• Santé - Enzyme, Acides aminés, Site

[Biochimie] Acides aminés au site catalytique d'un enzyme

J'aurais une petite question concernant les enzymes se retrouvant au site catalytique d'une enzyme qui est spécifique aux substrats basiques.  [...] Les acides aminés se retrouvant au site catalytique de l'enzyme seraient donc, de façon théorique, des acides aminés acides, qui portent une charge négative à pH 7, par exemple l'aspartate.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Si le substrat et l'enzyme établissent des interactions suffisament importantes, et si le substrat possède la bonne conformation, alors le site actif, généralement de 2-3 acides aminés, pourra jouer son rôle de catalyseur.  [...] C'était une mauvaise idée, l'enzyme dispose de moyens de contrôle et le dégrade. Pourtant, s'il a pu pénétrer à proximité du site actif, c'est que l'enzyme peut se lier à plusieurs acides aminés, structurellement proches.  [...]

[Biologie Moléculaire] Enzymes de restriction VS fragment d'ADN

Pour ce qui est de l'explication moléculaire de la reconnaissance de la séquence par l'enzyme, cela se fait par complémentarité structurale et chimique entre les nucléotides de la séquence palindromique et les acides aminés de l'enzyme. C'est un système assimilable à une clef et une serrure.  [...] une seule clef ira dans une seule serrure (en oubliant les passe-partout pour l'exemple bien entendu ). La reconnaissance du site par l'enzyme induit un changement conformationnel de l'enzyme qui va approcher les acides aminés du site catalytique à proximité du site de clivage.  [...]

[Biologie Cellulaire] Principe d'émergence - Acides Aminés et Enzyme

On syntéthise les protéines à partir des acides aminés, qui est une de nos propriétés. mais je n'arrive pas à voir le lien avec l'enzyme fonctionelle.  [...] L'enchaînement particulier des acides aminés, leur positionnement au sein du site catalytique de l'enzyme sont cruciaux pour que l'enzyme soit fonctionnelle. Un décalage de quelques angströms d'un acide aminé et la catalyse peut être perturbée. Au niveau de l'émergence, je ne vois pas de lien direct fort et évident.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site actif est la région de l'enzyme où à lieu la réaction qu'elle catalyse. C'est là que le substrat de l'enzyme va être transformé en un nouveau produit en réagissant avec le ou les acides aminés de ce site.  [...] L'activité de l'enzyme dépend de la forme et de la taille de la serrure et aussi des acides aminés au fond. Les acides aminés ont des groupements chimiques différents au niveau de leur chaine latérale. C'est la chaine latérale qui différencie les acides aminés en fait.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

- Nous avons dit dans le Cours 1 (Le phénotype dépend des protéines) que la structure des protéines est due aux affinités entre les différents acides aminés et dans le cours 2 (L'activité enzymatique) que la structure de l'enzyme (qui est une protéine) était due aux différentes liaisons liant les acides aminés.  [...] - Il est écrit à la fin du paragraphe concernant le fonctionnement du site actif. La moindre mutation entraînant une modification de la séquence des acides aminés du site actif provoque une baisse d'efficacité voire une inactivité de l'enzyme. Si cette mutation concernait des acides aminés qui ne se trouvent pas dans le site actif, l'enzyme perdrait ou non en efficacité.  [...]

[Biologie Moléculaire] Urgent Clonage

2. Les amorces doivent couvrir combien d acides aminés de l insert Doivent ils contenir uniquement une partie de l insert et un site de restricrestriction.  [...] 2 de nucléotides (acides aminés = protéine...), autour de 20, plus la partie qui contient le site de restriction, plus quelques uns pour permettre la bonne digestion par l'enzyme. une trentaine en tout.  [...]

les enzymes catalyse de la réaction enzymatique

Les acides aminés ont des propriétés propres, ainsi une suite d'acides aminés précise prendra dans l'espace une conformation précise (pour faire simple). Donc chaque enzyme à une conformation spatiale qui lui est propre, car une séquence d'acides aminés qui lui est propre.  [...] L'enzyme agit sur le substrat au niveau du site actif (une portion de l'enzyme qui agit avec le substrat). Tu comprends que si la séquence an acides aminés (la strucutre primaire) change, tu risques de changer la strucutre spatiale du site actif. Ton enzyme ne peut plus réagir avec le substrat, elle ne remplit plus son rôle.  [...]

Besoin d'un peu d'aide : enzymes et acides aminés

Bonjour, cela est du à la conformation de l'enzyme, son site actif n'est accessible et actif qu'à pH acide. Le changement de pH induit un changement de conformation. Quant aux acides aminés impliqués, il s'agit souvent d'un acide aspartique.  [...] Forcément si les charges des acides aminés sont impliquées dans la forme de la protéine, si on fait varier le pH, on fait également varier les charges des acides aminés et donc on peut modifier la forme de la protéine. Souvent dans le cas des enzymes, le repliement fait apparaitre une poche (appelé site actif ).  [...]

Ph et activité enzymatique

Bonjour à tous, Je me demandais comment le faite de s'éloigner du Ph ou de la température optimale pour lesquels une enzyme est la plus fonctionnelle agirait sur les acides aminés du site actif Je sais qu'au delà, elle perd progressivement sa fonction catalytique jusqu'à se retrouver dénaturée ( voir inactive ) mais je ne fais pas le lien avec l'interaction sur les acides aminés.  [...] Pour prendre un exemple, une enzyme avec un site actif à cystéine n'est fonctionnel que si la cystéine est sous forme thiolate (S-), donc si tu augmente la concentration en proton (en diminuant le pH), tu va petit à petit réduire la totalité des cystéines sous forme de thiol (SH) qui seront incapable de réagir avec le substrat.  [...]