• Santé - Expression, Niveau, Idée

Félix le chat

Probabablement faut-il chercher la cause en dehors d'une raison évolutive, plutôt dans les mécanismes cellulaires qui régissent la zonation de blanc de la robe couleur et blanc.   [...] Il doit y avoir des différences au niveau du développement embryonnaire, puisque les zones noires et rousses révèlent l'expression du chromosome X... Quelqu'un aurait-il une idée Pourquoi ne trouve-t-on pas de chatte écaille de tortue sans blanc avec des zones de noir et roux larges et bien séparées.  [...]

Etudier la down-régulation d'une protéine

-Pour les miRNA, oui ça semble une bonne idée. Perso je commencerai tout simplement par faire un array global d'expression des miR cellule saine vs cellules malades, vois ceux qui sont augmentés dans cellule malade, check les databases gratuites type mirbase pour voir ceux qui target potentiellement ta prot d'intérêt, test les in vitro en traitant tes cellules avec premiR ou antagomiR.  [...] Ah oui j'oubliais (je peux plus éditer le post du dessus donc pardon pour le flood), avant de se lancer dans tout ça faut évidemment mesurer l'expression au niveau mRNA pour avoir une permière idée approximative si le défaut est au niveau transcriptionnel ou non (mais peut être est-ce déjà fait).  [...]

Phénomene de diauxie

On peut dire alors qu'à tout moment l'opéron lac est sous le contrôle de molécules aux effets antagonistes ( répression et activation ou lévé d'inhibition etc...) et que le niveau d'expression résulte du ratio de ces molécules régulatrice. Tantot l'équilibre bascule en faveur de l'activation tantôt il bascule en faveur de l'inhibition mais ce n'est jamais une inhibition totale ou activation totale ( les termes ne sont pas adéquate je pense mais c'est l'idée que je m'en fais) mais le taux d'expression serait donc tout en nuance.  [...] Est ce que ce phénomène d'expression basale est particulier à l'opéron lac ou est ce quelquechose de généralisable à la majorité des opéron Si tel est le cas alors ça collerait avec cette vision d'une double régulation ( positive et négative ) du niveau d'expression des opérons.  [...]

mesure de l'expression d'un gene

Est-ce imaginable un gène pas trop exprimé au niveau de la transcription mais avec un messager très stable et qui as une durée de vie très importante ce qui induirait donc une forte expression Ou est-ce que globalement tout les ARNm ont une durée de vie proche et donc le taux d'expression est surtout rapport aux taux de transcription.  [...] Tout dépend de la question que tu te poses. Pour le Run-On, on sort quand même du contexte physiologique. Et j'ai comme dans l'idée (peut-être fausse) que quantifier l'expression d'un gène par run-on n'est pas fiable (voire pas recommandé). Pour ma part, la PCR quantitative me parait être un bon outil pour déterminer le niveau d'expression d'un gène à un temps t.  [...]

[Biologie Moléculaire] Q-CPCR encore !

Si avec la meme quantité d'ARN pour la RT, je trouve un gène 2 X plus exprimé dans un tissu que dans l'autre, il faut ensuite que je ramène à la quantité d'ARN initial dans le tissu pour avoir une idée réel du niveau d'expression et de la quantité non.  [...] Je comprends ton problème, mais le truc, c'est que tu as moins d'ARN car tu as moins de cellules dans ton tissu, donc moins d'ARN. Or toi ce qui t'intéresse, c'est que savoir à quel niveau d'expression se trouve ton ARN dans une cellule donnée. Donc comparer ce niveau avec le niveau d'un gène stable, ou par défaut à une quantité X d'ARN (par ex la quantité d'ARN utilisé pour faire la RT), te permet de tenir compte de cette dilution des cellules.  [...]

[biologie moléculaire] opéron lactose

l'expression des trois genes de l'operon lacZ, lacY et lacA s'effectue par une fuite du promoteur qui assure un niveau d'expression de base.  [...] Maintenant imaginons qu'il soit réprimé. Son niveau d'expression ne sera pas 0. Il restera une expression résiduelle, disons 1.  [...]

Question de bio cell >Etat basal ?

Dans la régulation de la synthèse des protéines au niveau transcriptionnel, on me décrit point par point les mécanismes de régulation et avant chaque explications, il y a état basal je ne comprends pas du tout cette expression (je connais juste basal et apical pour les polarités des cellules mais à mon avis ca n'a rien à voir...).  [...] état basal désigne ici le niveau d'expression d'une protéine, en l'absence d'activation ou de répression.  [...]

[Biologie Moléculaire] Opéron bactérien et niveau d'expression

[Biologie Moléculaire] Opéron bactérien et niveau d'expression.  [...] Savez-vous si cette baisse du niveau d'expression commune aux opérons Merci de vos réponses.  [...]

[Biologie Moléculaire] Plan de plaque PCR en temps réel

Mais ici, si tu connais avec précision l'efficacité de ta qPCR pour chaque couple de primers dans les conditions que utilises pour ta plaque, que tu mets tous tes gènes sur la même plaque, tu devrais pouvoir t'en sortir avec une quantification relative à l'aide un gène de référence, et ainsi pouvoir donner une idée du niveau d'expression de chaque gène par rapport aux autres.  [...] * 3 gènes de références (lesquels, par curiosité ), afin de calculer un facteur de normalisation (comment tu le calcules, toujours par curiosité ), et donc de pouvoir comparer au sein d'une même plaque, l'expression d'un gène dans tes différents échantillons, en considérant que les 3 gènes de références ne varient pas.  [...]

Cancer colorectal : un pronostic plus fiable

Pour aboutir à ce résultat, cette équipe a tout d'abord analysé le niveau d'expression de nombreux gènes impliqués dans la réaction immunitaire sur le site de la tumeur, dans 75 tumeurs colorectales. Des programmes informatiques de modélisation des résultats, développés par le groupe de bioinformatique autrichien associé au travail, ont permis aux auteurs d'identifier un groupe de gènes dont le niveau d'expression est très fortement associé à l'évolution clinique des patients.  [...] Le niveau d'expression de ces gènes témoigne de l'existence d'une réaction immunitaire dans la tumeur faisant intervenir des cellules immunitaires (lymphocytes T CD8 cytotoxiques ) potentiellement capables de reconnaître et de détruire les cellules tumorales.  [...]