• Forum - Témoin, Réaction, échantillon, Contamination

[Identification] Témoins positifs-négatifs

Un témoin négatif te permet de prouver qu'une réaction positive est due à ton échantillon et pas à une contamination de tes réactifs. Pour cela tu ne mets pas d'échantillon, et tu fais la réaction normalement.  [...] Un témoin positif te permet de prouver qu'une réaction négative est due à ton échantillon et pas à un problème de ton mix. Pour cela on met un échantillon dont on est sur qu'il doit entrainer la réaction attendue.  [...]

[Biotechnologie] L'ADN mystère !!!

s'il s'agissait d'une contamination de l'un des réactifs, on aurait cette même bande pr ts les autres puits, ce ki n'est pas le cas, celles des échantillons étant largemt + faibles. Et s'il sagissait d'une contamination entre tubes test et tube témoin, l'intensité aurait été plus faible ou au pire identik à celles des tubes test.  [...] Je suppose que les amorces font 20-30 bases chacunes, ce qui exclue la possibilité de dimères de primers. Peut-être l'un des réactif est contaminé et une fois que tu met ta matrice, alors il y a compétition entre la matrice d'intérêt et la matrice contaminante, ça explique peut-être la perte d'efficacité de la PCR dans les pistes d'intérêt par rapport au témoin.  [...]

AMPLICON negatif --> devient positif

Une fois cette 1ère PCR terminée, je prend 5 µl de chacun des amplicons et je les introduis dans chacun des mix (même pool) en commencant par le témoin nég.. Donc aucun contact avec un echantillon positif pour le temoi negatif.  [...] Non il n'y a pas de contamination de tes echantillons ou de ton mix, c'est simplement que tes oligos s'hybrident de maniere non specifique (et ils amplifient donc une region qui n'est pas la bonne).  [...]

[Biologie Moléculaire] probléme de migration d'ADN sur gel d'agarose

A son issue, on regarde les résultats sur gel d'agarose(+Bromure d'éthidium).Le témoin négatif(2microlitres d'eau à la place de l'ADN) est bien négatif, le témoin positif(ADN de feuille de tomate dont on est sur qu'il s'hybride) est bien positif.Le problème survient sur notre échantillon.  [...] Essaie aussi de diminuer la quantité d'ADN de ton échantillon Vous l'avez dosé pour vérifier que vous être dans le même ordre de grandeur que le témoin positif.  [...]

[Biologie Moléculaire] contrôle interne en RTqPCR

Pour ces raisons (et quelques autres), on utilise un témoin interne, c'est à dire on amplifie un ARN qui se trouve normalement à concentration constante dans notre échantillon (du moins tout le temps exprimé à un niveau détectable). Ca en fait ainsi un témoin positif à l'intérieur même du puits.  [...] Si il y a amplification du témoin interne, on a bien extrait de l'ARN non lysée de notre échantilon et la PCR n'est pas inhibée, donc un résultat négatif indique bien que l'échantillon ne contient pas ton ARN cible (donc qu'il est bien négatif).  [...]

[Biologie Moléculaire] contamination PCR

Pour la 18s, j'avais des consommables et les primers, mais le temoins avec tous produits neuf a eu un temoin negatif nikel. J'ai donc lancé tout de suite derrière une PCR sur mes échantillons avec ses bons produits, et je me retrouve de nouveau avec une contamination.  [...] Nous avons passé donc lavé toutes nos paillasses à l'HCl, au DNAoff, et passé une machine pulverisants un produits détruisant bactérie et champignons. Hélas les contaminations étaient toujours là. Pour confirmer notre thèse, nous avons été travaillé dans un autre batiment, pour preparer le mix, une série d'échantillon chez nos collègues et une série d'échantillon sur le même mix mais dans notre laboratoire et oui la contamination n'est présente que chez nous.  [...]

[Immunologie] TP BH : Diagnostic de la leucose bovine enzootique (LBE) - Méthode d'ouchterlony

-La leucose bovine enzootique (LBE) est une maladie des bovins adultes due à un rétrovirus, le virus de la leucose bovine (Bovine Leukaemia Virus - BLV). L'infection par le BLV chez les bovins aboutit à la production d'anticorps dirigés contre la glycoprotéines gp 51 du BLV.   [...] Ton sérum positif te permet à la fois de voir quelle est la nature de l'agglutination, et également de t'assurer que ton extrait d'anticorps fonctionne (par exemple, éviter de passer à côté d'une dénaturation de l'anticorps qui donnerait un risque de faux négatif).   [...]

[Biologie Moléculaire] Interprétation courbe qPCR

J'ai effectué la manip' 3 fois en tout (pour ces données là, sinon en tout et pour tout j'ai effectué 7 plaques avec des résultats propres et significatifs sur ces échantillons), dont une fois avec des échantillons anormaux et normaux, tous séparé par une colonne vide (pour éviter les contaminations) [c'était un test], j'obtiens toujours les mêmes profils.  [...] Avec les anciens produits de PCR, j'obtiens 2 pics, avec de nouveaux produits je n'en ai plus qu'un (un peu moche certes, mais un seul). Nous en concluons que la contamination devait provenir de l'eau miliQ, la piste des dimères est définitivement écartée, et je repasse tous mes échantillons avec de l'eau propre, aliquotée et congelée. Enjoy.  [...]

Ecrans, lumière bleue et sommeil

La presse généraliste a fait récemment ses gorges chaudes d'une étude qui montrerait de sérieuses restrictions du sommeil chez des sujets ayant lu sur tablette avant de se coucher, par rapport à un échantillon témoin de lecteurs papiers. Cette étude ne m'a guère convaincu en elle-même (échantillon de.  [...] Qu'on songe par exemple aux retournements à 180° (c'est le cas de le dire) dans les recommandations des spécialistes quant à la position dans laquelle on devait coucher les bébés pour éviter la mort subite. Ces spécialistes là n'échangeaient pas moins entre eux j'imagine que les neurophysiologues.   [...]

[Biochimie] dénaturation de l'albumine par la chaleur

avec un premier échantillon sous cette chaleur pendant 1 minute, il y avait clairement dénaturation de la solution d'albumine 0,5% avec la formation de sédiments.  [...] En fait, pour les temps de 1 minute et de 10 minutes, ce sont deux échantillons différents de solution d'albumine 0,5%. Celle qui a été chauffée pendant 10 minutes n'a pas été refroidie avant que nous l'observions, nous avons regardé si elle présentait des signes de dénaturation directement en la sortant du bain-marie.  [...]