• Forum - Ratio, Acides, Séquence

Séquençage de l'ADN

Après, c'est une question de ratio entre ces deux types de nucleotides. A chaque nucleotide, la polymerase a beaucoup plus de chance de piocher un dNTP qu'un ddNTP puisque les premiers sont en excès par rapport aux seconds. Mais de temps en temps elle pioche le ddNTP et la réaction s'arrête.  [...] Au final ce ratio en faveur des dNTP permet d'obtenir des acides nucléiques de toutes les longueurs et ainsi on peut retrouver la séquence de la matrice.  [...]

[Biochimie] Protéine hydrophile ou hydrophobe ?

Je cherche à déterminer si ma protéine est hydrophile ou hydrophobe à partir de sa séquence en acides aminés et de sa charge globale.  [...] Je connais la séquence d'un dimère mais je ne sais pas quels aa sont dans l'hélice, quels aa sont dans le feuillet... Selon moi je ne peux pas le deviner, je n'ai qu'une illustration modélisant la structure tertiaire avec de représentés les hélices et feuillets, mais pas d'infos sur leur compositions respectives en aa.  [...]

Huile De Palme = Danger Pour La Sante, Cauchemar Ecologique - Page 2

Le poisson d'élevage tend à présenter des concentrations de lipides totaux plus élevées avec des proportions moindres d'acides gras poly-insaturés de type oméga-3 par rapport au poisson sauvage. Globalement, ces différences aboutissent au fait que la quantité d'AGP-LC n-3(Acide gras poly-insaturé à longue chaîne avec la double liaison en position 3) par portion de poisson est similaire.  [...] Le rapport oméga/oméga3 est indépendant la quantité d'acides gras saturés consommée. Une forte consommation d'acides gras saturés et d'oméga 3 est sans doute bien plus protectrice pour le système cardio-vasculaire qu'une consommation fort réduite de graisse saturée alliée avec un ratio oméga6/oméga3 trop important.  [...]

[Biochimie] Dosage spectrophotométrique des protéines

Vous avez aussi le dosage par Warburg et Christian. Il permet la séparation des acides nucléiques et protéines selon un ratio propre à la méthode.  [...] J'ajoute que Warburg et Christian nécessite deux spectros. une à 260 et une à 280 nm. (question de domaine d'absorbance des acides nucléiques à 260 et des a.a aromatiques à 280.).  [...]

[Biologie Cellulaire] Question acides gras insaturés

À mon avis le poisson de l'antarctique a une haute concentration en Oméga-3 qui font parti des acides gras insaturés. Par contre, j'ai lu sur un site que les membranes des cellules des organismes qui hibernent ont un plus haute concentration en acides gras insaturés que les non-hibernant.  [...] Alors...un ratio élevé (acides gras insaturés/A.G saturés) permet de de conserver une fluidité membranaire malgré des températures assez basses. L'inverse sera observé chez des organismes thermophiles...de fait, il s'agit probablement de l'organisme exposé aux températures les plus basses dans ta liste qui aura une composition membranaire riche en acides gras insaturés. la (a) d'après moi.  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage par PCR taille des amorces

Une question simple. j'aimerais cloner un gène dans un vecteur pENTR. J'ai la séquence codante de ce gène dans un autre plasmide, je compte donc l'amplifier par PCR en rajoutant des sites de restrictions en 5' et 3' qui me permettront ensuite de le mettre facilement dans mon pENTR d'intérêt.  [...] En général les oligos font 20-30pb et on essaye d'avoir un ratio équilibré entre les G+C et les A+T (dans ces conditions, une PCR aux température d'hybdridation classiques 51-58°C doit fonctionner). La restriction coupe ton ADN proprement, pas besoin d'ajouter des bases pour protéger ta séquence codante.  [...]

[Biologie Moléculaire] DNAse est elle essentielle à l'extraction d'ARN (pour qPCR)

Pour la nécessité de la DNAse, ça n'est pas nécessaire avec le trizol et encore moins si les primers sont bien designés. Un contrôle négatif de RT avec chaque couple est suffisant pour la plupart des situations.   [...] Le nanodrop est un spectro qui va distinguer les acides nucléiques (ARN + ADN) des protéines. Le fait que les rapports soient bons ne vous renseigne pas sur le ratio ARN/ADN. Ne prenez pas cela comme une référence de pureté de vos ARN.  [...]

relation du pourcentage G+C avec la Tm

Il indique simplement la relation entre l'absorbance relative d'un faisceau monochromatique de 260 nm et la température de fusion Tm. En fait, la température de fusion est la température à laquelle les deux brins de ton duplex d'ADN se séparent, et les acides nucléiques ont un pic d'absorbance pour la lumière UV à 260 nm.  [...] A la valeur de Tm, tu as en fait autant d'ADN en duplex que dissocié (ratio 1.1). En fait, la valeur de Tm est un indice de stabilité thermique qui va varier en fonction de la composition de ta séquence, mais aussi du nombre de bases. En fait, à mesure que tes duplex ADN vont se dissocier en brins individuels, l'absorbance optique de ton milieu va augmenter.  [...]

[Biologie Moléculaire] extraction d'ADN

pour faire la quantification, j'ai préparé des dilution puis j'ai lu la, densité optique.En utilisant l'équation cité précédemment j'ai pu calculé la concentration.  [...] Et tant qu'on y est sur les précisions, il est exact que le pic d'absorption des acides nucléiques, aussi bien ADN que ARN, est à la longueur d'onde 260nm, mais les protéines absorbent aussi à 260nm même si leur pic est à 280nm. C'est la raison pour laquelle on mesure les deux et que le ratio doit être proche de 2 pour indiquer une bonne pureté en protéines.  [...]

[Biotechnologie] Ogm absorption

Il s'agit d'organisme génétiquement modifiés donc on a modifié la séquence nucléotidique, après transc/traduction on a donc une autre séquence en acide aminés et donc une protéine différente.  [...] Je ne pense pas que le problème viennent d'un ratio d'acides aminés. Je doute que quelques protéines supplémentaires aient un quelconque eeffet (en revanche on a aucun moyen de tester la structure tridimensionnelle de la protéine issu du transgène se pose alors le problème d'un potentiel prion).  [...]