• Santé - Concentration, ADN, Fragments

[Biologie Moléculaire] Calcul de rendement

Sachant que Rendement = (Concentration après purification) / (concentration avant purification), il me manque donc la concentration avant. On connait la concentration d'ADN (donc celle du plasmide) présente initialement. Cependant, pour connaitre celle des fragments présents (donc l'extrémté 5', après digestion) j'essaye cette formule. (Concentration ADN * (784/5484)). Donc.  [...] Les autres ne sont pas ceux dont tu as besoin. Donc, il n'est pas nécessaire de multiplier la concentration de l'ADN plasmique par le nombre des fragments théoriques (5484/784).  [...]

[Biologie Moléculaire] De la PCR à la méthode Sanger

[Biologie Moléculaire] De la PCR à la méthode Sanger.   [...] Après l'amplification d'un brin matrice par PCR, il y aura des produits PCR, pour un séquençage par la méthode de sanger, ces produits pcr doit être purifiés mais lors de la réaction de sanger, comment on évalue la concentration d'ADN, c'est à dire après la PCR on obtient plusieurs fragments d'ADN alors que par la méthode sanger c'est un seul fragment qui sera séquencer à ma connaissance.  [...]

[Biologie Moléculaire] Preparation d'une gamme étalon ou standard pour PCRq

Car c'est surement une mauvaise lecture de ma part, mais en te lisant j'ai eu l'impression que tu voulais une gamme pour relier directement a une quantité en ng ou nmol initiale de ton gène, un peu comme en biochimie on prépare une gamme de BSA pour obtenir une concentration de protéines.  [...] relier ton Ct aux Ct d'ADN de concentration connu je ne suis pas sur que cela puisse se faire puisque x ng ou x nmol ne représente pas une quantité de transcrit (selon la taille des fragments), en plus de ca, dans les quantifications, les nucléotides libres sont aussi pris en compte, les primers aussi.  [...]

[Biologie Moléculaire] le gel idéal??

Je ne sais pas ce que tu veux faire avec ton ADN, mais si tu le quantifies A 260 il faut d'abord que tu degrades l'ARN et que tu repurifies l'ADN, sinon ta concentration va etre plus que fausse. Generalement dans les extractions old school il y a une etape de traitement a la RNase avant la precipitation.  [...] C'est inutile de diminuer encore la concentration en agarose dans le gel. Les fragments d'ADN génomique sont simplement trop gros pour être résolus dans un gel d'agarose en électrophorèse classique. Mais ce n'est pas ce que vous souhaitez faire, donc pas de souci à avoir.  [...]

[Biologie Cellulaire] Reverse transcription et amorçage avec hexamères aléatoires ?

La concentration en amorces aléatoires conditionne la taille des fragments d'ADNc synthétisés. En effet, la longueur moyenne des brins synthétisés est inversement proportionnelle à la concentration en amorces. La concentration d'amorces aléatoires doit donc être déterminée en fonction de la taille du fragment à amplifier.  [...] On peut utiliser des quantités d'hexamères allant de 20 ng (ADNc longs) à plus de 5 µg (ADNc courts) pour une réaction de 20 µL. Il faut noter que de fortes concentrations d'hexamères n'exercent pas d'action inhibitrice sur la RT.  [...]

[Biochimie] differencier deux gel d'agarose de concentration différente

l'utilisation de gel d'agarose à forte concentration (3 à 4%) est nécessaire pour des fragments inférieurs à 150 pb, car elle permet une meilleure séparation et résolution des différentes bandes en fonction de leur différence de taille.  [...] Concernant la fin du message, utiliser une concentration forte permet de mieux retenir les petits fragments, c'est donc indiqué lorsq'on a des fragments de taille inférieure à 150 pb. On perdra alors les plus gros, qui migreront très peu (voire pas du tout) et ne seront pas séparés.  [...]

La PCR fragments d’adn

Tu concentres, et tu fais ta PCR. Il peut être bon de couper l'ADN préalablement par une enzyme de restriction pour avoir des fragments plus courts avant la PCR.  [...] Et si on n'a pas de suspect Si on veut authentifier un individu à partir de traces de salives qu'il a laissées sur la scène de crime Il faut obligatoirement passer par un suspect Si le tueur est fiché au FAEG n'y a t'il pas de moyens techniques qui permettent de dire à partir de la migration des fragments de l'adn Prélevé de la Scène de crime que cela correspond à un tel individu par exemple.  [...]

[Biologie Cellulaire] enzyme de restriction

Il est très possible de cloner un fragment d'ADN génomique amplifié par PCR dans un plasmide extrait mais non amplifié, mais il est préférable de déterminer la concentration approximative disponible de ces 2 olécules avant de les utiliser.  [...] Personnellement je n'ai jamais eut de probleme, mais je passe par une etape de purification sur colone ce qui me permet probablement de m'en debarasser (de la meme maniere que les fragments d'ADN clonés apres migration sur un gel d'agarose+BET. Ceci dit, il en faut vraiment pas bcp, car meme a tres faible concentration ca inhibe tres fort la digestion.  [...]

L'ADN révèle le contenu des amphores grecques

Les méthodes d'amplifications des fragments d' ADN permettent aujourd'hui de rendre bavards aussi bien des os que des objets archéologiques. On en a vu un exemple récemment avec l'ADN de l'Homme de Néandertal.  [...] Effectivement, de l'ADN de raisin a bel et bien été trouvé dans 5 des amphores examinées. Mieux, dans 6 d'entre elles, on a aussi trouvé des fragments d'ADN provenant de légumes, de thym, d' origan, de menthe, de gingembre et même de genévrier. Surtout, des traces de ces différents produits ont été retrouvées dans une même amphore.  [...]

TPE sur l'ADN aide pour l'électrophorèse :)

L'électrophorèse consiste a faire migrer des fragments d'ADN dans un gel grace à un champs électrique. L'ADN étant chargé négativement les molécules vont se déplacer vers la cathode. Comme le gel, consiste en un maillage, les grandes molécules sont plus retenues que les petites.  [...] à chaque '= bande correspond un fragment d'ADN. En comparant les profils de ta salive et de tes suspects tu peux potentiellement trouvé le coupable. Mais j'avoue de jamais avoir entendu qu'on pouvait utiliser une électrophorèse pour la criminalogie. J'aurai plutot pensé au polymorphisme du génome.  [...]