• Forum - Protéines, Groupements, Liaisons

[Biologie Moléculaire] structure secondaire de l'adn

Merci pour cette réponse mais je comprend pas ce que signifie cet espece de boulier avec les accepteurs et donneur de liaison H, atome H et groupement méthtyle c'est le seul truc que j'ai dans mon cours qui parle des sillons.  [...] Les protéines devant intéragir avec l'ADN se dirigent principalement vers les grands sillons (mais peuvent aussi atteindre les petits) et créent des liaisons hydrogènes à partir des groupements donneurs et receveurs de liaison H sur les bases.  [...]

acides aminés, classification par radical R?

Donc les acides aminés possèdent les propriétés chimiques de leur radical, particulièrement lorsqu'ils formes les protéines puisque les groupements COOH et NH2 sont mobilisés presques entièrement dans les liaisons peptidiques. Ces propriétés pouvant être influencées par l'environnement puisque les charges vont varier selon le pH par exemple.  [...] cependant, je bute quelque peu sur les aliphatiques, car dans mon cours de biochimie, il se trouve, que c'est eux qui regroupent les hydroxylés, les soufrés, diacides, dibasiques et tout, et qu'ils n'étaient pas cyclique (contrairement a la définition des wikipedia). donc quelle est la définition des aliphatique.   [...]

[Biochimie] Activité alcool déshydrogénase

lors de ma manipulation, j'ai mit dans un tube du tampon glycine, de l'alcool déshydrogénase, de l'éthanol et de l'acide sulfurique.Le tout a incubé pendant 2H à 30°C puis j'ai ajouté le cofacteur NAD+. Par mesure par spectrophotométrie j'ai pu déterminer que j'avais une baisse de l'activité de l'enzyme (par rapport à une expérience précédente sans H2SO4). Moins de NADH a été formé.   [...] Je sais que la présence de groupement thiol -SH au sein de la protéine est importante pour son activité, donc est-ce que malgré que l'on soit dans du tampon, H2SO4 agirait sur ces groupements En établissant des liaisons hydrogène ou en établissant des ponts disulfures par exemple.  [...]

activité enzymatique : concentration en sels

Comme les enzymes sont des proteines elles sont soumisent aux phénomes de salting-in ou out. Ces phénomènes sont utilisés afin de précipité des protéines en laboratoire. Une forte concentration en sel peut faire précipité ta protéine et de ce fait lui faire perdre toute activité.  [...] Cela est du au fait que les sels stabilisent les charges des groupements R des acides aminés. Si notre protéine est alors une enzyme, elle peut utilisée ses charges por faire des liaisons ioniques ou des transferts d'hydrogènes tel que l'ARNase qui part diverses echange de protons entre deux histidines arrive à digéré l'ARN.  [...]

[Biologie Cellulaire] Nucléole, reticulum endoplasmique, appareil de Golgi

L'appareil de golgi permet la modification post traductionnelle des proteines en leur ajoutants différents groupements (dont les polyssaccharides).  [...] L'appareil de golgi permet la modification post traductionnelle des proteines en leur ajoutants différents groupements.  [...]

[Biologie Cellulaire] relation entre la O gycosilation et les lysosomes !!

il y aura phosphorilation qui se font sur les glycides de types mannose qui sert a envoyé les proteines vers les lysosomes en passant par les endosomes.(formartion des groupements M6P sur les proteines destinés vers les lysosomes).  [...] la membrane de l'appareil de gogli contient des recepteurs M6P qui reconnaissent les groupements M6P des proteines destinés vers le lysosome.  [...]

[Biologie Moléculaire] Dosage de l'ADN

C- Sachant que la DO de cette même solution mesurée à la longueur d'onde de 280nm est de 0.230, on peut considérer que cette solution n'est pas signifiquement contaminée par des protéines =. je ne sais pas.  [...] Les liaisons entre les bases sont des liaisons H lorsqu'on parle d'une double helice. Or, ici, je t'ai (volontairement mal) pose la question concernant un brin d'ADN. Tu etais donc cense me corriger en me disant que les bases ne sont pas liees entre elles au sein du brin, mais plutot les liaisons se font entre les groupements phosphate et les desoxyriboses.  [...]

Biochimie S.O.S :(

Dans ce cas ci, il augmente. On poursuit le raisonnement. l'AMPc augmentant, il active des protéines kinases dépendantes de l'AMPc (PKA). La protéine kinase est une protéine effectrice à activité kinase, c'est à dire qu'il s'agit d'une enzyme qui agence des groupements phosphates à d'autres protéines.  [...] Les groupements phosphates agissent comme des interrupteurs on et off de ces protéines. Par une cascade de réaction et d'activation ou d'inactivation, il en résulte que le glucagon a déclenché une glycogénolyse avec libération de glucose dans le sang, et a diminué son utilisation par la cellule comme substrat énergétique. c'est une hormone hyperglycémiante.  [...]

[Biochimie] Enzymologie hétérogène

Je viens de faire un TP afin d'étudier la glucose oxydase (GOD) immobilisée. Je fais la cinétique enzymatique de la GOD à forte et à faible agitation. Parallelement, je fais la cinétique enzymatique de la GOD en solution. Ma question concerne l'analyse de mes résultats.   [...] Effectivement, il y a plein d'analyses qu'on peut faire par la suite. La stabilité de l'enzyme a été effectivement étudiée. elle n'est pas changée. L'immobilisation est faite sur les 2 surfaces d'une membrane (forme de disque) par liaisons covalentes des groupements amines de l'enzyme avec des groupements aldéhydes du support.  [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Merci de ta réponse, en fait il s'agit de liaisons hydrogènes (j'ai oublié de le préciser) et du coup c'est bien des liaisons qui se forment entre des acides aminés polaires (présentant des groupements OH (H donneur, O accepteur) NH (N accepteur, H donneur) c=O (accepteur) N (accepteur)).  [...] Le groupement S-H n'est pas réellement capable de réaliser une liaison H car considéré comme apolaire. En réalité cette liaison est faiblement polaire, mais suffisamment peu pour qu'on considère les charges partielles nulles (selon l'échelle de Pauling. H.  [...]