• Forum - Séquence, ADN, Signal, Protéine

clonage overlap... problème

Je dois réaliser un clonage overlap et je suis complètement perdu... En gros, je dois insérer le tag mcitrine entre le peptide signal et le reste de la séquence de ma protéine.  [...] Comment est-ce que je peux identifier la séquence d'ADN correspondant au peptide signal de ma protéine (je connais le peptide signal mais je ne sais pas comment identifier quelle partie de la séquence d'ADN correspond à ce peptide signal). Est-ce que je dois faire un blastx.  [...]

L'influence de l'environnement sur le phénotype : besoin de conseils de méthode !

Proposition de la question 2. Lorsque le milieu n'est pas composé de glucose, c'est le lactose qui est consommé par la bactérie. Un signal chimique active ensuite une protéine ( CAP ) du cytoplasme. Elle peut alors se lier à l'ADN au niveau d'une séquence particulière située avant le gène lac nécessaire à l'exploitation du lactose.  [...] La liaison qui lie la protéine CAP avec l'ADN entraîne une déformation de la molécule d'ADN ( on observe une courbure de 80° ). Cette dernière favorise la fixation de l'ADN polymérase et donc la transcription du gène lac. Cette transcription va entrainer cette même action sur les gènes lacY et lacA de la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] riboporine et srp

La communication intercellulaire emploie des protéines sécrétées ou enchâssées dans la membrane cellulaire. Ceci est possible grâce à la SRP (Signal Recognition Particle) qui va reconnaître une séquence signal sur la protéine en cours de synthèse et provoquer sa translocation au réticulum endoplasmique chez les eucaryotes, à la membrane plasmique chez les procaryotes.  [...] La SRP est une ribonucléoprotéine constituée chez les eucaryotes d'un ARN (ARN 7SL) fixant 6 protéines, dont la SRP54 qui lie la séquence signal de la protéine en cours de synthèse.  [...]

Dominant négatif !!

La séquence signal qui permet l'adressage est reconnue, au moment, ou juste après la traduction de la protéine alors que la myristoylation est plutôt post traductionnelle.  [...] Si quand même. Protéine membranaire ne veut pas nécessairement dire transmembranaire (séquence signal). Des protéines myristoylées comme c-src ou certaines GTPases sont adressées à la membrane grâce à cette modification. Il existe aussi d'autres modifications par addition de groupements lipidiques (farnésylation, géranylation) qui sont importantes pour l'adressage membranaire de protéines.  [...]

[Biologie Cellulaire] Signal de Tri

Un signal de tri est un signal qui permet l'adressage des protéines dans les bons compartiments. A ma connaissance, il existe 2 types de signal. la séquence signal et le signal patch.  [...] Je pense que le SLN est un signal peptide (ou séquence signal) puisqu'il s'agit d'une séquence de quelques acides aminés. De toute façon dès que la protéine doit quitter le cytosol, elle a obligatoirement un signal de tri.  [...]

[Biologie Moléculaire] le clivage d'une proteines

Certaine protéines sont synthétisées avec une extension en Nterminale, qui empeche la protéine d'etre fonctionnelle (on parle de pré-proteine). Une fois ce peptide clivé la protéine deviens active et fonctionnelle.  [...] DAC dac mais bon Yoyo quand j'ai cherché et sur mon poly j'ai trouvé que c'est au niveau de ce N-TERMINALE QU'il ya l a séquence signal du proteine cette séquence la permet de determiner la destination finale du proteine et si on l'élimine le N-TERMINALE euh dans se cas la proteine ne serai pas active eT fonctionelle.  [...]

[Biologie Cellulaire] synthèse de protéine

J'ai compris le début de la synthèse mais à partir du moment où la particule de SRP se fixe sur le site A de la molécule de ribosome ce qui provoque la formation d'un canal afin de laisser passer la protéine dans le réticulum je ne comprends pas ce qui advient de cette molécule de SRP.  [...] Je pense avoir compris que cette protéine signal peptidase va séparer la séquence signal peptidase afin de l'éliminer car son rôle ne serait que de faire entrer la protéine dans le réticulum.  [...]

[Biologie Cellulaire] Trafic intracellulaire

Pour les protéines transmembranaires, tout se passe comme pour une protéine du RE. La synthèse débute, le N-terminal contient une séquence de reconnaissance SRP (Signal Reconnaissance Protein), et en gros, une protéine SRP reconnait cette séquence, stop la synthèse, et amène le ribosome au RE (dans la zone rugueuse, d'où son nom.  [...] elle est napée de ribosomes), la, le ribosome se lit au pore de translocation du RE, qui s'ouvre, faisant partir la protéine SRP, et la synthèse continue. La séquence SRP entre en premier et est coupée par la signal peptidase. Au cours de la synthèse, une autre région, le domaine transmembranaire (hydrophobe) est synthétisée, et reste bloqué dans le pore de translocation.  [...]

[Biochimie] Proteosynthese

Une précision, les protéines nucléaires sont synthétisées dans le cytosol. Elles possèdent une séquence NLS (Nuclear Localization Signal = Séquence de localisation nucléaire) qui est reconnue par les importines, elle-même interagissant avec le nucléopore qui permettra la translocation de la protéine du cytosol vers le noyau.  [...] mais il y a aussi les séquences NES (Nuclear Export Signal = Séquence d'export nucléaire) pour que des protéines nucléaires soient exportées du noyau vers le cytosol.  [...]

[Biologie Cellulaire] Proteine de surface

Pour les protéines membranaires ou sécrétées, lors de la traduction elles sont adressées au RE via la séquence signal présente en N-terminal au niveau du peptide néoformé. La SRP se fixe à cette séquence ce qui adresse le complexe traductionnel au RE où il y a une translocation co-traductionnelle de la protéine.  [...] Selon les séquences présentes dans la protéine, celle-ci aura des régions ancrées dans la membrane ou non. L'alternance de ces régions ou leur absence régit donc l'organisation de la protéine par rapport à la membrane ou sa sécrétion respectivement. Mais certaines protéines sont ancrées dans la membrane via des motifs lipidiques ou glycolipidiques.  [...]