• Forum - Séquence, ADN, Humain, Génétique, Apparition, Site, Restriction

[Biologie Moléculaire] Polymorphisme génétique

Vous amplifiez une séquence de 300 bases d'ADN humain qui peut contenir un polymorphisme génétique responsable de l'apparition d'un site de restriction en position 50 pour une enzyme E.  [...] Donc, si tu es homozygote pour ces allèles, cela signifiera que les deux seront identiques. Etant donné que tu ne considères qu'un site de restriction par allèle, tu auras 2 sites pour deux allèles identiques.  [...]

exercice de génomique assez complexe..

Soit une séquence d'ADN (bicaténaire) constituée de TCTAGA, site de restriction reconnu par l' endonucléase de restriction XbaI.  [...] Quels seraient les sites de clonage susceptible d'insérer cette séquence d'ADN, parmi les site de clonages suivants, qu'on supposera présents chez un vecteur quelconque.  [...]

[Génétique] Choix amorces amplification portion ADN

- l'enzyme de restriction reconnait une séquence (souvent palindrome ) de l'ADN, s'y fixe, mais sous quelle forme est cette enzyme ( est-ce qu elle doit etre complémentaire du brin d'ADN, ou peut importe sa forme, elle reconnait le site, s'y fixe et ne doit pas s'apparier à l'ADN).  [...] pour l'amorce 1, tu commences par l'extrémité 5' du brin proposé ici, et tu dessines l'amorce en prenant la séquence complémentaire à celle proposée, tu auras donc CTT AGG GAG CCA TTT AAC CA, mais ca ne gene pas le sens de lecture de l'ADN pol qui lit de 3' en 5 ' parce que selon ton amorce, elle vient bien se fixer sur l'amorce mais après son sens de lecture sera de 5' en 3', non.  [...]

[Biologie Moléculaire] polymorphisme de restriction

C'est une séquence de l'ADN qui peut être reconnue par une enzyme de restriction. Les enzymes de restriction sont des protéines capables de reconnaître ces sites et de couper l'ADN à ce niveau. Les sites de restriction ont la particularité d'être des site palyndromiques, c'est-à-dire qu'ils sont les mêmes dans un sens ou dans l'autre.  [...] En lisant cet article, vous comprendrez d'une petite modification de la séquence d'ADN peut faire apparaître ou disparaître un de ces sites de restriction, et que ce phénomène peut être exploité pour détecter ces polymorphismes.  [...]

Enzyme de restriction: petite difficulté avec sa définition

une enzyme de restriction reconnait un site (=une séquence) spécifique sur l'ADN et coupe de chaque coté de ce site. Si le site est à l'extrémité d'un brin d'ADN linéaire, alors elle peut couper.  [...] Ces séquences correspondent à ce qu'on appelle une séquence palindromique (qui se lit de manière identique dans les 2 sens). Cela veut dire que dans un grand flot de bases azotées allant de quelques bases à plusieurs centaines ou plusieurs milliers, dès que l'enzyme trouvera cette séquence enfouis dans le code génétique, elle la coupera de manière cohésive, c'est à dire en scindant le double brin en partant d'en haut à gauche entre le G et le A du 5'-3', fait sauter les liaisons entre les AATT complémentaires des 2 brins et finalement coupe encore entre le A et le G du 3'-5'.  [...]

[Biologie Moléculaire] Choisir le bon vecteur?

la séquence de ton ADN doit être coupée des deux bords avec la même enzyme que tu utilise pour linéariser le vecteur..de plus, ton site de restriction doit être localisé sur un marqueur de séléction.  [...] J'ai moi aussi de la difficulté a trouver un vecteur approprié, Et Je ne comprend pas pourquoi le bon vecteur dans cet exemple serait PinPoint xa-1 Selon ce que j'ai vu il ne possede pas de sites de restriction communs avec la sequence d'ADNc dans sa region du gene de resistance Je ne comprend pas d'ailleurs pk le site de restriction doit se trouver dans la sequence de resistance a l'antibiotique et non ailleurs dans le plasmide.  [...]

[Génétique] taille moyenne fragments de restriction

Je bloque sur une question où l'on me demande de calculer la taille moyenne des fragments de restriction après digestion par ecoR1 (site reconnaissance. GAATTC) de l'adn humain.  [...] Après ça il ne te reste plus qu'a multiplier la fréquence d'apparition de GAATTC par le nombre de paire de bases dans le génome humain pour avoir le nombre de sites théoriques EcoRI dans notre génome. Et vu que tu désires avoir la taille moyenne des fragments, tu n'as plus qu'a diviser la taille du génome par le nombre de séquences EcoRI.  [...]

[Génétique] endonucléases

Une endonucléase de restriction peut elle couper dans un exon.  [...] Bien sur, l'endonucléase ne reconnait que le type (ADN, ARN), l'orientation et la séquence d'un acide nucléique. Les séquences introniques et les exons mais aussi l'ADN non codant ont exactement la même structure et ne diffèrent que par leur rôle. Donc la présence d'un site de restriction suffit.  [...]

[Biologie Moléculaire] Sequence a ajouter avant un site de restriction

Je me lance dans le clonage d'un gène, que je vais amplifier a partir d'ADN génomique de levure (le gène ne contient pas d'intron).  [...] Je ne pense pas qu'il y ait une séquence type, veillez juste à conserver un %GC correct et a ne pas créer de site de restriction qui serait ennuyeux par la suite.  [...]

Besoin que l'on eclaire ma lanterne en Génetique

Est ce que les marqueurs AFLP et RAPD (qui sont bien des marqueurs d'empreintes génetiques ) sont des sortes de marqueurs de types PCR,( comme les microsatellite ou SSR qui eux sont comme la methode RFLP des marqueurs specifique de locus).  [...] Je connais moins bien l'AFLP, mais il me semble que c'est la technique utilisée pour les empreintes ADN humaines (par exemple en criminologie). Elle se base sur la restriction du génome, c'est à dire coupure par des enzymes de restriction. On utilise des enzymes ayant un site de restriction assez rare.  [...]