• Forum - Structure, Protéines, Séquences

l'ADN chromosomique sert-il in fine à produire autre chose que des protéines ?

l'ADN n'est pas une protéine, loin de là, une protéine c'est un polymère d'acides aminés, l'ADN est un polymère d'acides nucléiques,, ce sont deux types de molécules fondamentalement différentes,  [...] Dans l'ADN il y a aussi des sequances qui ne donnerons ni protéines ni ARN, mais qui sont indispensables (séquences régulatrices,promotteurs, switchs) des séquences qui favorisent la compaction de l'ADN pour qu'il prenne moins de place car une cellule ne peut pas avoir son ADN en permanence déroulé tellement il est grand, il y a aussi des séquences protectrices (télomères), des zones indispensable à la structure (centromère) et tout ceci ne fabrique aucunes protéines mais est indispensable.  [...]

[Génétique] Myoglobine

..) et/ou des liaisons covalentes de type ponts disulfures (entre deux cystéines). Finalement, c'est bien la séquence en acides aminés qui va conditionner la prise de forme, c'est-à-dire la structure 3D.  [...] Oui. Avec ce que je viens de dire, si on constate que plusieurs séquences se ressemblent, à quoi peut-on s'attendre concernant la structure de chacune des protéines qui découlera de ces séquences quasi-identiques.  [...]

[Evolution] Molécules homologues

Les structures 3D sont beaucoup moins variables que les séquences et je crois que la dernière classification des différents types de structures (hélices, feuillets, tonneaux) et groupes de structures fait état d'une diversité d'environ 600 éléments. Donc en gros beaucoup de protéines vont avoir la même structure sans avoir la même fonction donc dire que deux protéines ayant une homologie de structure sont homologues me choque car pour moi la véritable homologie est avant tout fonctionnelle (et c'est pour cette raison que j'approuve complètement la deuxième partie de ta phrase sur les domaines, car toujours selon moi c'est le domaine qui fait la fonction peut-être avant la structure même si les deux sont importants).  [...] Je suis bien d'accord mais au sein d'une même famille les protéine sont souvent des propriétés proches même si différentes. Pour la structure je pense que c'est beaucoup plus souple c'est à dire qu'il est faisable de trouver deux protéines avec une structure proche mais des propriétés et des activités complètement différentes et donc des séquences très différentes puisque ces paramètres dépendent surtout de la séquence.  [...]

[Biologie Moléculaire] Facteurs cis et trans régulateurs

* Les séquences de nucléotides du promoteur (facteurs cis-régulateurs) sont reconnues par une classe de protéines spécifiques (facteurs trans-régulateurs) dont la structure permet une liaison avec le DNA (DNA binding proteins).  [...] Ce que j'ai compris,c'est qu'il existe au niveau du promoteur,des séquences dites cis régulatrices,où viennent se fixer des protéines transrégulatrices dont l'unique but est de réguler la transcription.  [...]

[Biologie Cellulaire] L'adn

j'aimerai savoir la structure primaire de l'ADN c 'est seulement.l'enchainement des bases et sa structure secondaire c'est seulement les deux chaines désoxyribonucléique.  [...] Les structures secondaires A et B sont observées in vivo. Ce ne sont pas des anomalies. la variation locale de la structure d'ADN permet de modifier l'accessibilité de certaines séquences à des protéines, ce qui permet une régulation génique.  [...]

[Biologie Moléculaire] le mystère des séquences non codantes

J'ai une petite question. L'ADN est une chaine polynucléotidique c'est à dire une succession de nucléotides. Mais comment on peut avoir des séquences codantes et non codante Enfin ma question est un peu confuse mais je comprends pas comment des séquences de l'ADN peuvent être codante et d'autre non alors qu'au final elles sont toutes identiques (identique dans le sens où c'est un enchainement de nucléotide) par exemple pourquoi un promoteur ne code pour aucune protéine Pareil pour les introns ceux sont des séquences non codante qu'on retrouve entre les exons (séquences codantes) mais pourquoi sont elles non codantes alors que les exons code pour une protéine Pourtant ceux sont toutes des enchainements de nucléotide.  [...] Pour revenir à nos moutons, d'un point de vue moléculaire, une séquence est codante car elle est bordée de séquences qui présentent une structure tridimensionnelle particulière, lui permettant d'interagir avec des entités présentes dans ta cellule (ARN, protéines, ADN aussi &).  [...]

[Biologie Cellulaire] les virus par rapport aux cellules

- une partie structurale. possède les séquences nécessaires à la formation de la capside (structure protéique protégeant le génome).  [...] - une partie fonctionnelle. possède les éléments spécifiques aux virus (proétéines d'intégration au génome cellulaire, gène de défense contre la cellule...pas important ici).   [...]

opéron tryptophane

L'opéron est constitué d'un gène régulateur, d'un promoteur, d'un opérateur, d'une séquence leader atténuateur et de gènes de structure. Il y a sythèse des ARNm des gènes de structure puis traduction en protéine quand il n'y a pas ou peu de trytophane dans le mileu car il y a formation d'une boucle (par les séquences palindromiques) qui n'empêche pas la pogression de la polymérase.  [...] Quand il y a du tryptophane, la boucle se forme juste avant une séquence de poly U et empêche la progression de la polymérase, il n'y a pas transcription des gènes de structure.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 9

Il y a un autre exemple, purement illustratif. J'ai déjà lu qu'il serait absolument impossible qu'une séquence protéique (la structure primaire) donnée soit apparue par hasard (je pense notamment aux publications de Hubert Yockey). Or, si on s'intéresse, non pas à la structure primaire, mais à la structure secondaire (surtout les différents repliements protéiques), on s'aperçoit que là où on s'attendait à voir 10 68 repliements possibles (pour une séquence protéique de 150 résidus), on se rend compte qu'il y a d'autres contraintes, très loin d'être dû au hasard, qui font en sorte que le nombre de repliements théoriquement possibles sont au nombre de 4000.  [...] D'ailleurs, dans les protéines actuels, il y a de nombreuses protéines qui montrent les mêmes structures tridimensionnelles, avec des séquences d'acides aminés pourtant extrêmement différentes. En outre, certains de ces 4000 repliements théoriques (3756 pour être précis) sont tellement improbables, qu'on estime que seulement ~2000 pourraient être exprimés dans le vivant.  [...]

Promoteur

Bof bof, c'est sur les deux brins. Un facteur de transcription reconnait une conformation de séquence d'ADN double brin, qu'on la mette dans un sens ou dans l'autre, la conformation reste la même... (voir les enhancers par exemple).  [...] Pareil que LXR, quand on parle de séquences régulatrices, c'est-à-dire que leur fonction implique des intéractions protéine-ADN, il faut considérer que la structure importante est l'ADN double-brin.  [...]