• Forum - Site, Distribution, Loi

[Génétique] Phylogénie et loi de distribution gamma

Si ton paramètre alpha est plus grand que 1, ta distribution des taux entre site tend vers une répartition de type loi normale cad une faible hétérogénéïté. Et inversément pour un paramètre inférieur a 1 où ta distribution a une forme de L (je sais pas si c'est clair ) donc une forte hétérogénéïté.  [...] Les modèles de phylogénie en loi gamma peuvent etre améliorer dans ce cas de figure en autorisant une partie des sites (fraction I ) a être invariant et tout en gardant l'autre fraction de site variant a suivre une distribution loi gamma (modèle gamma+I).  [...]

Statistiques en biologie

Test Shapiro-Wilk de conformité d'une distribution à la loi normale.  [...] Donc soit tu les traites statistiquement avec des tests qui ne supposent pas une distribution normale (typiquement les tests non paramétriques), soit tu transforme tes données pour qu'elles soient conforment à la sacro-sainte loi normale.  [...]

[Biologie Moléculaire] [M2]Marqueurs moléculaires de l'évolution

2) Le paramètre alpha renseigne sur le niveau d'hétérogénéité. si le paramètre alpha est plus grand que 1, la distribution des taux tend vers une répartition de type loi normale c'est-à-dire une faible hétérogénéité, et inversement pour un paramètre inférieur à 1 qui représente une forte hétérogénéité.  [...] On peut modéliser le même phénomène avec la méthode du maximum de vraisemblance. c'est le calcul de la vraisemblance d'un arbre pour un site donné et sous le modèle d'évolution choisi ainsi que le calcul de la vraisemblance pour le jeu de données (produit des probabilités des différents sites).  [...]

[Génétique] la loi de Hardy Weinberg

La loi de Hardy-Weinberg stipule que les fréquences alléliques et les fréquences génotypiques (c'est à dire la structure génétique de la population) restent stables de génération en génération. On dit alors que la population est à l'équilibre et il existe une relation simple entre les fréquences alléliques et les fréquences génotypiques.  [...] La loi de distribution génotypique est souvent implicitement incluse dans HW.  [...]

Une nouvelle forme de vie sur la Terre?

il est assez amusant d'ailleur de remarquer que le point commun soit la barrière lipidique... on me corrigeras si je ne trompe, mais cela ne rejoint-il pas les recherches sur certainne propriété de bulles qui s'agglomère naturellement et qui donnerais de fait un champs adequat a la protection d'un système vivant.   [...] J'ai adoré le passage sur la distribution des bactéries dans le sol suivant une loi de Poisson.  [...]

calcul de la biomasse pelotes de rejections chouette

Tu peux aussi faire un camembert pour chaque site pour avoir une idée de la distribution des espèces sur chaque site, ce qui pourrait nuancer le premier résultat car il se peut que sur un site les pelotes contiennent en moyenne moins de proies mais qu'il s'agissent de proies plus grosses.  [...] SINON c'est vrai que calculer le nombre moyens de proies dans une pelotte en fonction du site c'est une bonne idée mais on aimerais vraiment comparé avec la bomasse et comme je n'ai aucune formule c'est très galère -'.  [...]

Datation par adn, archéologie

Je suppose que pour distinguer ceci des migrations qui ont eu lieu depuis 1492, ils ont dû mettre en évidence qu'il y avait des mutations qui n'auraient pas eu le temps de s'accumuler en Amérique en si peu de temps. Ceci dit, il faudrait aussi exclure la possibilité de migration d'Européens par l'Est à travers l'Asie et via le détroit de Béring.   [...] .. Bref, tu à une moyenne seulement du taux de mutations par unité de temps, avec une certaine variance. Si tu connais la loi de distribution de cette variable mutations/an, tu peux calculer des intervalles de confiance.  [...]

[statistiques] Tester la normalité d'un échantillon

J'aimerais que quelqu'un puisse me dire comment faire pour tester la normalité de cette distribution dans le cadre d'une étude statistique (en gros suit-elle une distribution normale).  [...] Et pour tester la normalité de cette même distribution, est-il possible d'utiliser un test de khi-deux Si oui, comment procéder.  [...]

Loi de distribution dans R

Pour choisir la la loi de distribution, j'ai testé différents modèles sur R (je voulais ensuite comparer les AIC et choisir le modèle avec l'AIC le plus faible).  [...] Voilà, je suis débutante sur R et ces lois de distribution sont les seules que je connaisse. Avez-vous une solution, un début de solution.  [...]

Biostatistiques

si c'est de simples mesures tu peux tracer un histogramme pour voir si la distribution a l'air symétrique unimodale. Si c'est le cas, tu fais l'hypothèse que la moyenne empirique suit une loi normale (le théorème central limite assure que quand la taille d'échantillon est grande la distribution de la moyenne empirique est gaussienne, mais la vitesse de convergence dépend de la distribution des mesures, si elle est trop mal foutue ça converge lentement et tu ne peux pas supposer qu'avec 40 valeur tu est proche d'une loi normale).  [...] Si la distribution est supposée normale, tu estimes l'écart-type de la mesure, et tu le divises par la racine carrée de 40 pour avoir l'écart-type de la moyenne empirique, disons s. Un intervalle de confiance gaussien est donné par [m-1.96s,m+1.96s].. note.  [...]