• Santé - Biologie moléculaire, Mutation, Protéine

[Biologie Moléculaire] Mutation de la protéine DsRed

En classe, lors de TP, nous avons étudié la protéine DsRed ainsi qu'une de ses formes mutées. Il s'agissait d'une mutation ayant eu lieu sur l'acide aminé 43 (ou 42 peu importe...) et qui substituait une Glutamine pour une Asparagine. Il s'agissait donc d'une mutation neutres puisque ces deux acides aminés sont de la même famille.  [...] Aussi la mutation n'a pas eu lieu sur les acides aminés responsables de la couleur rouge à l''origine de la protéine. Cette mutation a eu lieu sur AA éloigné (en position 43). Je ne comprends pas pourquoi cette mutation a l'effet d'ammoindrir la fluorescence de la protéine alors que l'acide aminé remplaçant est de la même famille que le substitué.  [...]

cancer et hérédité

Alors que des études plus poussées, je parle de la biologie moléculaire et de la biochimie structurale, permettent de dire avec précision. telle mutation provoque tel changement dans la structure de la protéine, ce qui fait qu'elle ne peut plus interagir avec ces facteurs là, ou autre chose.  [...] Mais LXR, je ne vois pas ce que tu reproches aux statistiques, à part de ne pas faire de biologie moléculaire, ce qui est normal. C'est un outil mathématique qui permet de comprendre des choses, et pas de soigner. Sans les stats, je pense qu'on serait dans le brouillard total en génétique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Petit point sur les interactions protéine-protéine

Je sais qu'une protéine X interagit avec une autre protéine Y... et en gros je dois caractériser cette interaction... du genre localisation du site d'interaction, détermination de la séquence protéique necessaire à cette interaction. j'ai bien pensé à des trucs du genre épitope mapping, construction de mutants et étude de l'interaction avec ces mutants.  [...] Tu peux aussi faire du double hybride en faisant de la mutagenese aleatoire sur tes 2 proteines. Quand tu perds le double hybride c'est que tu as touche un site important pour l'interraction. Il ne te reste alors plus qu'a le sequencer et le caracteriser in vitro (meme pas obligatoire je dirais).  [...]

[Biologie Moléculaire] Base de données interactions protéine-protéine ?

[Biologie Moléculaire] Base de données interactions protéine-protéine.  [...] Je cherche une base de données regroupant, pour une protéine donnée, tous ses partenaires protéiques répertoriés dans la littérature (toutes techniques confondues, et sans vouloir me taper PubMed à coup de keywords). Les base de données protéiques que je connais ne fournissent pas ce genre d'informations (elles sont axées sur la reconnaissance de domaines/motifsconservés, ou compilent des infos sur une famille de protéine, etc.).  [...]

[Biologie Moléculaire] Prédiction phénotypique d'une mutation

J'ai trois mutations sur le gène Cdkn1B. J'aimerais connaitre les conséquences sur l'expression de la protéine (transcription, traduction, ou épissage impossible ou caduque), sur la fonction de la protéine, sa conformation ou autre chose (adressage au cytoplasme du mRNA).  [...] Des mécanismes de dégradation des cyclines sont mis en place afin d'assurer la progression de la cellule dans le cycle. La protéolyse d'une cycline est indispensable à l'inactivation de la cdk associée. Le mécanisme de destruction fait intervenir une boite de destruction qui semble marquer la cycline pour la fixation de molécules d'ubiquitine (phénomène d'ubiquitination), est nécessaire pour la transition cellulaire de repos à l'état de prolifération.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutation alterant le promoteur..

Bon, je rappelle le principe quand même. quand la Tm du fragment est atteinte, le fragment se dénature partiellement, ce qui stoppe sa migration. Est-ce qu'il est possible d'avoir une mutation telle que la Tm du fragment soit augmentée, càd qu'il se dénaturera avant le fragment natif.  [...] je crois que c est plutot l inverse dans ce que tu as dis non si une mutation fait que la Tm soit augmentée ca voudra dire qu il se dénaturera aprés mon fragment natif non je ne crois pas que cela soit possible a part si la mutation fait que le nombre de C/G augmente.  [...]

[Biologie Moléculaire] cancer retrovirus et mutation

je me demandais... est-ce que tous les cancers sont dus à des rétrovirus Ne peuvent-ils pas avoir pour origine des mutations du génome ou encore des modifications épigénétiques.  [...] Non tous les cancers ne sont pas dus aux retrovirus. Par exemple l'amiante n'est pas un retrovirus et pourtant c'est la cause du mésothéliome...Et puis certains adénovirus sont aussi à l'origine de cancers.   [...]

[Biologie Moléculaire] Détecter une mutation insertionnelle

[Biologie Moléculaire] Détecter une mutation insertionnelle.  [...] Voilà J'ai fait une mutation insertionnelle sur Arabidopsis Thaliana, maintenant je veux savoir où est mon T-DNA dans le génome d'Arabidopsis Thaliana.  [...]

[Biologie Moléculaire] mutation de l'adn question curieuse !

Bonsoir, j ai une question un peu bizarre. Supposons qu'on a une molécule d'adn dont le brin 3'-5' est ainsi. 3'...T...5'. Durant la réplication Adn polymerase commet une erreur en posant un G au lieu de A devant le T. On aura donc.  [...] Si la mutation affecte un nucleotide et que l'acide aminé est inchangé, la mutation s'appelle silencieuse, autrement dit seul un nucleotide change et cela n'a aucune conséquence sur la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] comment faire une mutation par PCR?

Je dois introduire une mutation dans un gene (remplacer le TCC par un AGC) par PCR, je n'ai jamais fait une telle chose. L'un d'entre vous pourrait-il m'aider et me guider sur la procedure/le protocole a suivre.  [...] Ben en fait je ne veux pas introduire une nouvelle sequence je voudrais remplacer un codon par un autre pour empecher une structure de se former. Il me semble que j'ai deja entendu parler de mutations par PCR, de toute facon mes boss me demandent d'utiliser cette methode. Mais bie sur ils n'ont pas de protocole.  [...]