• Santé - Formation, Structure, Protéines

[Biochimie] Congélation : effet sur les enzymes

C'est généralement la formation des cristaux de glace qui endommagent les protéines. On peut mettre du glycérol (environ 20%) ce qui limite la la taille des cristaux. De manière générale, tout ce qui fait des liaisons hydrogène et qui perturbe donc la formation des cristaux de glace, permet de préserver la structure 3D des protéines à la congélation. Par exemple, les sucres marchent bien.  [...] Certaines grenouilles (je ne sais plus lesquelles) possèdent des protéines qui se lient justement aux cristaux de glace naissant, empêchant leur croissance. C'est une sorte d'antigel qui leur permet de résister à la congélation.  [...]

Protéine/cellule ? oeuf/poule

Finalement il a été établi (il y a des spécialistes qui confirmeront peut être cela) que ce qui est important dans les ribosomes pour la formation des liaisons peptidiques ce sont des ARNs. Les proteines ne jouent donc qu'un role de structure.  [...] Si j' ai bien compris au tout début de la formation de la vie les ARNs aurait étés suffisant pour permettre la synthèse protéique. J' apprécierai vraiment que tu me communique les sources qui te permettent d' avancer cela, non pas car je remet ton explication en question mais juste parcque je trouve le sujet intriguant.  [...]

Pseudomonas Syringae

Les bactéries nucléatrices phytopathogènes (comme P. syringae effectivement mais aussi une dizaine d'autres espèces dont Erwinia ou encore Xanthomonas ) produisent des protéines (InaZ de P. syringae est la plus étudiée et connue) qui provoquent la formation d'un complexe membranaire imitant la structure cristalline de l'eau et catalysant la nucléation.  [...] Les molécules d'eau qui entrent en contact avec ces protéines adoptent donc une conformation moléculaire propre à l'état solide, servant elles aussi à la formation de glace autour d'elles.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéine

bonjour,je voulais savoir si une proteine est ampholytecar mon ancienne prof de svt me l'a dit mais ma nouvelle pense que non,je me rapelle que mon ancienne prof ma dit cela car la chaine de proteine tridimensionnelle est due aux charges des proteines qui se repoussent et qui s'attirent donc merci de bien vouloir m'aider.  [...] Par contre, pour ce qui est du repliement des proteines c'est bien plus compliqué que de simple répulsion attraction. Le premier phénoméne d'un point de vue énergétique est l'augmentation de l'entropie de l'eau lorsque la protéine se replie. Ensuites, des intéractions électrostatiques de type liason hydrogéne permettent la formation de structure secondaire (hélice, feuillet).  [...]

L'action d'un candidat vaccin contre le VIH filmée en direct

Grâce à une technique d' imagerie microscopique puissante non invasive, les chercheurs ont pu visualiser pour la première fois in vivo et en direct la formation d'un complexe protéique à la structure très particulière. l'inflammasome, un assemblage complexe de protéines, qui apparaît dans les premières cellules immunitaires ciblées par le vaccin, les macrophages.  [...] C'est la première fois qu'il est donné de visualiser in vivo et en temps réel la formation de cette structure originale, l'inflammasome, commente Philippe Bousso. Ainsi notre étude souligne le potentiel du candidat vaccin MVA-HIV à déclencher une réponse immunitaire importante et diversifiée.  [...]

[Biochimie] PDB et Cristallographie

Il peut y avoir des zones dans la structure des protéines qui sont très dynamiques. Cela peut engendrer la formation d'un cristal de plusieurs conformères. La base de la résolution cristallographique étant la répétitivité de la même structure, s'il y a des variations à un endroit, la résolution sera donc impossible pour cette zone.  [...] Pour compléter ce que dit LXR, il faudrait une résolution d'environ 0,5 A pour voir les atomes d'hydrogène or les meilleures résolutions obtenues pour des protéines sont d'environ seulement 1 A. Les hydrogènes présents dans les structures sont donc rajoutés, il est possible de calculer leurs positions si on connait l'emplacement des autres atomes.  [...]

[Divers] [biologie du developpement] développement des membres

L'archétype des protéines à domaine T-Box est la protéine Brachyury. Le rôle de ce gène dans le développement embryonnaire a été décrit dés 1927 grâce à l'analyse de mutants spontanés (Dobrovolskaïa-Zavadskaïa (ouf..) C.R.Soc.Biol 1927 Vol 97. 114-116). Les mutants à l'état homozygote présentaient un arrêt de la formation de la ligne primitive, structure anatomique observable durant le développement précoce et marquant la formation de mésoderme embryonnaire.  [...] Ils présentent encore, et c'est logique, des anomalies de la notochorde (ou encore corde), structure mésodermique transitoire, centre inducteur du système nerveux central. Ainsi la mutation Brachyury (et donc la protéine qui fut identifiée plus tardivement (Herrmann et al Nature 1990 Vol 343.  [...]

Ponts Disulfures

LEs ponts disulfures se forment effectivement entre 2 acides aminés cystéine qui possède un résidu -SH. La formation de cette liaison -S-S- va provoquer un repliement de la protéine et participer à la structure 3D de la protéine et donc à sa fonction. La liaison peut être intracaténaire (la meme chaine protéique) ou intercaténaire (entre 2 protéines ou polypeptides ex.  [...] Le problème, c'est que la protéine ne va pas acquérir instantanément sa structure tertiaire dès sa biosynthèse. Au cours du repliement, il est probable que deux cystéines de la même protéine ou de deux protéines distinctes vont passer l'une à coté de l'autre et former un pont disulfure aberrant.  [...]

[Biochimie] cours étrange d'histoire de la vie.

au passage je cherche un cours de master 1 ou 2 biochimie spécialité en relation avec la structure protéique pour m'approfondir dans ce domaine qui m'intéresse beaucoup.  [...] Je ne dis pas le contraire et je lis moi-même de nombreuses publications sur le sujet. Cependant, il me semble que n'importe quel étudiant ayant réussi sa 1re année de Bachelier en biologie comprendrait les publications sur le sujet aussi bien que moi, parce qu'il a reçu la formation adéquate de base sur la structure des protéines.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 13

Enfin, entre la fin des années 1960 et le début des années 1970, on a pu établir que le centre actif du ribosome avait une structure en trois dimensions qui sélectionnait les acides aminés gauches. Le problème s'est donc présenté de savoir comment le processus a été conservé, dans l'intervalle de temps entre la formation des premiers acides aminés et l'apparition d'un proto-ribosome capable de sélectionner les acides aminés.  [...] Il faut aussi éviter l'ecueil de l'interprétation téléologique. l'hélice alpha est stable si et seulement si les acides aminés sont de tel type, donc l'homochiralité est nécessaire à la formation des protéines et donc à la vie. Alors que rien ne dit qu'il n'y a pas une structure stable des polypeptides autre que l'hélice alpha et qui ne nécessite pas l'homochiralité.  [...]