• Santé - Banque, Données, ADN

[Divers] Bioinformatique: Banques/Bases/Centre de resssource

Une banque de données peut être séquences protéiques, peut être séquences nucléotidiques, peut être Eucaryotes, peut être uniquement Drosphile,... autant de banques de données que de données.  [...] Donc, je peux avoir plusieurs bases de données, en fait ce sont des ensembles de données tout court. alors que dans une banque j'aurai des thèmes. Donc, si j'ai plusieurs banques, je peux créer une base. C'est en tout cas que cela m'a été présenté, si je me trompe qu'on me corrige.  [...]

21 037 gènes humains en accès libre sur le web

La base de données contient des informations précises sur la structure des gènes et leur fonction. Ces données sont complétées par des liens vers d'autres bases de données publiques.  [...] Ce résultat est le fruit de la collaboration de plus de 150 chercheurs, sous la direction du Dr. Takashi Gojobori. Il s'agit d'une initiative du centre japonais de recherche d'information biologique (JBIRC), de la banque japonaise de données ADN (DDBJ) et de l'institut national de génétique (NIG).  [...]

Darwinisme et développement ?

je ne suis pas biologiste, mais j'avais deja lu que le terme programme génétique etait tres contesté depuis longtemps. L'ADN est une banque de données, pas un programme d'éxécution. Son expression peut dépendre de tout l'environnement, enfin je crois...(cf par exemple le nanisme affectif des enfants orphelins du tiers monde).  [...] Bref, ce livre ( Ni Dieu ni gène )m'a laissé une impression de grande confusion tant sur la forme que sur le fond - avec quelques remarques pertinentes qui parviennent à remettre efficacement en cause quelques idées reçues de-ci et de-là, mais une thèse d'ensemble passablement nébuleuse et si superficielle qu'ils en viennent à négliger la totalité des résultats qui ne vont pas dans leur sens (alors que la confrontation avec les données devrait être le premier souci d'auteurs qui se proposent de remplacer pas mal de conceptions en cours). Bilan mitigé, donc.  [...]

[Biotechnologie] Problèmes sur les notions/calculs de plasmide

De même pour la banque d'ADN génomique, je m'étais trompée dans mon calcul et j'ai donc les mêmes valeurs que vous pour plasmide + insert pour les 2 banques et j'obtiens donc 2505 paires de bases pour la banque d4ADN génomique et 1024 paires de bases pour la banque d'ADN complémentaire.  [...] Donc en disant que l'ADN génomique étant l'ADN à proprement parler, il s'agit des exons + introns tandis que L'ADN complémentaire étant un simple brin synthétisé à partir d'un ARNm, c'est normal que la banque d'ADN génomique soit plus grande que celle d'ADN complémentaire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéines se liant à l'ADN???

je recherche un site qui offre une banque de données qui permet de rechercher les proteines qui se lient à l'ADN, que ça soient des facteurs de transcription (FT) ou autres... Il y a Consite mais il offre que des FT, je recherche autre chose du meme style.  [...] cette base de données a l'air intéressante mais j'ai du mal à trouver ce que je recherche.. pt etre aussi parce que je suis pas super douée en informatique.  [...]

[Biologie Moléculaire] ARN antisens à partir d'un fragment de gène

Par recherche dans les banques de données sur internet vous avez trouvé la séquence du gène de l'hormone de croissance humaine. A quel endroit du gène choisiriez-vous la séquence de votre sonde d'ADN pour cribler la banque que vous venez de construire et trouver l'ADN complémentaire codant pour l'hormone de croissance.  [...] Dans un exon du gène. l'ADN complémentaire provient d'une rétrotranscription d'un ARNm, donc épissé, donc si on veut faire une sonde dans le gène, il faut que celle-ci soit au niveau d'un exon, si elle tombe dans un intron elle pourrait ne pas se retrouver dans l'ARNm et donc dans l'ADNc.  [...]

[Génétique] puces à ADN

En gros on synthétise directement sur la lame une sonde simple brin correspondant à un gène spécifiques, sachant qu'il y'a environs 20 000 gènes chez l'homme tu auras au minimum (en schématisant) 20 000 petits carrés sur la lame avec chacun une sonde spécifique du gène donné.  [...] Mais dans le cas d'une espèce bizarre non séquencée... Y'a pas trop le choix, il faut bien fabriquer une puce à partir de ce que l'on a (banque d'ADNc, ou d'ADN génomique,...).  [...]

[Biotechnologie] Concrètement c'est quoi une banque d'ADN

banque d'ADN, quand je vois ça j'imagine un grand institut avec des jolies baies vitrées et plein des scientifiques en blouses blanches qui viennent retirer des séquences d'ADN de leurs banque.  [...] Par exemple, une boite de pétrie, dans laquelle il y a des souches bactériennes ayant incorporées des séquences d'intérêts, peut elle être qualifié de banque d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Protein Data Bank (banque de données sur les protéines) qui recense les structures secondaires des protéines et des acides nucléiques avec une résolution inférieure ou égale à 4 angströms.  [...] Pour qu'une enzyme entre dans la banque de données du MACiE, il faut au moins que son activité catalytique soit pleinement connue, avec les quatre niveaux du nombre EC assignés, tels que définis en 1964 par la commission sur les enzymes. Mais ce que je n'ai pas encore compris, c'est la raison pour laquelle on trouve deux nombres EC dans les statistiques à propos de MACiE.  [...]

Vers un observatoire des changements écologiques ?

La principale explication donnée à cette lacune réside essentiellement dans le manque de données disponibles sur les espèces animales et végétales. Ne pas connaître les capacités d'acclimatations d'une espèce donnée limite grandement la possibilité pour les biologistes de prévoir les conséquences du réchauffement climatique global.  [...] L'idée sous-jacente est de créer une banque de données biologiques -comme l'abondance d'une espèce par exemple- et climatique -températures, épaisseur des calottes glaciaires-, récoltées sur le long terme (plus d'une vingtaine d'années).  [...]