• Forum - Synthèse, ADN, Réaction

[Biologie Moléculaire] le séquençage??? une petite question

une ADN polymérase synthétise le brin complémentaire de l'ADN à séquencer. Dans le milieu de réaction se trouvent des dNTP en grand nombre, et une faible proportion d'un ddNTP (à Adénine, ou Guanine, ou Thymine, ou Cytosine). A un moment totalement aléatoire, un ddNTP sera ajouté à la chaîne en cours de synthèse par l'ADN polymérase. Cette synthèse s'arrêtera donc à cet endroit.  [...] Par exemple, si le milieu réactionnel contient une faible proportion de didésoxyribonucléotide à Guanine (ddGTP), on obtiendra à la fin des réactions un ensemble de brins d'ADN de tailles variés, selon l'endroit où un ddGTP se sera inséré et que la réaction aura ainsi été stoppée (ce qui correpond, du fait de la complémentarité des bases, à la présence d'une Cytosine dans le brin d'ADN séquencé).  [...]

réplication de l'ADN

Ensuite, l'ADN polymérase III catalyse la réaction de polymérisation de l'ADN. il y a attaque nucléophile des triphosphates (dATP, dGTP, dTTP et dCGP) sur le bout 3'OH du brin en cours de synthèse, ce qui explique le sens de la synthèse 5'-. 3'.  [...] C'est parce que les brins sont anti-parallèles. le brin retardé est celui dont les origines de réplication se découvrent au fur et à mesure que l'hélicase sépare les deux brins d'ADN. Ceci vient du fait que la synthèse a toujours lieu dans le sens 5'-. 3'.  [...]

[Biochimie] Extrémité 5' ARNm

L'hydrolyse du pyrophosphate en orthophosphate est importante pour favoriser les réactions biosynthétiques telles que la synthèse de l'ADN*.Cette réaction hydrolytique est catalysée chez E.coli par une pyrophosphatase qui a une masse de 120 kdal et est constituée de 6 sous unités identiques.  [...] L'enzyme purifiée a une Vm de 2800 unités par milligramme d'enzyme. Pour cette*enzyme, une unité d'activité est définie comme la quantité d'enzyme qui hydrolyse 10 µmol de pyrophosphate en 15 min à 37°C dans les conditions standard de dosage.   [...]

[Biochimie] Acides nucléiques et ADN

c) Quelle est la séquence générée par traduction à partir du brin défini en (b) Type moléculaire Où et quand a lieu la synthèse Par quoi est assurée la réaction.  [...] a) Quelle est la séquence générée par réplication utilisant ce brin comme matrice Type moléculaire ADN Où et quand a lieu la synthèse dans le noyau lors de la division cellulaire Par quoi est assurée la réaction ADN polymérase, hélicase,  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

La PCR en temps réel est une PCR où on suit l'amplification d'ADN en temps réel, point. Le fait de déterminer la quantité intiale n'est qu'un bonus, une possibilité qu'elle offre mais qui n'est pas obligatoire.  [...] On se sert de molécules fluorescentes qui, avec des particularités selon la méthode utilisée, va permettre de suivre la synthèse des amplicons au cours de la réaction, en ne ciblant que les spécifiques ou non. On pourra ainsi obtenir des courbes représentant l'augmentation de la fluorescence (et donc incidemment de l'ADN) en fonction du nombre de cycles effectué.  [...]

Uracile

Dans la chaîne de synthèse c'est l'uracile qui est transformée en thymine. cela peut s'expliquer par une origine évolutive, l'ADN ayant été inventé après l'ARN. Forterre et collègues ont mis en évidence qu'il y a deux familles de protéines réalisant cette réaction. l'ADN a été inventé deux fois.  [...] Jean-Luc, je n'ai pas bien compri quand tu dis. Dans la chaîne de synthèse c'est l'uracile qui est transformée en thymine. Tu entends quoi par là.  [...]

[évolution] Théorie de l'évolution et Régression des organes inutiles - Page 3

En plus de toutes ces improbabilités, l'ADN peut à peine être impliqué dans une réaction en raison de sa forme spirale en double chaîne. Il devient alors impossible de penser que ceci peut être la base de la vie. D'ailleurs, alors que l'ADN ne peut se reproduire qu'avec l'aide de quelques enzymes qui sont en réalité des protéines, la synthèse de ces enzymes peut seulement être réalisée par l'information codée dans l'ADN.  [...] Une fois purifiés, on les mets dans un tube a essai, et on attends pour voir ce qu'il va advenir. D'apres notre hypothese de depart on devrait voir des reactions se produire, puisque l'ADN conscient va tenter d'evoluer pour se sortir de ce mauvais pas... apres plusieurs jours d'attente, une analyse poussée nous indiquera que rien ne s'est absolument passés.  [...]

monde ARN avant ADN

20 °C) based on the estimated GC content of inferred ancestral sequences in maximum-likelihood trees. Is such a low temperature for life at the root realistic Amend and McCollom (2009) recently calculated that in geochemically promising environments for the origin of life, the Gibbs energy of reaction ( Gr) toward the synthesis of total prokaryotic cell mass was unfavorable (+500 Joules per gram of cells) at 25 °C but exergonic at 50, 75, and 100 °C, with values of 1,016, 873, and 628 Joules per gram of cells, respectively, dropping sharply again at 125 °C (Amend and McCollom 2009).  [...] À ce propos, je vous suggère vivement de regarder un cours disponible en ligne, du chimiste de formation Marc Fontecave, actuellement professeur au Collège de France et grand spécialiste des ribonucléotide réductases (une classe d'enzymes qui catalyse la réaction de synthèse d'ADN à partir d'ARN). Voir ici.  [...]

[Biologie Moléculaire] Polymérase Chain Reaction [PCR]

Le principe de base reste le même. Après, la PCR en temps réel permet de visualiser la synthèse d'ADN en direct au cours de la réaction, alors que la PCR classique ne permet que de voir ce qui a été produit au bout d'un certain nombre de cycles. Ce type de PCR est également appelée PCR en point final par opposition à en temps réel.  [...] Mais donc, on a bien dans certains cas PCR en temps réel = PCR quantitative, qui s'oppose à la PCR classique où on regarde le résultat à la fin de la synthèse.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 8

Donc, la production de PEP comme intermédiaire dans la synthèse de glucose est thermodynamiquement favorable avec un apport constant de phosphate d'acétyle. La réaction produit de l'acétate qui, en tant que petite molécule, est un déchet qui peut s'échapper facilement de l'évent avec le fluide hydrothermal sans dommage pour la synthèse abiotique.  [...] Autrement dit, la réaction de conversion du glycérate-2-phosphate en 3-phospho-D-glycérate a beau être légèrement défavorable thermodynamiquement, à haute température, elle fonctionne, avec une fort avantage pour la synthèse de 3-phospho-D-glycérate avec un ratio de 4.1.  [...]