• Forum - Structure, ARN, Interactions

[Biologie Moléculaire] Formation de la structure 3D de l'ARN

Lors de ce repliement sur eux-mêmes, il y a des interactions Watson-Crick (structure secondaire de l'ARN), et d'autres interactions plus faibles (structure tertiaire). Ces structure tertiaires sont visibles dans des ARNt par exemple, mais pas chez des ARNm.  [...] Je reviens à mon problème de départ. lors de ce repliement, est-ce que les interactions fortes (structure secondaire) se forment avant les interactions plus faibles (structure tertiaire).  [...]

Structure canonique des ARNt

Structure canonique de l'ARN signifie qu'il est replié et des interactions le maintiennent dans cette structure secondaire particulière (repliement particulier des ARNt).  [...] Je resterai sur la structure secondaire pour être sûr. (Car pour la structure tertiaire, les interactions canoniques ne sont pas les principales acteurs, il y a la polarité des acides aminés etc..).  [...]

Expression de gènes

Je suis à la recherche de documentation concernant la post-génomique et plus particulièrement le lien entre le séquençage et la recherche de la fonction des gènes et des séquences régulatrices. J'ai cherché un peu sur internet et vu que je suis pas une pointure dans le domaine j'avoue être complètement largué (c'est difficile de trouver des rapports de recherches et une fois que c'est fait d'en appréhender le contenu extrait de son contexte).   [...] Plus sérieusement, il m'arrive de devoir identifier des protéines suite à des analyses. Si je me contrefiche du niveau ADN et ARN, la structure de la protéine, ses interactions probables et sa fonction m'intéressent beaucoup plus. Je n'utilise donc pas tout les jours cette database. Mais vu qu'elle est toujours utile.  [...]

Edition de l'ARN - Mécanismes?

Une endonucléase clive l'ARNm au niveau de la première base mal appariée, la queue de l'ARNg permet le maintien via des interactions ARN-ARN du fragment 5' à proximité du fragment 3' et des protéines de l' épitosome (mal identifiées). Le complexe procède alors à l'addition/suppresion d'uridines en 3' du fragment 5', réaction catalysée par la Terminale Uridine Transférase [TUTase] qui agit indépendamment de toute matrice.  [...] Une ARN ligase relie les deux fragments maintenus par les interactions ARNm-ARNg après addition/suppression des uridines.  [...]

[Génétique] Structure chimique de l'ARNm, ARNt et ARNr

Apres quelques heures de recherche sur internet, je n'ai toujours pas trouvé quelle était (ou si il y en a une) la différence au niveau de la structure chimique des ARN messagers, de transfert et ribosomique.  [...] A proprement parler, en gros, Il n'y a pas de différence dans les structures chimiques des trois molécules. La différence est à chercher au niveau de la conformation que prend la chaine, c'est à dire au niveau des différentes interactions entre les bases. Plus dans le détail, les ARNt intègrent des bases que l'on ne trouve pas dans les autres ARN tels que des bases hypoxantines par exemple.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Si le substrat et l'enzyme établissent des interactions suffisament importantes, et si le substrat possède la bonne conformation, alors le site actif, généralement de 2-3 acides aminés, pourra jouer son rôle de catalyseur.  [...] Ainsi, certaines enzymes vont être flexibles, ou alors certains substrats auront une structure tridimensionnelle proche ce qui leur permet d'établir des interactions suffisament importantes avec l'enzyme. Un exemple type. vous avez du voir la traduction, qui met en jeu les ARNt.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

Conformation est utilisee pour signifier la structure 3D grossierement, cad tout ce qui est repliement dans l'espace, interactions resultantes (l'acide amine 335 peut etablir des interactions dues a ses proprietes biochimiques avec l'acide amine 22, par exemple), la presence ou non de plusieurs sous-unites formant la proteine fonctionnelle, bref.  [...] Cela dépend si sa structuration est dépendante de l'intervention de protéines chaperones. Si c'est le cas, elle ne se restructurera pas spontanément. Et pour une protéine ne nécessitant pas l'intervention de chaperones, pour que sa renaturation puisse se faire spontanément, les conditions physico-chimiques doivent être adéquates. Même avec cela, c'est pas gagné.  [...]

[Divers] Confusion sur les notions "basiques"

La structure primaire c'est l'enchainement des acides aminés ou des acides nucléiques. La structure secondaire se sont les interactions entre les acides aminés (nucléiques) de la chaine qui entraine un repliement de cette dernière.  [...] Il existe aussi une structure tertiaire qui consiste en une interaction entre les différentes structures secondaires.  [...]

[Biochimie] Enzymologie hétérogène

C'est normal une enzyme immobilisée est moins efficace car sa structure est contrainte par les interactions avec le support.  [...] Il serait aussi intéressant de savoir si l'enzyme immobilisée s'avère plus stable, car il y a souvent un compromis entre activité et stabilité.   [...]

Structures d'une proteine

J'ai un peu de mal à faire la différence entre structure secondaire et structure tertiaire d'une protéine (notamment avec les interactions). Est-ce que quelqu'un veut bien m'aider Merci.  [...] Ces deux niveaux d'organisation (secondaire et tertiaire) font appel (en partie) aux mêmes types d'interactions. La différence est une question d'échelle. Les structures secondaires sont une organisation particulière a l'échelle locale, comme par exemple un feuillet beta ou une hélice alpha.  [...]