• Forum - Structure, Protéine, Séquence

[Biochimie] Format pdb

il va d'abord falloir résoudre un problème trivial. Trouvez la structure de cette protéine a partir de sa séquence primaire. je vous suggère deux pistes. les methodes ab initio ou par les méthode par homologie.  [...] Les méthodes de prédiction de structure portent bien leur nom. Ce sont des prédictions, généralement aussi fiables que l'oracle de delphes en plein délire hallucinatoire (j'exagère volontairement). Si une protéine dont la structure a été résolue expérimentalement se trouve aussi avoir une forte identité de séquence (.  [...]

Ordre des acides aminés dans une chaine polypeptidique

Je pense qu'il y a une confusion entre la séquence en acides aminés d'une protéine, et la structure des molécules d'ADN dans un chromosome.  [...] Ensuite on obtient une séquence de nucléotide, qui forme des codons, donc des acides aminés qui correspondent à la structure primaire de la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] Domaine / module des protéines

J'aimerais savoir si il y a une définition officielle de ce que doit être nommer domaine protéique, ou de ce qui doit être dénomer module protéique.  [...] Initialement je pensais qu'un domaine était une séquence d'acides aminés apportant une fonction à la protéine, et que le module était plutôt une structure qui pouvait être constitué d'acides aminé éloignée lorsque l'on regarde la seule séquence primaire de la protéine.  [...]

[Biochimie] structure secondaire des proteines

je sais que la structure primaire détermine la structure tertiaire(tridimensionnelle) d'une proteine, mais est-ce qu'elle determine aussi sa structure secondaire la phrase suivante tirée de mon cours me met le doute un polypeptide peut presenter de nombreuses structures secondaire en fonction de sa séquence.  [...] Les protéines sont constituées d'un enchainement d'acides aminés qui présentent des propriétés physico-chimiques spécifiques (hydrophobes, polaires, chargés, acides, basiques...). La structure primaire est effectivement la séquence d'acides aminés constituant la protéine.  [...]

[Biochimie] structure primaire

Donc si on connait la structure Iaire, séquence des aa, on devrait pouvoir prédire la structure 3D que la protéine aura après repliement.  [...] La phrase que tu cites ne signifie pas que l'on peut deviner de façon certaine la structure 3D d'une protéine à partir de sa séquence en acide aminée.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène Rapporteur

Mais c'est assez difficile, la séquence peut inhiber la structure tertiaire de la protéine rapporteuse et donc on ne verra rien.  [...] si je comprends bien, si l'on veut connaitre la localisation de la protéine d'intérêt avec une séquence régulatrice(recombinaison homologue), il faut forcément que le transgène possède une séquence d 'ADN de localisation (ex.NLS qui soit identique à la séquence d'ADN de localisation de la protéine d'intérêt) et le gène rapporteur.  [...]

[Biologie Cellulaire] Comparons la cellule à une usine !

C'est la où l'image de l'usine marche pas Protéines de maintenance, réparation, construction ect. L'image de l'usine cloche un peu ici Sinon je vois pas ce que t'appelles sorteur Car le sorteur ça serait plutôt le Golgi qui emballe le produit et l'expédie en dehors de la cellule.  [...] Bah, les ribosomes ils assemblent les acides aminés pour la bonne séquence d'une protéine. Mais une protéine doit être modifiée pour être fonctionnelle. Sa structure mise en place, ajout de groupements de sucre ect.. Tout ceci c'est fait par.. des protéines déjà fonctionnelles.  [...]

[Biologie Moléculaire] Western et révélation bandes

Plus le gel est lâche plus tu peux résoudre des protéines de grosses tailles. 10-12% ça te permet de séparer des protéines de toutes tailles. Les protéines trop petites passent toutes ensemble en revanche. C'est un peu le gel à tout faire, le gel de première intention, le gel de base quoi.  [...] la structure et la séquence de la protéine est détaillée, tout en bas vous avez des infos physico-chimiques dans la case peptide stats.  [...]

Mutations silencieuses

Moi je dirais plutôt le contraire. une mutation silencieuse est une mutation (dans ce cas) dans une séquence intronique qui n'est pas traduite car ayant été épissé pendant la maturation de l'ARNm.. Du coup, la protéine ne comporte pas de modif dans sa séquence ni dans sa structure.  [...] Pommier. notre prof a bien spécifié que la constitution de la protéine finale était altérée, avec par exemple comme conséquence un défaut de sécrétion, d'activité, d'aptitude de dégradation, etc... ces conséquences ne concerneraient pas un défaut des sites actifs de la protéine.  [...]

[Biochimie] protéine

la semaine prochaine j'ai un examen d'un module de protéine et j'ai peur que l'ont me pose la question. quelle est la différence entre les structures de la protéine.  [...] c'est que en cours on nous a parlés des quatre structures mais j'ai peur de ne pas pouvoir donner une réponse assez satisfaisante.  [...]