vois pas ce que je dois faire des autres ) et un autre que même l'agriculteur producteur des échantillons est capable de comprendre (importance des dégâts, traitement possible si oui lequel...).  [...] D'autre part, tu soustrais la masse d'ADN de champignon à l'ADN totale pour avoir la masse d'ADN restant, appartenant donc au végétale, et tu calcules le nombre de génome végétal que tu as dans ton échantillon (masse d'ADN végétal/masse du génome du végétal). Tu obtiens n2.  [...]

Qu'est ce qu'une mycorize ?

Au contraire, il semble bien ici distinguer l'ADN total (mycorhizien) de l'ADN du champignon… (mais je n'ai pas lu l'article en entier).  [...] L'ADN total n'a aucun sens. Dans ce type de travaux, on recherche un marqueur précis, unique à l'espèce, afin de l'identifier. Il faut au contraire séparer les génomes et éviter tout amalgame (surtout entre champignon et champignon, ce qui est fréquent).  [...]

chromosomes et ADN:

Mr Hammer. si on provoque une denaturation total du chromosome, on obtiendra ça voir l image, ce qu'on appelle une molécule d'ADN, là y a pas d'autre nom pour cette molécule ( on peux dire un morceau par rapport au total ) comme il l a dit Mr DoubleD L' ADN est morcelé en 46 chromosomes.  [...] Mr Hammer6. si on dénature qu'un chromosome, on obtiendra ça. voir schéma, ce qu 'on appelle la molécule d'ADN. mais on peut dire un morceau mais par rapport au total = génome ( génome = ensemble des chromosomes). comme il l'a dit Mr DoubleD L' ADN est morcelé en 46 chromosomes.  [...]

Biologie moléculaire: quantité de plasmide

tu as le nombre total de bactéries, et la quantité d'ADN PAR bactérie.  [...] Ensuite, expérimentalement, on n'est pas capable d'extraire toute cette quantité car il y a des pertes dues à l'extraction elle-même. On te dit que le rendement de l'extraction est de 75%. Combien peux tu alors espérer en récupérer.   [...]

homologie protéome entre les organismes

Je trouves sur internet un peu de data concernant l'homologie entre l'ADN génomique des espèces (nombre total de nucléotides), mais quelqu'un connaîtrait-il une banque qui donnerait directement les % d'homologie au niveau du transcriptôme et au niveau du protéome entre les organismes Par exemple une banque construite par des analyses de l'ADN génomique et des algorithmes de prévision de protéine ou d'ARNm.  [...] .. Et à l'inverse, les homologies inter-especes considérants seulement l'ADN non codant... Et des radios ''homologie codante/homologie non condante''... Il y auraitenviron 20 000 gènes traduits dans H. Sapiens, et au total de l'ordre d'environ 5 millions de séquences peptidiques non redondantes sur Terre selon la méthode ''Towards completion of the Earth's proteome Carolina Perez-Iratxeta1, Gareth Palidwor1 & Miguel A Andrade-Navarro1,2,3'' http.  [...]

[Biologie Moléculaire] Extraction d'ADN

Si c'est une extraction d'ADN plasmidique, la présence d'une pelote ou de longs filaments témoignent d'une contamination des plasmides par de l'ADN génomique bactérien. Quel est ton type d'extraction d'ADN. ADN total ou ADN plasmidique.  [...] Personnellement j'ai extrait de l'ADN génomique du soja par les méthodes classiques basées sur l'utilisation de détergent (CTAB et SDS ) par deux protocoles différents et dans les deux cas j'ai obtenu un précipité sous forme d'écaille. je n'ai pas compris qu'on est-ce que on obtient une pelote d'ADN et quelle est la relation entre la forme et le degré de contamination de l'ADN.  [...]

[Microbiologie] évaluer la diversité

La composition de l'échantillon a été analysée par culture (des dilutions étalées sur un milieu solide et cultivée en anaérobie, 96 isolat identifies par séquençage du 16S) et par la méthode moléculaire (PCR 16S sur l'ADN total, clonage, séquençage de l'insert pour 96 clones).  [...] J'ai identifié 21 espèces au total, certaines par les deux techniques, d'autres seulement par culture ou par la méthode moléculaire. Le nombre d'isolats ou de clones pour une espèce varie de 19 à 1 (moyenne=9.4).  [...]