• Santé - Charges, Acides aminés, Interactions

[Biochimie] Formation de liaisons électrostatiques en absence de résidus chargés ?

Bien sûr, les liaisons électrostatiques ne sont pas dues aux charges portées par les acides aminés mais aux interactions atomiques.  [...] Oui il y a des charges locales sur les chaînes latérales des acides aminés, qui rendent possibles des intéractions électrostatiques.  [...]

[Biochimie] Est-il possible de réaliser le séquençage des acides aminés impliqués dans des interactions

Je suis en troisieme année de biochimie, j'ai effectué un TP dans lequel il fallait déterminer les fragments d'interaction d'une protéine avec l'héparine apres.  [...] Je voulais savoir si il était possible de séquencer les acides aminés de la protéine qui peuvent interagir avec l'héparine.  [...]

[Divers] Confusion sur les notions "basiques"

La structure primaire c'est l'enchainement des acides aminés ou des acides nucléiques. La structure secondaire se sont les interactions entre les acides aminés (nucléiques) de la chaine qui entraine un repliement de cette dernière.  [...] Il existe aussi une structure tertiaire qui consiste en une interaction entre les différentes structures secondaires.  [...]

hélice alpha

j'ai une question concernant l'hélice alpha d'une protéine. sur mes cours il y'a écrit que l'hélice se stabilise grâce a des liaison H mais aussi grâce a des interactions hydrophobe entre les chaines latérales des acides aminés, mais comment il peut y'avoir des interactions entre les chaines alors qu'elles sont toujours orientées dans des directions opposées.  [...] L'interaction hydrophobe se fait entre deux acides aminés qui se trouvent l'un au-dessus de l'autre sur la spirale, avec des chaînes latérales dans la même direction.  [...]

structure du collagène

je me demandais combien le collagène de type I compte d'acides aminés modifiés, et la nature des ces acides aminés ainsi que de leurs modifications, quelqu'un peut-il m'aider.  [...] l'article précise que les molécules de collagène sont liées entre elles par des interactions hydrogène, mais ne parle pas des acides aminés modifiés, à part l'hydroxyproline (j'ai lu l'article en diagonale, j'en ai peut-être ratés certains).  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Une devinette alors j'me mouille. l'ADN possède un phosphate incomplétement oxydé. L'adn est alors chargé négativement. Il faudrait donc des acides-aminés chargés positivement...A moins qu'il ne faille des AA basique comme l'ADN est acide...langue au chat.  [...] J'ai oublié mais la thymine peut également établir des interactions hydrophobes via son groupement méthyle CH3. Tout ça plus la succession des nucléotides permet de rendre un site spécifique. Et ça dépend aussi bien sûr de la composition en acides aminés de la protéine et de son repliement.  [...]

Structure canonique des ARNt

D'une manière générale, les interactions dites canoniques permettent d'avoir des hélices, feuillets etc... et déterminent donc la structure secondaire des protéines.  [...] Je resterai sur la structure secondaire pour être sûr. (Car pour la structure tertiaire, les interactions canoniques ne sont pas les principales acteurs, il y a la polarité des acides aminés etc..).  [...]

[Biologie Moléculaire] Biotine - Avidine

Essaie de trouver la structure tertiaire (elle est organisée en feuillets ß anti-parallèles) de l'avidine avec le site de liaison à la biotine. À mon avis, il doit y avoir une certaine conformation des acides aminés impliqués dans le site de liaison (qui est, en l'occurrence, une boucle) formant une cavité qui doit être très profonde, rendant l'affinité aussi grande.  [...] Tiens-nous au courant quand tu auras trouver la structure spatiale de la liaison, les acides aminés impliqués dans les interactions hydrophobes et ceux dans les liaisons hydrogènes. Pour moi, vue la force de la liaison, j'opterais soit pour la phénylalanine/le tryptophane/la proline comme intervenant dans ces interactions hydrophobes.  [...]

[Biochimie] migration des AA proline glutamine

Je me demande si quelqu'un connait l'influence des acides aminés proline et glutamine sur la migration de protéine en condition dénaturante.  [...] Dans le cas d'a.a chargés on pourrait avoir des interactions avec le PAGE et donc ralentir ou limiter la migration du peptide... Mais là ce n'est même pas le cas, les aa cités ne sont pas chargés.  [...]

Topoisomérase , hélicase

Les hélicases utilisent de l'énergie pour ouvrir deux brins d'acides nucléiques complémentaires attachés par des interactions hydrogènes.  [...] tandis que l'hélicase (qui intervient juste aprés topoesomérase) va ouvrir la chaine déroulée donc il va engendre la formation de l'oeil de réplication.   [...]