• Santé - Charges, Positif, Histones

[Biologie Moléculaire] Protéines Histones

Est-il vrai que les protéines histones sont chargés positivement et qu'il servent à neutraliser la molécule d'ADN.  [...] Oui en partie. C'est pour cela que l'acétylation des histones diminue l'interaction histones/ADN en modifiant la charge des histones.  [...]

acétylation et methylation

L'acétylation rajoute un groupe acétyl par la HAT (histone acetyl transferase) sur la lysine, elle a pour effet de faire perdre des charges positif aux chaînes N terminale des histones qui avait pour but d'interagir avec les groupement polaires, qui sont alors négatif de la molécule d'ADN.  [...] Si tu enlève des charges positif alors cela entraîne une interaction moins importante avec l'ADN donc une décondensation. La méthylation à l'effet inverse, elle condense la chromatine. Il me semble que pour la lysine 4 de l'histone H3 cela n'est pas valable néanmoins ( il faudra que tu vérifies).  [...]

histone

Et bien si ton histone est basique ça veut dire qu'on peut penser que son pKa global est supérieur à 7 sans trop de risque... (on devrait d'ailleurs plutôt parler de pHi. pH isoélectrique, mais dans l'idée c'est pas très loin).  [...] (ceci comprend en fait la moyenne de nombreux groupements, ce qui traduit le pHi, car si la forme zwitterionique de l'histone se situe à un pHi. 7, pour un pH. pHi, comme pH 7, alors tu peux dire que ton histone est plus protonée que ta forme zwitterionique).  [...]

Mode d'action d'une toxine fongique, incompréhension

Je ne comprends pas pourquoi on dit que la toxine HC d'un champignon inhibe l'expression de gènes de défenses d'une plante hôte, lors d'une infection de la plante par ce parasite. En effet on dit que la toxine HC inhibe une histone déacétylase, or justement quand l'histone déacétylase fonctionne elle restaure les charges positives des histones des nucléosomes en enlevant le groupe acétyle, donc l'ADN se recompacte (hétérochromatine) et la transcription ne se fait pas.  [...] Mais ici l'histone déacétylase est inhibée par la toxine donc ne fonctionne pas, l'ADN ne se recompacte pas et on a de l'euchromatine (transcription qui peut se faire car ADN décondensé localement) donc normalement on devrait dire que la toxine HC active l'expression de gènes de défenses de la plante, bizarre tout ça.  [...]

Interaction ADN-HISTONE

Un premier cours indique que les histones sont des protéines composées de 20% d'AA basiques (Arginine et Lysine notamment) et que ces protéines ont par conséquent, une charge globale positive. L'ADN comporte une charge globale négative. Par conséquent, les histones et l'ADN sont liés par des liaisons ioniques.  [...] Un second cours affirme le contraire. Il part du principe que l'extrémité N-term des histones est particulièrement riche en AA basiques et donc en AA positifs qui interagissent directement avec l'ADN (charge globale négative) par des liaisons ioniques.  [...]

[Biologie Cellulaire] Réplication

Je n'affirmerais rien mais il me semble les histones sont simplement chargés et se décalent pour permettre la réplication (ou transcription). Donc pour moi pas de changement très important, peut être un changement conformationnel tout de même.  [...] histones acétyltransférases (HAT), histones déacétylases (HDAC), le complexe SWI/SNF qui ont des rôles centraux dans les processus de condensation/décondensation.  [...]

[Biologie Cellulaire] Fixation d'une protéine à l'ADN

[Biologie Cellulaire] Fixation d'une protéine à l'ADN.   [...] oui c'est effectivement la cas pour les histones par exemple qui ont leurs extrémités chargées positivement (résidus arginine et lysine) et qui se lient aux résidus phosphates de l'ADN (chargé négativement).  [...]

[Biologie Moléculaire] Acétylation/méthylation des histones

Le problème c'est que je ne comprends pas puisque l'acétylation des histones est censée leur faire perdre leur charge positive, donc les éloigner en quelque sorte de l'ADN pour le rendre plus accessible à la machinerie de transcription, c'est donc pas un répresseur normalement.  [...] Waiwai, t'as du louper quelque chose pendant ta prise de note parceque l'acétylation des histones est bien une des modifications post-traductionnelles qui favorise la transcription génique. En neutralisant la charge positive portée par le résidu lysine et en allongeant son radical, elle modifie la conformation de la protéine et par là même son interaction avec la molécule d'ADN chargée négativement (par ses groupements phosphates).  [...]

débrifing sur l'ADN.

Je me demandais si les nucléosomes entraient dans la composition de l'aADN mitochondrial Je sais que les histones non mais je ne m'étais jamais faite la réflexion pour les nucléosomes.  [...] Le nucléosome est stable car il est constitué d'histones basiques dont la charge positive permet une interaction forte avec les groupement phosphates de l'ADN double brin, c'est cela J'avais lu quelque part que les liaisons hydrogènes intervenaient, est ce possible.  [...]

[Biologie Cellulaire] SAR et Histones

Attention également, décondensé ne veut pas dire dépourvu d'histone. la réplication et la transcription de l'ADN se produisent au niveau de la fibre nucléosomique, c'est à dire la structure chapelet de perles (largeur. 11 nm). Il y a donc bien des histones puisque qu'il y a des nucléosomes (mais pas les H1).  [...] Au niveau de condensation supérieur, c'est la forme. solénoïde (largeur 30 nm). C'est ici que l'on retrouve les histones H1. Elles permettent l'association des nucléosomes entre eux (des perles effectivement). Par abus de langage, et lorsqu'on ne souhaite pas rentrer dans les détails, on peut considérer qu'elles séparent deux nucléosomes bien que là aussi ce ne soit pas une définition et qu'on pourrait trouver de nombreux arguments pour réfuter cette affirmation.  [...]