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définition d'une séquence en biologie

Le mot séquence peut faire référence à séquence protéique, séquence d'ADN (entendez séquence des bases d'ADN puriques ou pyrimidines), séquence d'ARN (l'uracile remplace la thymine dans le séquençage), ou alors séquence au niveau d'un fichier texte contenant la séquence d'une molécule biologique (branche de la bio-informatique).  [...] Il s'agit d'une succession ordonnée d'éléments unitaires (bases azotées pour l'ADN et l'ARN, acides aminés pour les protéines).  [...]

[Biologie Moléculaire] Adn...

Apres dans ton texte on parle d'un appariment ADN-ARN, ca ne pose pas de soucis, parce que c'est un ARN complémentaire de l'ADN. Il y a juste une base qui change (se qui est assez faible par rapport à toutes les bases identique). Et les morceau d'introns non présents dans l'ARN, ne sont pas génant, car l'ADN restera simple brin à cet endroit et formera des boucles.  [...] Les hybridations ADN-ADN étaient une technique qui faisaient fureur dans les années 70-80 pour distinguer les espèces bactériennes. On prenait l'ADN de 2 bactéries et on essayait d'apparier les brins ensemble pour voir si elles étaient de la même espèce ou non, et si l'hybridation était imparfaite on étudiat les différences selon leur % d'hybridation.  [...]

[Biotechnologie] emboss et alamut

J'ai utilisé quelques soft du package Emboss. On peut y accéder en ligne par exemple sur le site de pasteur, ce qui évite de les installer localement. Les options sont détaillées. Globalement, ces programmes font de l'analyse de séquence. dans 90 % des cas, on copie-colle une sequence ADN/ARN/proteine en fasta et en retour on obtient un fichier texte/html qui contient des infos sur cette séquence (%GC, usage des codons, motifs protéique, bref je vais pas faire la liste.  [...] Cela ne veut pas dire que sa prise en main soit quantité négligeable dans votre temps de travail. D'autres part, ce genre d'outil clef en main a tendance a fidéliser le client grâce a des format propriétaire. Ce sont des commerçant avant tout.   [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ?

Ce ne sont évidemment pas les termes qu'ils emploient, et comme souvent quand je m'exprime sur la biologie, j'ai peut-être reformulé avec un peu trop d'emphase. Ce serait plutôt dans le texte (à propos des acétogènes et des méthanogène utilisant la voie de l'acétyl-CoA).  [...] D'une manière générale, la méthode proposée par Martin & Russell pour distinguer l'ordre chronologique de l'évolution biochimique de l'inerte au vivant, est en tout point similaire à l'idée que l'ARN est plus ancienne que l'ADN parce que la synthèse de cette dernière nécessite la première. Dans le texte.  [...]

Différences d'ADN entre les ètres vivant ?

En prenant une comparaison, c'est comme si tu cherchais a différencier une page avec un texte en français et une page avec un texte en anglais a 20 mètres de distance (sans jumelles,...). Tu vois que c'est du texte, mais tu ne peut pas dire la langue, pour cela, il faut aller voir de plus près. C'est exactement pareil pour l'ADN.  [...] Par ta faute mon expérience à foiré Tolistento. Au vu du résultat de la 1ère électrophorèse, on peut déduire que l'échantillon que tu m'as donné ne contenait pas ton ADN, puisqu'à vrai dire ce n'était pas l'ADN d'un Homme. Et c'est pareil pour la 2csd électrophorèse.  [...]

[Biologie Moléculaire] besoin de précisions sur l'ADN

pourquoi l'ARN ribosomial était-il une matrice envisageablr pour la synthése des protéinescar ma question est relative à un texte que j'ai lu qui souléve cette question.  [...] A l'époque on a montré que l'ARN est un constituant des ribosomes et sa compo chimique est connu. c'est pourquoi les ARN ribosomiaux semblent être les intermédiaires logiques entre ADN et protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] emplacement de l'ADN polymérase

le ruban bleu correspond à l'ADN polymérase...on demande de repérer l'emplacement de l'ADN polymérase sachant qu'il s'agit d'une protéine et que les protéines sont des chaines d'acides aminés. il faut rédiger un texte argumenté...je ne sais que rédiger.  [...] peut être faut il dire qu'une ADN polymérase est une protéine. elle n'a pas une forme linéaire car les acides aminés réagissent avec leurs voisins selon leurs affinités chimiques. la protéine prend donc une forme spécifique.  [...]

[Génétique] Impotant : base de données de microarray ( C . elegans )

J'ai lancé récemment des recherches dans le domaine de bio-informatique, j'ai besoin de télécharger une base de données de puce à ADN qui contient les gènes de C.Elegans et je voulais savoir comment visualiser une image microarray à partir d'un fichier texte.  [...] j'ai commencé à travailler avec Matlab.Je suis débutante, je sollicite votre aide.   [...]

[Biologie Moléculaire] La postion des éléments de réponse aux hormones

Le HRE est une séquence d'ADN qui n'est pas nécessairement toujours absolument identique dans tous les gènes cibles. Il peut y avoir de petites variation. En général on connait la séquence la plus efficace pour la fixation du récepteur de l'hormone. Donc on peut éventuellement la chercher directement sur la séquence éditée en fichier texte.  [...] Du coup, il existe des programmes qui permettent de trouver ces éléments de réponses dégénérés sur une séquence d'ADN. Ce ne sont pas des bases de données. En revanche il vont tout vous sortir sans chercher à comprendre la relevance biologique de la chose.  [...]

chromosomes et ADN:

On a le même ADN dans nos toutes cellules somatiques, normales, mais le fonctionnement de chaque type de cellule est différent, les synthèses protéiques sont contrôlées par la finalité de chaque cellule, selon les informations externes, les conditions épigénétiques.  [...] je t expliqque comment ça. c parceque dans cet ensemble ( 46 chromosomes ) y en a qu'un gène en fonction localisé sur le chrmosome N=° 6 et non 7 ou 10... etc et les autres (gènes) on peut dire qu'ils sont desactivés mais que dans cette cellule. c pour ça on dit qu'on a 24 molécule d'ADN differentes, ça par rapport à la premième phrase dans ce texte.  [...]