• Santé - Domaines, Liaisons, Protéines

Protéines dimériques

Dans mon cours, on insiste bien sur le fait que les protéines globulaires ne possedent pas de liaisons covalentes dans leur structure quaternaire.  [...] Pour les types de liaisons entre les domaines constitutifs des chaînes lourdes et légères, je pense à des liaisons 'classiques' non covalentes entre sous unités d'une protéines constituée de plusieurs sous unités.  [...]

[Biologie Moléculaire] Analyse d'une séquence protéique

Je recherche des sites ou logiciels qui permettent de prédire à partir de la séquence de ma protéine d'intérêt, la présence de domaines de liaisons à des protéines régulatrices, des motifs particuliers, des sites de phosphorylation...etc.  [...] Une multitude d'outils sont dispo ici pour l'analyse des protéines. http.//expasy.org/tools/.  [...]

Origine de la vie : analyse critique de documentaires

Déjà certains l'auront remarqué, les microbes du film sortent directement de la cheminée du fumeur noir. En réalité la vie n'est pas apparue comme ça, mais surtout les bactéries des fumeurs qu'on connaît croissent sur le pourtour des cheminées, l'eau étant à peine mais suffisamment plus froide pour autoriser la stabilité essentielle d'une grande partie des liaisons faibles qui maintiennent des macro-structures comme la précieuse membrane plasmique, ou encore les structures secondaires et tertiaires des protéines.  [...] La raison plus chimique tient à la multiplicité des liaisons chimiques pouvant être excitées par la lumière. Dans les longueurs d'onde des domaines visibles et avoisinnant, cela peut occasionner des changements de conformation comme chez la rhodopsine (pigment rétinien impliqué dans la vision du rouge), à des lyses occasionnelles (comme le brin d'ADN ou des protéines sous UV).  [...]

[Biologie Moléculaire] Les récépteurs SH2 et SH3

(Je prends le cas du récepteur à l'insuline) Les protéines adaptatrices présentent des domaines de liaisons SH2 et SH3. J'ai cherché sur google et je suis tombé sur un bouquin qui annonce que la première protéine adaptatrice (que j'appelle A) présente un seul et unique domaine de liaison SH2 mais plusieurs SH.  [...] Du coup la liaison de cette protéine à la tyrosine phosphaté du récepteur de l'insuline ne se fait qu'au niveau du SH2 qui n'est pas possesseur d'une activité de type kinase. Les autres protéines adaptatrices (que j'appelle B) vont se fixer sur A par les sites SH3 qui ont par contre une activité de type kinase (phosphorylation des B = activation des B).  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

J'ai souligné une partie de ton propos qui est erronée. attention, dire que des domaines protéiques se lient à des domaines d'ADN par complémentarité signifie que tu as une liaison entre une base azotée contenue dans un nucléotide et un acide aminé provenant d'une protéine à la manière dont cela est possible entre les bases azotées au sein de l'ADN.  [...] Je cite. Il ne faut pas perdre de vue le fait que les protéines ayant des domaines de liaison à l'ADN reconnaissent une forme. Donc, c'est une forme qui a été favorable et qui s'est maintenue.  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

C'est sur ce domaine que viennent se fixer les activateurs, le calcium et les cofacteurs. Cette partie de la protéine est également impliquée dans les phénomènes de reconnaissances et de liaisons protéine-protéine, l'ensemble de ces éléments permettant de contrôler l'activité et la localisation de l'enzyme dans la cellule.  [...] Il existe d'autres domaines C1 dans d'autres enzymes (Raf-1 kinase par exemple), mais ces protéines ne sont pas capables de lier les esters de phorbol. En comparant les structures primaires des domaines, on remarque l'absence, dans le second cas, des résidus d'acides aminés nécessaires à la formation de la poche hydrophobe, et donc au site de liaison (Toker A., 1998.).  [...]

De l'intérêt d'être chaperonnée... pour une protéine!

Autant que je sache, ces protéines chaperonnes permettent de faciliter l'acquisition de structures particulières. lors de la biosynthèse de protéines complexes. En ce sens, certaines protéines chaperonnes peuvent être généralistes, mais si la structure ou des domaines de la protéine doivent être spécifiques, et ne s'appliquer qu'à quelques protéines données, il doit y avoir des chaperonnes spécialisées, non J'espère en apprendre plus là-dessus en licence.  [...] Sur les bases moleculaire du repliement, meme si bcp de chose nous echappe encore, une des caracteristiques communes a toutes les proteines mal repliées, est d'exposer a leur surface des domaines hydrophobes qui devraient etre enfouis a l'interieur de la proteine.  [...]

récepteur membranaire, transduction du signal

Je ne comprends pas ce que sont les protéines adaptatrice. Elles interviendraient dans la transduction du signal après l'activation d'un récepteur par son ligand. J'ai un cours dans lequel des domaines (SH2, PTB, 14.3.3, SH3, etc... ) sont cités mais leur lien avec les adaptateurs n'est pas expliqué, ni leur rôle d'ailleurs.  [...] Souvent cela passe par des domaines d'acides aminés particuliers. Ce que vous citer ici SH2, SH3... ne sont pas des protéines, mais des domaines contenus dans certaines protéines, notamment les tyrosines et sérines, si je ne m'abuse.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

4- Deux enzymes ne partageant pas d'ancêtres communs, d'architecture différentes ont la même activité, à savoir hydrolyser la liaison peptidique dans des protéines. C'est par exemple le cas des protéases à sérine, les protéases de la famille de la trypsine et de la famille de la subtilisine.  [...] Pour rappel, cette classification s'intéresse aux domaines, touchant à la structure tridimensionnelle des protéines. Les domaines sont les constituants semi-indépendants de la structure 3D globale d'une protéine. Dans la classifications SCOP, les protéines sont subdivisées 7 grandes classes.  [...]

[Biologie Moléculaire] addition de nouveaux gènes ?

D'une autre façon, la duplication a permis aussi de placer des domaines fonctionnels sur des gènes de fonction différente, car pour beaucoup de protéines que l'on rencontre, elles sont formées d'un assemblage de domaines fonctionnels réparties de façon diverse et avec une variabilité de combinaison qui régit la diversité de fonction de ces protéines.  [...] ...Atten tion, je ne veux pas dire que les protéines appartenant à ces voies possédent toutes le domaine que je leur ai attribué, c'est plutôt que ces domaines sont très retrouvés dans la voie où je les ai placés.  [...]