• Santé - Logiciels, Images, Molécules

Logiciels de graphisme

Pour dessiner des molécules, je te conseille fortement ChemSketch qui est un freeware fournit par ACD Labs. Tu vas sur leur site et tu trouveras assez facilement le lien pour le télécharger. Il faut juste s'enregistrer sur leur site, mais t'inquiète pas ils demandent pas le numéro bancaire. Tape ACD Labs sur google, tu trouveras.  [...] PS. c'est surtout un logiciel orienté chimie. Ils ont des molécules toutes prêtes mais tu peux créer les tiennes. Pour le dessin, il y a un endroit ou du matos de labo est prédessiné (assez bien fait), mais pour dessiner des plasmides... Enfin essaye le, ça coûte rien.  [...]

curieuses molécules

mais si tu veux vraiment des trucs bizarre et sympa avec de jolie image je te conseil d'aller au département de chimie organique de ta fac ou de crystallographie, car eux auront les molecules et les logiciels necessaire pour les visualiser en 3D, les tordre dans tout les sens ect.  [...] oui... je cherche des molécules qui ne sont pas habituellement les élues pour les exercices de débutants (glucose, eau, CO 2,etc.). Quelque chose comme un produit du quotidien ou encore une substance sécrétée par un vecteur responsable d'une maladie inhabituelle ou qui frappe l'imaginaire.  [...]

Cancer du sein : la mammographie 3D fait ses preuves

La mammographie 3D permet d'augmenter le diagnostic de cancer du sein, même par rapport au trio mammographie conventionnelle, IRM et échographie. Comme pour cet appareil SenoClaire (de l'entreprise GE Healthcare), la méthode est celle de la tomosynthèse numérique, dans laquelle un faisceau de rayons X tourne autour du sein pour réaliser une série d'images 2D qu'un ordinateur transformera en modèle 3D. GE Healthcare.  [...] Dans cette étude statistique publiée dans The Journal of the American Medical Association, les scientifiques ont comparé les résultats de dépistage de cancer du sein de près d'un demi-million de femmes dans 13 centres hospitaliers des États-Unis. Détection par mammographie traditionnelle, combinée ou non avec la tomosynthèse, qui produit des images en coupe du tissu mammaire de 1 mm d'épaisseur nécessaire à la reconstruction 3D.  [...]

[Biologie Cellulaire] Comptage d embryon a l aide de imagej

J ai découvert imagej et j ai testé plusieurs des protocoles pour essayer de calculer le nombre oeufs par photo. Mais aucun ne fonctionne car notre microscope donne des photos avec une lumiere qui n est pas homogene.  [...] ecouter monsieur il a des logiciels utilisés pour le comptage des copépodes à partir d'images ils sont très efficace dans ce genre de cas.g oublié sont nom mais cherche tu trouvera.  [...]

[Biochimie] Quantifier un western blot

Il existe des appareils spécialisé (genre chemigenius), qui permette d'acquérir des images jusqu'à 65 000 niveaux de gris, couplé au logiciel genetool pour faire une analyse automatique (identification des pistes et des bandes, determination de la taille/poids moléculaire par rapport à une marqueur, détermination de la quantité par rapport à une gamme standard).  [...] Attention aussi, avec photoshop, il est possible, frauduleusement, de modifier spécifiquement l'intensité de certaines bandes. C'est pourquoi certains logiciels (comme genetools) ne permet de quantifier que des images non modifiées (format de fichier propriétaire).  [...]

[Biologie Moléculaire] DOT Blot quantitative

Par rapport à l'annalyse des images, il y a de nombreux logiciels, souvent fourni avec le matériel de capture, qui permet de sélectionner manuellement ou automatiquement des zones de dépot, et ensuite d'évaluer des quantités par densitométrie.  [...] En général comme ADN non spécifique pour des analyses sur des eucaryotes, on utilise de l'ADn issu de sperme de poissons comme le saumon, car il y a une bon ratio ADN/autres molécules (donc pas cher).  [...]

[Biochimie] Docking Protéine-Ligand

Je fais un stage sur la contextualisation du docking moléculaire. J'aurais voulu savoir si des personnes s'y connaissaient et pour celles-ci si elles pouvaient m'expliquer le déroulement du procédé de docking. Concrètement on vous demande de docker telle protéine, quelles démarches allez-vous effectuer A propos des protéines, y a-t-il un palmarès des protéines les plus dockées.  [...] En fait, je cherche à savoir exactement ce que font les bioinformaticiens quand ils doivent docker des séries de ligands aux protéines. On s'intéresse pour l'instant à l'étape précédant le docking. Comment préparent-ils la structure de la protéine Y a-t-il des règles générales (enlever des molécules ou des atomes) ou bien c'est au cas par cas Dans le cas par exemple de la protéine neuroaminidase du virus H5N1, que font-ils exactement Quels logiciels utilisent-ils pour préparer la protéine et pourquoi ces logiciels et pas d'autres Quelles sont les raisons de ces choix De nombreux logiciels existent et sont plus ou moins utilisés pourquoi.  [...]

[orientation] Avenir de la Bioinformatique

C'est vrai qu'avec des supers-ordinateurs, le gros avantage serait de conçevoir des logiciels de modélisation spécifiques ayant une approche plus fine. actuellement les calculs énergétiques sont assez limités. la modélisation donne de jolies images mais les résultats varient en précision lorsqu'on simule des mutations, par exemple, suivant le logiciel, la puissance de la machine, les algorythmes utilisés.  [...] Les étudiants possédant une licence informatique qui suivaient des modules communs de biologie moléculaire pour maitrises biologie et bioinformatique avaient vraiment beaucoup de mal à suivre, celà m'avait bien marqué.  [...]

Modèles moléculaires

En même temps, je voudrai savoir si quelqu'un connait un logiciel de modélisation moléculaire en 3D non payant, et pour faire de la création de molécules, genre ChemSketch que je possède déjà. Les logiciels de visualisation du style Chime ne m'intéresse pas, et j'en possède un, ce qui est suffisant. Je veux créer des molécules.  [...] Pour ce qui est de dessiner des molécules, je ne peux que te conseiller ISIS Draw, téléchargeable gratuitement (voir les infos sur le site http.//www.geocities.com/athens/theb...8/obc/isis.htm en anglais).  [...]

Logiciels 3D pour le corps humain particulièrement le colorectum

Logiciels 3D pour le corps humain particulièrement le colorectum.  [...] je prépare ma soutenance de thèse (version powerpoint) en biologie du cancer colorectal et je voudrais avoir des liens de logiciels qui montrent le corps humain et particulièrement l'anatomie général du corps, après celle du colon, après un zoom sur la muqueuse colique jusqu'à l'ultra-structure des molécules qui peuvent exister à ce niveau (comme une vidéo).  [...]