• Forum - Séquence, ADN, Séquençage

définition d'une séquence en biologie

Le mot séquence peut faire référence à séquence protéique, séquence d'ADN (entendez séquence des bases d'ADN puriques ou pyrimidines), séquence d'ARN (l'uracile remplace la thymine dans le séquençage), ou alors séquence au niveau d'un fichier texte contenant la séquence d'une molécule biologique (branche de la bio-informatique).  [...] Merci pour vos réponses je voulais savoir une dernière chose. que se passe t-il pour la séquence du brin droit de l'ADN En quoi elle est différente de l'autre brin.  [...]

les télomers !

Le séquençage de l'ADN télomèrique chez différents espèces montre que la séquence de l'ADN présente aux extrémité des chromosomes est.  [...] relativement bien conservé ce qui est en faveur de son importance fonctionnelle. Dans la plupart des cas l'ADN télomèrique est constitué de courtes séquences répétées en tandem.  [...]

[Génétique] principe des études moléculaires

Pour l'analyse d'une mutation portant sur une région de l'ADN inconnue, on peut prendre une amorce hybridant sur une séquence connue adjacente à cette région. On peut alors utiliser la technique de marche sur le chromosome. on réalise un séquençage qui permet de connaitre une partie de la région inconnue.  [...] Grâce à ce séquençage on peut prendre une nouvelle amorce qui se situe en 3' du séquençage précédent, et refaire un séquençage, et ainsi de suite. On peut ainsi recouvrir toute la région inconnue et donc connaitre sa séquence. Pas de PCR pour cette technique, juste de l'ADN génomique en quantité suffisante pour que ce soit détectable par le séquenceur.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage

Quand on effectue un séquençage à haut débit (NGS) on obtient donc la séquence ADN de tout le génome =. Prise de sang - Extraction ADN génomique - Purification - PCR - NGS.  [...] Si maintenant on veut obtenir toute la séquence ARN d'un organe en particulier, comme le foie, quel est le protocole expérimental =. Biopsie du foie - Extraction ARN - purification - PCR - NGS Si on comparait cette séquence avec la.  [...]

comment fonctionne un séquençage d'ADN ?

Un séquençage se fait sur un seul des deux brins de l'ADN. On fixe le brin à séquencer sur une microbille. Le brin est répliqué jusqu'à avoir plusieurs centaines de copies de ce brin sur la microbille. Ensuite les bases azotées sont présentées à la microbilles les unes après les autres.  [...] Pour l'identification des gènes cela vient après le séquençage. Il est possible de repérer des séquences d'ADN spécifiques aux gènes (séquence d'initiation, séquence de terminaison...).  [...]

Différence entre promoteur et amorce dans la réplication de l'ADN

Pour moi, un promoteur est une séquence d'ADN sur laquelle l'ARNpol va effectivement commencer la lecture de l'ADN et permettre la synthèse d'ARN messager (transcription).  [...] Cependant, le mot amorce peut s'appliquer à l'ARN ou à l'ADN. c'est une petite séquence complémentaire d'un brin (donc d'ADN ou d'ARN). Tu trouves des amorces dans le phénomène de réplication de l'ADN (elles sont synthétisées par une primase). tu utilises des amorces pour faire du séquençage, de la PCR.  [...]

Séquençage de l'ADN

J'étudie actuellement les méthodes de séquençage et de détections de mutations dans l'ADN. Dans la méthode de séquençage par incorporation de didésoxyribonucléotides fluorescents (méthode avec la Taq polymérase), le signal qui signifie une hétérozygotie est lorsque deux nucléotides différents sont incorporés au même endroit (donc que la séquence s'arrête au même endroit mais avec deux didésoxyribonucléotides différents pour chacun des deux brins d'ADN dénaturés du départ) et ceci est synonyme de mutation.  [...] Je comprends bien qu'un mésappariemment est synonyme d'une mutation car il est anormal mais alors que signifie être hétérozygote pour un gène On peut très bien avoir dans notre génome, deux exemplaires différents d'un même gêne sans pour autant qu'il s'agisse de mésappariemments non Je ne comprends plus bien.   [...]

[Génétique] La transcription

il me semble que la séquence que tu donnes n'est pas la séquence consensus, mais l'exemple d'une séquence. par exemple, le spacer N 17 a une longueur qui varie entre 16 et 18, en fait. La séquence TATAAT est bien la séquence consensus, qu'on a déduite des différentes séquence à -10, qui varient légèrement selon l'espèce de bactérie et le gène considéré.  [...] Par séquençage, tout simplement. on sait que le +1 est le premier nucléotide transcrit, et on peut connaître la séquence de l'ARN formé. Ensuite, on séquence l'ADN en amont (i.e. du côté 3') du site +1, et on trouve qu'il y a 2 séquences très conservées, celles situées à -10 et à -35 de ce site +1.  [...]

[Biotechnologie] primer extension

Pour avoir aussi fait les deux, je trouve la primer extension plus rapide. A la place de la radioactivite tu peux marquer les oligos par un fluorophore (type sequencage ADN) et l'envoyer comme une sequence. Tu obtiens la taille de ton produit, et ca t'a pris une heure de manip et un timbre poste.  [...] A la place de la radioactivite tu peux marquer les oligos par un fluorophore (type sequencage ADN) et l'envoyer comme une sequence.  [...]

[Génétique] comment réutiliser les colonnes des kits de purification des produits PCR ???

Pour mon étude phylogénique, je suis en train d'amplifier ma séquence d'intérêt (marqueur COI) pour ensuite la séquencer. Maintenant, j'en suis à l'étape de purification des produits PCR avant le séquençage avec le kit PCR purification kit de promega. Ce kit permet de retenir dans un premier temps l'ADN grâce à un membrane tout étant perméable à tout le reste, puis l'ADN est récupéré lors de l'élution.  [...] On m'a dit qu'il existait un protocole qui permettait de nettoyer les colonnes déjà utilisé afin de pouvoir les réutiliser. si quelqu'un sait comment faire ça me rendrait un grand service parce que je suis en manque de colonnes alors que j'ai pas encore fini tous mes échantillons.   [...]