• Santé - Fonction, Distance, Migration

[Biochimie] fonctionnement d'un stacking gel

J'ai bien compris à quoi sert le gel de stacking ( à ce que l'échantillon soit concentré sur une bande très fine avant d'entrer dans le gel de séparation ), mais par contre, je n'ai pas du tout compris son fonctionnement.  [...] Avant de lancer la migration, les ions pilotes et d'arrière-garde sont mélangés dans le tampon. C'est lorsqu'ils sont soumis au courant électrique qu'ils migrent dans le gel et s'organisent en fonction de leur mobilité. La distance de migration dans le stacking est relativement courte.  [...]

[biologie moléculaire] Identification d'une molécule

Il a raison de parler de protéine car les expériences qui ont été faites après l'identification de la phosphatidylsérine sont typiques d'une analyse de protéine. En effet, s'il n'y avait que des lipides, où serait l'intérêt de traiter avec un agent réducteur des ponts disulfures et de faire migrer sur électrophorèse.   [...] Pour l'identification, regarde si on te donne une échelle de PM ce qui te permettrais de lire le PM de chaque proteine en fonction de la distance de migration. Souvent, le 1er et le dernier puit servent à cela.  [...]

[Biologie Moléculaire] Epidémie de diarrhées (tp)

J'ai tracé le graphe distance parcourue en fonction de la taille des fragments pour avoir une droite étalon mais je n'arriva pas à savoir s'il y a des similitude entre les fragments d'adhésine et invasine et les plaide étudiés donc à savoir si ces deux gènes sont les responsables de l'épidémie.  [...] E. coli étant commensales en général chez les mammifères, il est sur que ce soit l'adhésine et l'invasine (portées par un plasmide afa-3) qui soient responsables des diarrhées. Je sais qu'il existe un logarithme entre la taille des fragments en fonction de leur distance de migration... es-tu sur que ton graphe est bien axé.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR et témoin négatif

une autre question, comment faire pr estimer la taille des bandes sachant que l'on dépose 7µL de produits PCR mais que la ladder correspond a 500ng d'ADN.   [...] Le ladder, est ce un vraie échelle de taille, auquel cas c'est facile d'estimer la taille du produit de pcr par rapport aux tailles connues pour le ladder. (la vraie méthode consistant a faire une courbe étalon log(taille)=f(distance migrée dans le gel), et d'utiliser cet étalon pour retrouver la taille de la bande en fonction de sa migration).  [...]

[Microbiologie] détermination nombre paires de bases en electrophorese

je voudrais savoir s'il existait une formule pour calcul le nombre de paires de bases des bandes de fragments électrophorétiques en fonction de la distance de migration.  [...] précision la distance tu peux l'exprimé en cm ou en mm sa na pas trop d'influence. il faut juste pensé à utilise la même unité dans la droite étalon et dans tes fragments d'adn. elle se lit du haut du gel vers le bas dans le sens de migration. le zéro étant le haut (endroit du dépôt).  [...]

[Biologie Moléculaire] Carte de restriction

Si vous voulez vous y retrouver faites une représentation distance de migration = f(log PM). Vous aurez alors une droite et vous pourrez trouver la taille de vos fragments beaucoup plus facilement.  [...] Euh...au risque de m'entêter...pk log taille = f(distance) ne peut pas marcher J'ai pas trop compris...Si je mets le log, ça devient linéaire non.  [...]

[Génétique] marqueur??

Le principe d'un marqueur de taille est assez simple. C'est un mélange avec plusieurs fragments de tailles précises connues. Tu déposes ce mélange sur un gel d'électrophorèse et connaissant la taille de chacun des fragments et sachant comment migrent les petits et les gros fragments sur ton gel tu peux estimer la taille des fragments de tailles inconnues.   [...] Pour avoir une estimation précise tu peux tracer une courbe sur papier semi log. log PM = f(Rf {distance de migration} ). En reportant la distance de migration de taille inconnue tu en déduis leur PM apparent.  [...]

[Biologie Moléculaire] l'électrophorèse

La distance de migration étant proportionnelle a la taille, on utilise ces brins d'ADN dont on connait la taille, pour former une gamme.  [...] La technique de l'électrophorèse en gel d'agarose est basée sur la séparation des acides nucléiques chargés négativement sous l'effet d'un champ électrique. Cette séparation s'effectue à travers la matrice du gel d'agarose. les molécules de plus petites tailles se déplacent plus rapidement et migreront plus loin que les molécules de tailles supérieures.   [...]

[Biochimie] Analyse de l'expression du gène fos

2. Précis. La migration se fait de manière logaritmique en fonction de la taille. Elle est donc linéaire en fonction du logaritme de la taille.  [...] Vous tracez donc une droite en coordonnée semilog (log (taille). distance de migration) à partir de votre marqueur. Ensuite vou pouvez retrouver la taille en utilisant cette droite.  [...]

Recepteur à l'insuline en SDS PAGE

Voila comment, si mes souvenirs sont exact, l'électrophorèse avec SDS permet de faire migrer chaque protéine en fonction de son poids moléculaire...car celui ci est fonction de la taille du baton que forme la protéine en présence de SDS,et donc du rayon de stocke auquel celà correspond (*gros doute.*).  [...] Et donc, selon la distance de migration pour un type de gel donné sera associé à un rayon de Stock théorique...proportionnel à la taille de la protéine complexée par les molécules de SDS, et donc, proportionnel au poids moléculaire.  [...]