• Santé - Force, Promoteurs, Séquence

Comment est fait un promoteur ?

La deuxième partie du promoteur est le promoteur distal, c'est une région qui peut s'étendre jusqu'à 1OOO paires de bases en amont de l'initiation. C'est là où on a toutes les séquences reconnues par des facteurs transcriptionnels (répresseurs et activateurs), qui en intéragissant entre eux induisent un repliement spécifique de l'ADN, ce qui va provoquer une régulation très fine de la transcription des gènes.  [...] La force des promoteurs depends de la sequence des boites -10 et -5 mais egalement de l'ecartement entre ces 2 zones. Une -35 modifiée fixera moins bien la RNA pol, un ecartment trop grand ou trop petit entre la -10 et la -35 ne premettra pas une bonne reconnaissance de la region par la RNA pol.  [...]

[Biologie Moléculaire] Promoteurs altérnatifs

Je pense que des voies de signalisation vont être activées qui vont à leur tour activer des facteurs de transcription présents ou bien induire la synthèse de facteurs de transcription qui iront se fixer sur leurs éléments CIS modulateur présent sur la séquence promotrice.  [...] Après certains promoteurs ont juste besoin du complexe d'initiation de la transcription pour transcrire des ARN mess et d'autres vont avoir besoin en plus que des facteurs de transcription se fixe sur la séquence promotrice pour que le promoteur s'active ou bien que ça force soit augmentée ou diminuée.  [...]

[Génétique] Comment identifier les promoteurs contenant une sequence consensus d'intéret

Comment identifier les promoteurs contenant une sequence consensus d'intéret.  [...] Je connais la séquence consensus d'un facteur de transcription. J'aimerai identifier dans le génome humain l'ensemble des promoteurs qui possédent cette séquence.  [...]

mesure de l'expression d'un gene

d'ailleurs la PCR quantitative est plus fine que le run-ON et je suis d'accord avec les objections d'Igothigh, n'etant pas dans des conditions physiologiques le taux obtenus n'aura aucun sens biologique. D'ailleurs si tu utilises le promoteur natif du gene comment compte tu faire ton run-on sans purifier la polymerase et les proteines accessoires necessaires.  [...] Je ne peux pas utiliser de système rapporteur, car je veux étudier un couple d'ARN sens et antisens dont les sequences se chevauchent. Ce n'est pas la force des promoteurs qui m'intéresse, mais la transcription de l'un par rappport a l'autre, et peut etre l'effet de l'anti-sens sur le sens.  [...]

[Génétique] promoteur de la transcription

Attention, la séquence TATA est une séquence de promoteur comme déjà dit, dite consensus, cela veut dire que tous les promoteurs n'ont pas cette séquence exactement.  [...] De plus, les promoteurs dit à régulation positive ont des séquences promotrices particulières qui font que ces promoteurs sont faibles et ont besoin de molécules (protéine de régulation) se fixant sur l'ADN (sur des sites appelé opérateurs) pour être fonctionnels.  [...]

Génétique Moléculaire

Par exemple au niveau des domaines de transactivation. Il existe 7 types d'épissage alternatif qui sont dus ou non à une modification de ta séquence a épissé.  [...] - épissage alternatif avec 2 promoteurs. L'exon portant le promoteur choisis on aura telle ou telle séquence transcrite. ce sont des promoteurs alternatifs et là aussi tout va dépendre des facteurs d'épissage et de leur affinité pour le choix du promoteur.  [...]

Promoteur T7 et T3

Est ce que quelqu'un aurait la séquence des promoteurs T3 et T7.  [...]

[Biologie Moléculaire] Intron (suite) et Parasite

J'aurais voulu savoir si on peut considéré les introns comme des séquences régulatrices dans le génome car on a une alternance d'exon et d'intron dans le génome eucaryote donc on pourrait se dire que les introns sont des séquences régulatrices genre Promoteur d'un gène.  [...] Le promoteur d'un gène est là pour recruter (via les facteurs généraux de transcription)une ARN polymérase. Ce n'est pas le rôle des introns. soit ils n'ont pas d'utilité (ou pas apparente), soit ils ont un impact sur la transcription via le recrutement de facteurs de transcription (mais qui ne sont pas des facteurs généraux de transcription car eux fixent le promoteur).  [...]

Insertion d'un promoteur sur un vecteur plasmidique

Sur ton insert, tu fais une PCR en utilisant 2 amorces hybridant aux extrémités de ton DNA. Pour l'amorce hybridant en 5', tu ajoutes en 5' de celle-ci la séquence de ton promoteur viral (je suppose que tu utilises un promoteur viral d'eucaryote, CMV par exemple), et le tour est joué.  [...] A désolé j'avais pas vu que tu demandait aussi comment l'isoler. Bein les séquences de ce types de promoteur sont archi connues donc quand tu commandes tes amorces, tu peux leur demander qu'ils te rajoutent ta séquence promotrice en amont de ton amorce 5' et le tour est joué.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcriptome

Mon prof a dit que qu'on connait le gène qu'on a mis dans chaque puits et après comme on connait la séquence du génome de l'organisme qu'on utilise, on peut identifier les promoteurs... mais si un gène est la séquence non transcrite (promoteur) + séquence transcrite.  [...] En fait les ADNc s'hybrident aux gènes mais comme ils correspondent aux transcrits... La séquence du promoteur ne s'hybride pas. Du coup on utilise les transcrits s'ayant hybridé et comme on a les séquences entières du génome... on peut identifier les promoteurs.  [...]