• Forum - Reconnaissance, Enzyme, Substrat

[Biochimie] Site catalytique et site de reconnaissance d'une enzyme

En sachant que le site de reconnaissance de l'enzyme correspond à la région qui permet la liaison au substrat alors que le site actif correspond au site catalytique peut-on considérer que le site actif et le site de reconnaissance sont confondus Ou bien le site actif est-il une partie du site de reconnaissance comme j'ai pu le lire sur certains articles.  [...] le site actif est composé d'un site de liaison (ou reconnaissance) (reconnaissance de la complémentarité de forme avec un substrat spécifique à l'enzyme) et le site catalytique (transformation du substrat en produit).  [...]

Les enzymes?

Une enzyme produit 1000 réactions par seconde. Elle a une double spécificité. elle agit que sur un substrat donné et ne produit qu'une action (par exemple l'amylase ne fait qu'hydrolyser une réaction et n'agit que sur l'amidon.) Elle est constituée d'un site catalytique et d'un site de reconnaissance qui lui permette de faire son métier.  [...] Les enzymes etant des molécules biologiques il faut tenir compte de la stéréospécificité. Le D-glucose peut etre un substrat d'une enzyme mais elle ne reconnaitra pas le L-glucose. Donc spécificité devant la géométrie dans l'espace du substrat ( reconnaissance spatiale du substrat ).  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

par exemple, dans le cas d'une hydrolyse enzymatique, la charge négatif du carboxylate (ça ne marche pas avec la forme acide dans ce cas là) pourra intéragir par liaison hydrogène avec l'hydrogène de l'eau et augmentera la capacité de l'eau à hydrolyser le substrat (caractére nucléophile de l'eau augmente, mais là c'est des termes de chimiste).  [...] Comme le soulignait Novocaine, cela doit également jouer sur la structure tridimensionelle de l'enzyme et donc la capacité à fixer le substrat mais également sur la catalyse enzymatique elle meme. Dans le cas de la température, je sais pas trop, mais l'augmentation de la température devrait augmenter l'agitation et donc augmenter la constante d'association et par conséquent la vitesse.  [...]

[Biochimie] Réaction enzymatique

bonjour, eske kelkun pourais me donner la définition d'un reaction enzymatique, je ne suis pas sur de la mienne. Merci.  [...] la réaction durant laquelle l'enzyme transforme le substrat en produit grâce à l'action du site de reconnaissance et le site catalytique. La vitesse se mesure en nombre de molécules de substrat transformées par molécule d'enzyme et par unité de temps.  [...]

DNAses, pourquoi spécifique aux ADN?

je sais que les DNAses coupent l'ADN au niveau des liaisons phosphodiesters, cependant les ARN sont aussi, dans leur structure primaire, une suite d'acides nucléiques liés entre eux par des liaisons phosphodiesters. Comment la DNAse (en générale) fait-elle pour être spécifique à l'ADN.   [...] les enzymes ont une spécificité de substrat, en l'occurence l'ADN, tout comme la glucose oxydase oxyde le glucose et pas ses isomères ou comme la pyruvate deshydrogénase kinase phosphoryle la pyruvate deshydrogénase et pas autre chose. C'est rendu possible par la reconnaissance par l'enzyme de son substrat, elle même liée a une conformation spécifique de l'enzyme qui permet ou non la formation du complexe enzyme substrat PUIS le déroulement de la réaction.  [...]

[Microbiologie] enzymes

Une enzyme est une protéine qui est synthétisée dans la cellule à partir de ton code génétique (ADN). C'est donc une biomolécule. Ensuite, son activité est soumise à différents facteurs dont la temperature et le pH. Dans ton corps, cette enzyme est adaptée au pH et à la température.  [...] Ensuite, une enzyme est spécifique à un substrat, elle ne catalyse qu'une seule réaction chimique par la reconnaissance de son substrat. Par exemple, ton amylase salivaire va degrader les polymeres glucidiques (tu as du faire le test avec de l'empois d'amidon non).  [...]

site catalytique = site actif ???

Mais il existe aussi des sites regulateurs qui vont modifier l'activité de l'enzyme en fonction de divers parametres tels que la fixation d'un effecteur, ou une modification post-traductionnelle (phosphorylation).  [...] Dans le site actif d'une enzyme, on intègre deux choses le site de liaison au substrat (la reconnaissance), et le site catalytique responsable de la fonction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Recherche site pour calcul proba d'interaction entre protéines

Donc je pense que le site que tu recherches ne décrivait pas les interactions entre tout type de protéines, mais qu'il devait se focaliser sur certaines interactions bien précises de type reconnaissance enzyme/susbtrat, comme par exemple kinase/protéine à phosphoryler, protéase/protéine à cliver, ou bien des reconnaissances d'interaction de domaines connues WW ou SH3 avec région riche en proline.  [...] Oui c'est bien une étude de reconnaissance de type enzyme-substrat que je mène. Si tu as un site interessant à me conseiller, je te remercie d'avance.  [...]

Mutations silencieuses

Des séquences exoniques ou introniques de 5 à 10 nucléotides, appelées séquences régulatrices de l'épissage, jouent un rôle important dans la reconnaissance des sites d'épissage par le spliceosome. Ces séquences, qui peuvent être proches ou éloignées des sites d'épissage qu'elles contrôlent, sont reconnues par des protéines appelées facteurs d'épissage qui aident au recrutement local du spliceosome ou au contraire empêchent ce recrutement (rôle enhancer ou silencer ).  [...] Comme l'a dit Yoyo, un remplacement d'un acide aminé par un autre ayant des propriétés physico-chimiques similaires est la plupart du temps silencieux, par exemple Ile par Leu, silencieux en ce qui concerne le repliement de la protéine. Mais cette même mutation peut vachement affecter l'activité de la protéine si elle se trouve, par exemple, dans le site de reconnaissance du substrat d'une enzyme.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fonctionnement des enzymes

Je sais qu'elle a un site de reconnaissance et un site actif, que les enzymes sont classées d'une part, d'après la réaction qu'elles catalysent (une hydrolase, polymérase et synthétase, d'autre part, d'après le substrat qu'elles transforment, mais sincèrement je ne sais pas du tout comment le prouver.  [...] Une fois que l'on tient l'enzyme on pourra tester plusieurs substrats proches de X histoire d'étudier la spécificité de substrat. Apparait-il des produits de réduction Avec quelle efficacité).  [...]