• Forum - Séquençage, Séquence, Génome

sequencage du genome humain

Le séquençage d'un génome permet de déterminer les séquences (d'ou séquençage) de nucléotides de l'ADN d'un organisme. Les fins de ce séquencage sont diverses selon la personne qui la réalise. Par exemple, il est interessant de connaître la séquence des gènes impliqués dans la division cellulaire, ou dans le développement etc.  [...] Du coup, peu importe l'humain ( sain de préférence, donc sans maladie pouvant affecté son génome ) choisi pour le séquencage. Les différents loci (lieu ou la séquence de ton gène se trouve sur ton chromosome) des différents gènes seront les mêmes chez tous les humains, toute proportion gardée pour les mutants bien entendu.  [...]

[Biologie Moléculaire] suivi génomique d'une souche bactérienne

Je travaille actuellement sur une bactérie (c'est une nouvelle espèce du genre streptomyces) sur laquelle il n'existe pas (ou peu…) de séquences connues, ni banque….  [...] J'ai juste la séquence d'ADN 16S je souhaiterais à présent connaitre une séquence génomique qui lui est spécifique pour pouvoir suivre dans le sol, mais je bloque, avez-vous quelque chose pour me faire avancer.  [...]

Différence entre race et espèce

Je ne pense pas que des études globales aient été menées. c'est toujours délicat de faire ce genre de comparaison. D'une part, le séquençage du génome humain provient du mélange de l'ADN de plusieurs individus donc on n'a pas la séquence entière du génome d'un individu.  [...] Evidemment l'exemple ci-dessus est simple, mais quand les séquences ne correspondent pas du tout, sauf de temps en temps, l'aligment devient complètement farfelu. il est toutjours possible de mettre un a en face d'un a en ajoutant suffisament de trous.  [...]

[Microbiologie] séquençage de génome bacterien

j'ai lu dans des articles scientifiques,que la localisation chromosomique d'un gène de résistance chez une bactérie doit être confirmé par un sequençage complet de génome de cette souche. Pourrai-je savoir pourquoi \comment je pourrais savoir sa localisation à l'aide de la séquence complété de gènome de cette souche.  [...] Ben a partir du moment ou tu as une liste de tous les gènes, il devient possible d'identifier celui qui est à l'origine de la résistance.   [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage

Quand on effectue un séquençage à haut débit (NGS) on obtient donc la séquence ADN de tout le génome =. Prise de sang - Extraction ADN génomique - Purification - PCR - NGS.  [...] Quand on fait un Whole Exome sequencing, on s'interesse à 2% du génome, la région codante. Qu'est ce qui change dans le protocole expérimental pour isoler cet ensemble de régions =. Un choix d'amorces PCR spécifique pour exons.  [...]

Génome, différences et similitudes des individus

Si on considère 2 être humains différents, ils ont exactement le même génome à 99,9% c'est à dire qu'ils possèdent la même séquence concensus (les mêmes gènes positionnés aux mêmes endroits sur le génome). Mais ce qui nous rend tous différents entre nous, ce sont les 0,1% restant.  [...] Le séquençage du génome permet de connaitre l'agencement des gènes et la séquence complète. Mais ce qui est interessant c'est son annotation, c'est à dire la localisation précise de chaque gène ainsi que la détermination de sa fonction biologique.  [...]

Stockages par L'ADN

Les chercheurs sont ainsi parvenus à mettre au point une méthode pour inscrire un code binaire sur un polymère synthétique. Plutôt que de se servir des quatre bases azotées de l'ADN, les chercheurs ont utilisé trois monomères. Deux de ces monomères représentent les chiffres 0 et 1 du langage binaire et peuvent être utilisés de manière interchangeable au cours de la synthèse.   [...] Un troisième monomère de type nitroxide est intercalé entre les bits afin de faciliter l'écriture et la lecture de la séquence codée, détaille un document diffusé par le CNRS. Ils ont également développé une méthode de lecture qui s'inspire des méthodes de séquençage du génome.  [...]

[Génétique] Localisation d'un gène

Est-ce qu'on utilise des microsatellites ou des SNPs pour localiser le gène muté Est-ce qu'il faut séquencer le génome entier des parents et de l'enfant malade (analyse de trio) Et si on séquence on ne peut pas utiliser les microsatellites car comme ce sont des séquences répétées le séquençage ne sera pas bon (dîtes moi si je fais fausse route, ça ne m'étonnerais qu'à moitié...).  [...] Les deux techniques permettent donc de réduire la zone du génome dans laquelle on pense que se situe la mutation. Pour la préciser encore soit on densifie la carte en marqueurs, soit tout simplement on séquence la zone pour trouver la mutation (les coups de séquençage ont beaucoup baissés, ça devient possible sur quelques mégabases sans exploser le budget).  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome

Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome.  [...] Je me permets de vous écrire car je souhaiterais savoir quelles sont les différences en termes de méthodes, d'étapes et d'appareils utilisés entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome s'il-vous-plaît. Je me pose cette question dans le cadre de l'accréditation selon la norme ISO 15189 des plateformes de séquençage.  [...]

[Biologie Moléculaire] transcriptase inverse

Bonjour, j'étudie la génie génétique qui reste encore très flou pour moi. La notion de transcriptase inverse indique donc qu'on prend un ARN connu, qui va devenir en ADNc qui va pouvoir s'hybrider avec la séquence d'ADN qu'on cherche.  [...] Peut-être que vous avez confondu 'hybridation avec alignement, ou alors je ne connais pas cette technique. Si vous faites allusion au RNA-seq, une fois que l'on a obtenu le premier ADNc, il est fragmenté, des adaptateurs pour amorces de PCR et de séquençage sont ligués aux extrémités, puis il est séquencé et aligné sur le génome de référence.  [...]