• Santé - Amplification, Séquences, ADN

Vers un diagnostic prénatal fiable et sans risques des trisomies ?

Il ne reste plus qu'à estimer la quantité de chromosomes 21 grâce à une seconde méthode couramment utilisée par les biologistes. la PCR quantitative en temps réel. Elle consiste en une multiplication exponentielle de séquences connues d'ADN, comme celles portées par le chromosome 21.  [...] Plus il y a d'ADN au départ de la réaction, plus l'amplification sera rapide et atteindra un seuil rapidement. C'est en comparant la rapidité d'amplification des séquences du chromosome 21 (huit séquences différentes) par rapport aux autres chromosomes, et grâce à des analyses statistiques, que l'on peut déduire la présence d'un éventuel chromosome surnuméraire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les applications cliniques de la PCR

l'étude de expressions des gènes (RT-PCR), la médecine légale, agroalimentaire (OGM), diagnostics, évolutions, sonde, clonage, criblage, séquençage...etc.  [...] La PCR est utilisée pour identifier une cellule ou un virus grâce à son ADN, ou toute maladie génétique par amplification de séquences spécifiques.  [...]

Un seul gène fait défaut et c'est l'asphyxie

Dans l'uretère, il est nécessaire à la différenciation des cellules qui formeront les muscles lisses. Ainsi, en l'absence de Tshz3, ces cellules, appelées progéniteurs musculaires lisses ne se différencient pas en muscle lisse. Chez les embryons, l'absence du gène a pour conséquence une altération du fonctionnement de l'uretère et des reins.  [...] Laurent Fasano. Nous avons utilisé les caractéristiques du gène de drosophile pour identifier les gènes Teashirt chez les vertébrés. Techniquement, nous avons utilisé la technique de PCR à l'aide d'amorces dégénérées (amplification de séquences d' ADN plus ou moins spécifiques) pour isoler des séquences proches chez les vertébrés (souris, poulet, homme).  [...]

[Biologie Moléculaire] ADNc simple, double brins et PCR

Je ne comprends pas bien ton blocage étant donné que tu sembles avoir compris le principe de la PCR. ADN simple brin ou double brin, cela ne change presque rien pour la PCR, hormis le fait que la première amplification aura lieu sur une seule séquence d'ADN, alors qu'avec de l'ADN double brin on en a deux.  [...] une séquence d'ADN et sa séquence complémentaire. A partir de la deuxième amplification, on a deux séquences d'ADN qui sont amplifiées, on est alors dans le schéma classique de la PCR.  [...]

[Génétique] Sequençage d'ADN

Sur l'image g, tu ne vois que la moitié des fragments (ceux qui ont leur 3' en vert), les primers ajoutés ne s'hybrident qu'à ces fragments de ssDNA. Chaque paquet possède des fragments qui sont complémentaires, puisqu'ils sont le résultat d'une amplification à partir d'un fragment d'ADN seulement.  [...] Alors, il faut bien distinguer deux phases. La première phase est l'amplification des fragments, c'est le même principe qu'une PCR (les primers sont spécifiques à des adapters, séquences qui ont été ajoutées à chaque bout des fragments d'ADN). L'amplification des fragments est nécessaire pour obtenir un signal analysable (bon signal / noise ratio).  [...]

soutern, PCR, banque genomique

UNe banque génomique, c'est une collection de vecteur ayant chacun intégré un morceau d'ADN génomique, par exemple après digestion à completion de ce dernier. Le passage en vecteur permet d'amplifier ce morceau (notamment quand ne connait pas la séquence, alors qu'on amplifie en PCR quand on la connait en général) et donc de le stocker (conservation), et de l'analyser (restriction, séquencage depuis une amorce située sur le vecteur).  [...] Si tu parles d'amorces dégénérées (le tube contient plusieurs amorces, qui varie en une ou plusieurs positions), tu risques d'amplifier des séquences non spécifiquement. Je ne connais pas d'amorces absolument universelles (amplification de toutes les séquences d'ADN).  [...]

[Biochimie] Sequençage de l'ADN

Brièvement le pyroséquençage 454 consiste à séquencer des fragments de qqs 100aine de paire de bases... tu branches des adaptateurs et lies un unique fragment sur une micro bille. Tu amplifies le fragment et tu te retrouves avec une bille qui contient plusieurs millions de clones de ton fragment.  [...] Une autre astuce de la technique est que l'ADN à séquencé est clivé en petits fragments (une vingtaine de pb) qui vont être chacun fixés sur une plaque couverte de séquences fixant les séquences adaptatrices. Arpès amplification on a donc des spots sur la plaque formés par les amplicons issu d'un brin initial.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène GH-25

- Dans ton article, ils ont commencé par une analyse bioinformatique de séquence d'ADN de différentes espèces de l'arbre de la vie, puis ils ont séquencé en particulier, après amplification par PCR, le gène GH25 présent dans ces espèces. Comme il s'agit d'abord d'une analyse informatique, ils ont du dans un premier temps identifier si les séquences autour de leur gène fétiche étaient déjà connues pour être la/les séquence(s) codante(s) de gène(s) connu(s).  [...] ..), pour lequel on trouvera beaucoup plus d'annotation de génome (puis qu'il y aura plus d'espèces incluses, dont certaines sont des modèles d'études des scientifiques, donc bien mieux annotées). Et c'est comme ça qu'à partir d'un séquence d'ADN dont on ne sait rien, on peut prédire si cela correspond à un gène connu (étudié et séquencé dans une autre espèce du même règne) ou pas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP)

Prochainement en stage dans un laboratoire de recherche, j'aimerais avoir quelques informations concernant la méthode LAMP Loop Mediated Isothermal Amplification, afin de ne pas arriver trop largué.  [...] - 4 à 6 amorces pour amplifier plusieurs (6 à 8) séquences spécifiques de l'ADN cible, dont 2 forment une boucle pour améliorer l'amplification.  [...]

[Biologie Moléculaire] Explications rapides sur la PCR

C'est LA base de la PCR, l'ADN polymerase a besoin d'une amorce pour commencer la réplication de l'ADN. L'idée de génie est de créer cette amorce pour amplifier un morceau d'ADN souhaitée. Comme il y a deux brins sur une molécule d'ADN, il en faut deux.  [...] Enfin, quelqu'un peut-il me faire un petit résumé rapide des avantages / inconvénients / spécificité de ces deux méthodes ( amplification par plasmide, et amplification par PCR ).  [...]