• Santé - études, Allèles, Marqueurs

Crossing over et marqueur

Le but est d'effectuer des études de liaisons avec ces marqueurs pour voir si un haplotype (= une série d'allèles de différents marqueur) co ségrège avec le phénotype de la pathologie. Pour cela, tu fais ce qu'on apelle des tests de Lode Score qui vont te permettre d'estimer si l'haplotype est lié ou pas un locus morbide que tu recherches.  [...] Tu fais des études de familles dans lesquelles on retrouve la maladie et tu regardes si les allèles de tes marqueurs sont retrouvés avec le phénotype clinique, plus souvent que ne le voudrait le hasard. Si c'est le cas, tu as un Lode Score supérieure à 3 (car le Lode Score est un log de rapport de proba) donc ca veut dire que tuas 1000 fois plus de chances pour que ton locus morbide soit lié à ton marqueur.  [...]

[Génétique] Comment savoir si un marqueur coségrège avec une maladie? j'ai un exemple.

Sur ce lien, dans la page 5, on étudie quel marqueur entre rs56 et rs12 coségrège avec une maladie. Chaque fois qu'on a la maladie chez les descendants, on a l'allèle 1 pour rs12 et l'allèle 2 pour rs56, a l'exception du premier descendant, qui a les deux allèles 2 pour les les deux marqueurs.  [...] Mais, chez le parent atteint, les deux marqueurs ont les allèles 1 pour la maladie. Comment expliquer ca chez quel individu on a eu une recombinaison je suis totalement perdue. si on veux etudier la cosegregation d'un marqueur avec une maladie comme dans ce cas, quelle est la.  [...]

[Biologie Moléculaire] Améliorer la spécificité d'amorces

Mon problème est que je dois trouver des amorces qui amplifient chez deux espèces apparentées mais qui donnent des allèles spécifiques à chacune d'elles. Pour ce, je teste un large panel de marqueurs, essentiellement des SSR d'EST, pour limiter le polymorphisme intrasp.  [...] Seulement voilà, j'ai quelques marqueurs qui présentent des allèles spécifiques à l'espèce 1, des allèles spécifiques à l'espèce 2 ET DES ALLELES COMMUNS.  [...]

[systematique][evolution] Races - Page 5

La question qui se posait initialement était celle des marqueurs raciaux. Les races diffèrent-elles par des fréquences alléliques variables pour A, B ou O, ou existe-t-il des allèles particuliers dans chaque race La réponse fut intermédiaire, dans ce sens que des études de plus grande ampleur montrèrent, dans le cas le plus extrême, que les natifs d'Amérique, par exemple, ont des fréquences très élevées de l'allèle O (fréquences qui, selon les populations, peuvent atteindre jusqu'à 90 %) et virtuellement pas d'allèle B.  [...] certes, variations des fréquences alléliques autour de modes centraux et absence de limites nettes à cet égard entre les groupes considérés, mais néanmoins justification du concept de race, dont la réalité est mise en évidence par les marqueurs génétiques.  [...]

[génétique] synthèse des molécules à l'origine des groupes sanguins

La relation entre les gènes d'un individu, s'appelle génotype, et les caractères d'un individu s'appelle phénotype. Les allèles A, B, et O qui codent les marqueurs A, O, AB, et B représentent plusieurs génotypes. Ils déterminent tous le même phénotype, c'est-à-dire le phénotype du groupe sanguin.  [...] Dans une famille où les deux parents sont de groupe O, la naissance d'un enfant d'un groupe A ou B est impossible. Le code génétique d'un enfant est formé de la moitié de celui des parents. Si aucun des deux parents n'a d'allèle A ou B (puisque leurs deux allèles sont forcement O car O est récessif )sur le chromosome 9 alors l'enfant n'en aura pas non plus donc les allèles de cet enfant ne marqueront ni pour le groupe A ni pour le groupe B.  [...]

[Génétique] Question sur la dérive génétique

La dérive génétique intervient après, et concerne l'évolution neutre (sans sélection). On la définit comme le changement de fréquences alléliques dans une population pour un marqueur neutre. La dérive génétique entraîne une réduction de la diversité allélique, et souvent on ne retient que cet effet et c'est lui qu'on appelle dérive génétique (mais c'est un abus de langage).  [...] les allèles changent en permanence mais la diversité reste constante. Cela concerne toujours les marqueurs neutres. Pour les marqueurs sous sélection les choses sont très différentes. Après une phase d'adaptation locale, en général pour ces marqueurs les mutations sont délétères et la diversité tend à se réduire (sélection purifiante).  [...]

[Génétique] SNP et microsatellite

Les SNP (Single Nucleotide Polymorphism) et les microsatellites sont des marqueurs moléculaires. Un marqueur moléculaire correspond à un locus sur l'ADN de séquence variable au sein d'une population.  [...] On peut constater qu'au locus étudié on observe dans la population des microsatellites constitués de 14, 16 et 20 répétitions. On a donc dans ce cas un marqueur multiallélique (ici, triallélique). Mais il existe des marqueurs microsatellites ayant bien plus d'allèles.  [...]

de la tache de sang au profil génétique

Pour extraire l'ADN d'une cellule, il y a plusieurs méthodes, le principe est dans un premier temps d'exploser les parois puis de purifier l'ADN. (ex. trizol puis chlorophorme, EtOH et extraction phénolique...).   [...] sinon ensuite tu regarde plusieurs marqueurs (en faite tu regarde quelle allèles d'un locus l'individu possède).  [...]

[Génétique] étude des associations et équilibre de hardy-weinberg

j'ai fait mon projet fin d'études sur l'étude des associations du polymorphisme de certains marqueurs génétiques avec les pathologies.  [...] après une étude moléculaire et un calcul des fréquences ainsi qu'un test d'association (par un logiciel en ligne), j'ai trouvé une forte association du polymorphisme de mon marqueur génétique avec le risque de la survenue de la pathologie étudiée. mais, le problème c'était le fait que la population des malades étudiée (37 échantillons) ne suit pas l'équilibre de Hardy-Weinberg.  [...]

[Biologie Cellulaire] ADN, allèle A,B,O

J'ai mis. Les allèles d'un gène définissent le groupe sanguin (allèle dominant ou récessif) ce qui va donc décider des marqueurs A ou B à la surfaces des cellules sanguines.  [...] sachant que A et B sont dominant (codominants ensemble), on retrouvera les protéines A, ou B ou A et B respectivement sur les globules rouges. L'allèle o est récessif.  [...]