• Santé - Coupe, Séquence, ADN

Dénaturation de l'adn en pH acides

heu... ben southern blot c'est le nom de la methode. Le principe de la methode est d'hybrider une sequence d'ADN connue sur un pannel de sequence d'ADN inconnues (banque d'ADN, ADNg coupé par des enzymes de restriction, etc...) pour mettre en evidence la presence ou l'absence de la sequence connue.  [...] Donc en fait c'est le même principe pour le Northen Blot pour l'ARN et le Western Blot pour les protéines. Aucun séquençage n'est possible. Tout n'est qu'identification.  [...]

[Biologie Moléculaire] Projet génome humain: le balisage?

Après par contre, je n'ai pas bien compris pourquoi on avait coupé l'ADN en morceaux, qu'on l'avait mis dans une espèce de soupe pour savoir quelle était la séquence intéressante, parmi les centaines de milliers de fragments produits.  [...] Bref, ce n'est pas sans rappeler la technique du YAC. c'est ça qui a été utilisé.   [...]

amplification de l'ADN

Il est stipule que l'ADN-polymerase a besoin d'amorces en bout de sequence pour pouvoir la dupliquer. Cette amorce doit correspondre exactement avec le debut (ou fin) du brin d'ADN que l'on veut dupliquer.  [...] moi, je veux savoir si, au moment de l'ajout de l'amorce, c'est possible de lier au bout de la sequence une suite de nucleotides qui auraient la meme fonction qu'une amorce...cela reviendrait a coller une suite de nucleotides a un brin d'ADN deja coupe. Etant donne que, in vivo, il existe des enzymes qui ont les proprietes de couper et coller des genes ou suites de nucleotides, je me demande si je peux les utiliser pour enchainer des bouts d'ADN.  [...]

Biohacking : il modifie son ADN pour être plus musclé

Ce dernier s'est en effet injecté dans le bras une molécule d' ADN codant pour la protéine Cas9 et un ARN guide qui cible la séquence du premier exon du gène de la myostatine. L'idée est que, dans la cellule, Cas9 coupe le gène de la myostatine qu'elle aura reconnu grâce à l'ARN guide.  [...] A u CRI, tout est fait dans le cadre d'un laboratoire, souligne M. Lindner, qui depuis 2007 encadre un petit groupe d'étudiants passant leurs vacances d'été à préparer un concours lancé en 2004 par le prestigieux MIT américain. Une compétition invitant à manipuler des briques biologiques standardisées ( Biobricks ) afin de créer des bactéries dotées de nouvelles fonctions.   [...]

Codon initiateur et protéine

Les bactéries possède en amont du codon start AUG (donc dans le 5' UTR) une séquence RBS (Ribosome Binding Site) qui permet de recruter la sous-unités 30S du ribosome. Le RBS bactérien est appelé Séquence Shine-Dalgarno et c'est un motif riche en purine. La séquence Shine-Dalgarno permet le recrutement de la sous-unité 30S car celle-ci possède un ARNr 16S qui a une séquence Anti Shine-Dalgarno (ASD).  [...] Mais, c'est du racolage.. Comment dans une science aussi précise que la génétique, on dis que les exons se regroupent comme si on avait coupé les bords d'un pain de mie Moi je vois l'ADN comme une séquence de nucleotides agencés précisément, alors rassembler des nucleotides qui a la base ne sont pas côte à cotes je ne vois pas bien.  [...]

[Biologie Moléculaire] Sequencage supplémentaire de quelques centaines de bases

Connaitriez-vous une technique permettant de séquencer quelques centaines de bases en amont de ma séquence déjà connue sans utiliser des primers dégénérées (j'ai pensé a de la marche sur l'ADN (type seegene DNA walking kit) mais ca ne rentre pas dans mon budget. ).  [...] une solution s'il n'est pas cloné, c'est de digérer ton ADNg par une enzyme qui ne coupe pas dans le fragment deja séquencé. Puis tu religatures les fragments sur eux meme pour avoir des molécules circulaires. Ainsi tu peux réaliser une amplification par PCR a partir de deux oligos en sens opposé situés dans la séquence deja clonée.  [...]

[Biochimie] Enzyme de restriction

Le cas le plus utilisé en biotech, c'est les enzyme de type II qui vont couper à l'intérieur de la séquence de reconnaissance. C'est en général une séquence d'environ 6 nucléotides et une séquence palindrome, c'est-à-dire que les deux brins, lus dans le même sens (3'-. 5' par exemple) vont donner la même séquence.  [...] Du coup si on nous dit qu'une enzyme coupe la séquence 5'CCCAAA en son milieu, elle coupera aussi une séquence 5'AAACCC (vu qu'elle coupe 3'AAACCC) ou elle différenciera une paire de base AC d'une paire de base CA dans le grand sillon.  [...]

Qu'est-ce qu'une cellule érythroïde ?

Par contre, pour la DNase, ce que je me demandais c'est justement dans quelles conditions elle coupe l'ADN, mais l'on m'a dit qu'elle intervenait pour synthétiser le deuxième brin d'ADN dans la chromatine. Est-ce que c'est le cas.  [...] A propos de la chromatine, est-ce que le passage de l'hétérochromatine à l'euchromatine existe, et si c'est le cas, est-ce que cela nécessite l'intervention d'une DNase.   [...]

[Biologie Moléculaire] enzymes de restriction

Pour vérifier qu'un ADN est coupé, il faut le mettre en présence de désoxyribonucléotide fluorescents, si l'adn est coupé ces désoxyribonucléoitides vont se fixer sur l'extrémité 3'OH libre, est cela.  [...] L'électrophorèse est une bonne idée. quand un ADN est coupé, il n'a plus la même taille, d'où le choix de l'électrophorèse qui est LA technique permettant de séparer des molécules d'ADN de tailles différentes.  [...]

replication

Reprenons notre histoire. Les nucléotides triphosphates sont captés par l'ADN pol 3. Elle clive (coupe) ensuite les deux phosphates de l'extrémité (nommés phosphates beta et gamma ). La ruptude de cette liaison va fournir à l'ADN pol 3 l'énergie suffisante et nécessaire pour continuer son travail ( voir thermodynamique ).  [...] Prenons l'exemple d'un maillon de chaine. Tu veux rallonger ta chaine, tu prend un maillon ouvert, tu le glisse dans le maillon d'une extrémité de ta chaine et tu le referme. Beh tout çà demande de l'énergie à ton ADN pol 3, énergie qui est libérée lorsque celle-ci coupe tes liaisons phosphates.  [...]