• Santé - Familles, Séquences, Acides aminés

[Microbiologie] bactéries et cellulose

Tenant compte de la nouvelle classification, les hydrolases sont classées en familles en se basant sur la similarité des séquences d'acides aminés (Henrissat, 1991, Henrissat and Bairoch 1996, Bourne and Hernissat, 2001).  [...] - L'Endo- ß 1, 4-glucanase. (EG) (EC 3.2.1.4) coupe les liens internes pour perturber la structure cristalline de la cellulose, produisant ainsi des molécules de glucane et par conséquent de nouvelles extrimités.  [...]

[Biologie Moléculaire] adn polymérases ?? classification

ainsi que alpha, beta, delta, epsilon et gamma, je me demande quel critéres on prend pour chaque classification et est ce que en fin en a 8 adn polymérases ou bien les I, II et III sont des hologues a 3 parmi alpha, beta, delta, epsilon et gamma.   [...] En fait, les ADN polymérases I, II et III sont classées dans les différentes familles A,B,C...etc formées selon la séquence en acides aminés des polymérases.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les gènes Hox

Les protéines pour lesquelles ils codent appartiennent à une famille dont tous les membres ont en commun un domaine conservé, l'homéodomaine. Cet homéodomaine est formé d'environs 60 acides aminés formant 4 hélices (3 hélices alpha + une autre hélice). Ce sont les hélices 2 et 3 qui se fixent dans le grand sillon de l'ADN au niveau d'une séquence consensus spécifique à chacune des différentes sous-familles d'homéogènes.  [...] 39 gènes hox possèdent le même homéodomaine de fixation à l'ADN mais reconnaissent des séquences ADN différentes... du coup je n'arrive pas à voir fonctionner ces gènes hox ( Hox hox Hox ).  [...]

acides aminés gauchers??

2) L'explication est que les voies de synthèse des acides aminés sont toutes liées entre elles, et l'énantiomérie se conserve. A la base, la vie a opté par convention pour les acides aminés G sans que ça ait un avantage quelconque par rapport aux D. Mais il fallait choisir, parce que les acides aminés sont liés entre eux par des voies de synthèse et de transformation.  [...] C'est d'ailleurs grâce à l'existence d'acides aminés de la série D dans la membrane bactérienne que les antibiotiques des familles de la pénicilline et des céphalosporines peuvent détruire sélectivement les bactéries. En effet le groupe bêtalactamine présente lui aussi une chiralité s'adaptant uniquement aux acides aminés D.  [...]

acides aminés, classification par radical R?

La différence se fait bien selon la nature de leur radical R à partir desquels on peut définir plusieurs familles d'acides aminés.  [...] Donc les acides aminés possèdent les propriétés chimiques de leur radical, particulièrement lorsqu'ils formes les protéines puisque les groupements COOH et NH2 sont mobilisés presques entièrement dans les liaisons peptidiques. Ces propriétés pouvant être influencées par l'environnement puisque les charges vont varier selon le pH par exemple.  [...]

[Identification] résultats de spectrométrie de masse

je ne connais pas grand chose à la spectrométrie de masse. Par contre, j'en connais un peu plus sur les recherches de séquences dans les bases de données, surtout nucléiques (gènes, ARNm).  [...] 2) Une protéine peut présenter des motifs d'acides aminés caractéristiques qu'on retrouve chez d'autres protéines. On peut même former des familles en se basant sur ces similitudes de séquence. La signature d'une famille est la conservation de différents motifs spécifiques (avec quelques variantes) positionnés dans le même ordre et à des distances similaires d'une séquence à l'autre.  [...]

Peroxysome

Il existe une famille de gène qui s'appelle PEX, qui se découpe visiblement en un paquet de sous familles (ex. PEX1, PEX2, PEX3...etc, puis PEX1a, PEX1b...etc). Tous ne font pas tout. Il y a des recepteurs, des enzymes, des chaperonnes, des transporteurs, liaison à l'ATP, liaison aux acides aminés, etc.  [...] Voila, je ne pense pas pouvoir te donner de réponse plus clair, à moins que tu ais une gène en particulier que tu veuilles voir. Si tu souhaites approfondir, je te suggère de taper PEX ou peroxin dans les diverses bases de donnés. Elles te sortiront tout un tas de gènes et en les regardant rapidement dans les différent liens qui les décrivent (publi associées, familles, domaines prot connues, fonction connue, mécanisme d'implication, localisation.  [...]

HPLC_Dans quel cas on utilise?

T'utilises l'HPLC quand tu veux faire des séparations de molécules ayant des propriétés physico-chimiques proches et que tu veux les séparer avec une forte résolution. En même temps, cette chromatographie est performante puisqu'elle permet des séparations optimales en un temps minimisé.   [...] parmis les grandes familles usuellement dosées on trouve par exemple. les stéroides,les vitamines,les produits pharmaceutiques,drogues,colorants,lipides,proteines,acides aminées,sucres,  [...]

Savoir choisir ses huiles alimentaires

Les acides gras apportés par les lipides sont des nutriments indispensables pour l'homme au même titre que les vitamines. On les trouve en abondance dans le cerveau du foetus, de l'enfant et de l'adulte. L'homme étant incapable de les fabriquer, ces acides gras essentiels (A.  [...] Les acides gras sont la principale source d'énergie de notre organisme. Ils sont regroupés par famille en fonction du nombre d'insaturations qu'ils renferment. les acides gras saturés ne possèdent pas d'insaturation, les acides gras mono-insaturés en possèdent une, et les acides gras poly-insaturés (ou AGPI) en ont au moins deux.  [...]

[Génétique] Construire un vecteur de transgenèse dérivé des transposons

D'après ce que je sais, les transposons reconnaissent différentes sequences selon leurs familles d'appartenance, cad, certains sont spécifiques de 4-6 nucléotides et d'autres s'inserent dans des 'hot-spot', séquences bcp moins homologues... Quois qu'il en soit, le transposon possède de très nombreux sites potentiel d'insertion dans un génome complet, c'est pourquois il est utilisé pour réaliser dans campagne de mutagénèse aléatoire.  [...] Ou alors, oui, tu fais un plasmide supplémentaire portant le gène de la transposase mais sans les séquences répétées inversées.  [...]