• Santé - Expression, ARNm, Taux

mesure de l'expression d'un gene

Est-ce imaginable un gène pas trop exprimé au niveau de la transcription mais avec un messager très stable et qui as une durée de vie très importante ce qui induirait donc une forte expression Ou est-ce que globalement tout les ARNm ont une durée de vie proche et donc le taux d'expression est surtout rapport aux taux de transcription.  [...] Sinon, pour repondre a ta question, a ma connaissance il n'y a pas d'ARNm suffisamment stable pour compenser un faible taux d'expression. En plus il semnle que les genes faiblement expimes possedent aussi un biais d'utilisation des codons particulier, indiquant aussi que la traduction n'est pas optimale pour ces genes.  [...]

gènes et transcription

Et puis ça serait trop simple de dire que toute la régulation de l'expression se fait au niveau de la transcription. Une partie se fait sur le taux d'export de l'ARNm du noyau, la stabilité de l'ARNm dans le cytoplasme, un peu sur la traduction, sans parler des modifications post-traductionnelles.  [...] Dire est-ce que les gènes en cours de transcription sont fortement exprimés ça veut rien dire. Quand un gène n'est pas transcrit, il n'est pas exprimé, et quand il est transcrit, il l'est. La force de l'expression se fait par des processus pré-transcriptionnel très complexe (voies de signalisation, stimulis extérieurs), et par toutes les autres régulations dont j'ai parlé plus haut.  [...]

[Biologie Moléculaire] régulation de l'expression du gène

Les différents point de controle de l'expression géniques sont au niveau de la synthèses de l'ARNm, la maturation du transcrit (épissage et polyadénylation), le transport de l'ARNm en dehors du noyau, la stabilité de l'ARNm, la synthèse de la proteine et l'activité de la proteine.  [...] Mais dans la plupart des cas, l'expression d'un gène est controlée au niveau de la transcrpition, c'est-à-dire lors de la synthèse de l'ARNm par l'ARN polymérase II.  [...]

ARNs Interférants

Ben la réponse est dans ta question. ils servent à moduler l'expression du génome, comme le font de nombreux autres mécanismes. Le sens dans lequel ils tirent la couverture (expression ou répression) n'est cependant pas encore totalement élucidé, mais il en va de même pour de nombreux autre systèmes de régulation du génome.  [...] Les ARN interférant n'inhibent pas l'expression d'un gène, mais la production des protéines via la destruction de l'ARNm de cette protéine. On inhibe l'expression d'un gène en ajoutant un inhibiteur sur son promoteur, par exemple, donc pas de production d'ARNm.  [...]

[Biologie Cellulaire] Stabilité de l'ARNm

Ensuite, une fois ton ADN dans la cellule, celui-ci peut s'exprimer de façon constitutive, cad qu'il y a transcription tout le temps. Ou alors, tu peux vouloir activer la transcription de ton gène quand tu le désires, et tu utilises alors un inducteur comme l'IPTG. L'expression est dite inductible dans ce cas.  [...] Enfin, la stabilité de ton ARNm produit dépend de son taux de production et de dégradation (c'est la même chose pour une protéine ou un ADN d'où la transition stable où il y a moins de dégradation de ton ADN). Plus un ARNm sera synthétisé dans de bonne condition, plus il sera stable, cad moins il sera dégradé.  [...]

[Biologie Moléculaire] augmentation du taux d'ARN mais non celui de la protéine

Je ne l'ai jamais fais donc je ne sais pas si ca fonctionne bien mais une astuce pour faire le tri serait d'utiliser un ARNi/morpholino antisens à ton ARNm pour faire un IHC sur tes cellules mutantes pour ta protéine. Le contrôle d'inhibition de l'expression de l'ARN endogène serait un northern ou une qPCR.  [...] Le phénomène se reproduit il dans une autre lignée Que se passe t il lors de la transfection avec un vecteur d'expression pour cette protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment analyser les résultats de PCR quantitative???

Moi j'utilise la quantification relative, mais je regarde l'expression de gènes sous plusieurs conditions pharmacologiques. J'ai donc un témoin, qu'on appelle le basal, qui nous donne une quantité arbitraire d'ARNm en Ct, il représente l'expression basale.  [...] Mon objectif est d'évaluer l'expression de 4 gènes au niveau de l'hypothalamus à savoir nNOS iNOS BDNF et CRF dans les deux conditions M et MAC par comparaison à la condition contrôle (T).  [...]

[Biologie Cellulaire] Vecteur d'expression transitoire

Mais comment va se faire l'expression en fait Des facteurs de transcription vont reconnaître le promoteur et l'activer, entrainant l'arrivée de l'ARN polymérase (comme un gène normal).  [...] Tout à fait, c'est ce qu'il faut mettre dans ton vecteur d'expression, et tu peux rajouter aussi entre la séquence codante et le signal de polyadénylation une séquence intronique. Habituellement on utilise celle du virus SV40. L'épissage du pré-ARNm favorise l'export de l'ARNm qui fait partie des régulations de l'expression génique eucaryote, et donc là tu favorise encore une production massive de ta protéine.  [...]

[Divers] Faire un graphique pour représenter une cohorte de patients.

J'ai besoin d'un peu d'aide pour pouvoir faire une figure sympa avec mes résultats. J'ai déjà cherché sur google ainsi que dans excel mais je ne trouve pas la solution par moi même, peut-être pourrez vous m'aider.   [...] J'ai analysé l'expression d'un ARNm sur 180 biopsies de cancer.  [...]

[Biologie Moléculaire] Profil d'expression des gènes

qu'est-ce que signifie le profil d'expression des gènes Arnm et protéines.  [...] Le terme est en effet confus, puisqu'il ne précise pas si l'expression d'un gène est déterminé par la quantité de transcrits ou de protéines présentes. Cependant, il est surtout utilisé pour la quantité de transcrits. D'ailleurs la corrélation 1 gène - 1 transcrit est globalement plus vraie que 1 gène -1 protéine.  [...]